岩塩試料に残された生物学的痕跡

岩盐样品中留下的生物痕迹

• 批准号: 08228208
• 负责人: 井原 邦夫
• 金额: $ 0.58万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-08228208/
• 关键词: 古細菌; 好塩菌; 岩塩; シトクロームオキシダーゼ

本年度も、生物試料として十分な岩塩の収集ができなかった。そこで、重点領域研究の班員、班友から提供された岩塩試料を用いて、高度好塩性古細菌の培養を試みると同時に、地球上の酸素発生と非常に関係深い酵素のひとつであるシトクロームオキシダーゼについて、現存する好塩菌の酵素/遺伝子を調べた。シトクロームオキシダーゼに良く保存されているヘム結合領域を用いてプライマーを設計し、PCR法により約400塩基対のDNA断片の増幅を試みた。現存する8属、12種類の高度好塩性古細菌のゲノムDNAを鋳型として試みたところ、すべての好塩菌から期待されるサイズのDNA断片の増幅が確認できた。塩基配列を決定し、アミノ酸配列を推定して、分子系統樹を描いたところ、好塩性古細菌には、(1)遺伝子重複により生じたと思われる2種類のタイプのシトクロームオキシダーゼ遺伝子(便宜上M型、A型と呼ぶ)が存在し、(2)その重複点が、古細菌の中でも好塩菌に分岐後にあることが推定できた。また、ある菌株では、もう一度遺伝子重複が起こっていることが確認できた。この遺伝子重複を進化上での重要なイベントとして位置付け、古い岩塩から回復できた好塩性古細菌の遺伝子を調べ、その生物の進化上での位置付け(遺伝子重複以前の生物か、後の生物か)を明らかにする可能性が生じた。最近、幾つかの岩塩試料からの培養で、菌体の増殖が確認できたので、今後これらの菌体の性質を調べると同時に、シトクロームオキシダーゼを指標とした分子進化的検証を行っていく予定である。

This year, the biological samples were collected and collected. In addition, the team members and team members of key research areas provide research on the use of rock samples, the cultivation of highly pathogenic archaea, and the regulation of enzymes/genes of existing pathogenic bacteria. The DNA fragments were designed and amplified by PCR. The essential DNA of the existing 8 genera and 12 species of highly pathogenic archaea has been typed and tested, and the increase in DNA fragments expected from the pathogenic archaea has been confirmed. The nucleotide sequence is determined, the nucleotide sequence is estimated, the phylogenetic tree is described, and the phylogenetic tree is constructed. The phylogenetic tree is constructed.また、ある菌株では、もう一度遗伝子重复が起こっていることが确认できた。This gene duplication is an important event in evolution, a possible event in the evolution of organisms, and a possible event in the evolution of organisms. Recently, several rock samples have been cultured, and the growth of bacteria has been confirmed. In the future, the properties of bacteria have been adjusted, and the indicators for molecular evolution have been determined.

项目成果

Kunio Ihara: "Haloarcula argentinensis sp.nov. and Haloarula mukohataei sp.nov.,Two new species of extremely halophilic archaea collected in Argentina." International Journal of Systematic Bacteriology. 47. 73-77 (1997)

Kunio Ihara：“Haloarcula argentinensis sp.nov. 和 Haloarula mukohataei sp.nov.，在阿根廷收集的两种极端嗜盐古菌新种。”

Tomomi Kitajima: "Novel Bacterial Rhodopsins from Haloarcula vallismortis" Biochemical and Biophysical Research Communications. 220. 341-345 (1996)

Tomomi Kitajima：“来自 Haloarcula vallismortis 的新型细菌视紫红质”生物化学和生物物理研究通讯。