RNA結合ドメインの3回繰り返し構造を持つタンパク質におけるドメイン構造の進化

具有三重 RNA 结合结构域重复的蛋白质结构域结构的演变

• 批准号: 07740582
• 负责人: 小林 薫
• 金额: $ 0.64万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1995
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1995 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-07740582/
• 关键词: 分子進化; タンパク質ドメイン; RNA結合ドメイン; 系統樹

RNAと結合・相互作用するタンパク質の多くが、RNA結合ドメインと呼ばれる共通のアミノ酸配列を、しばしば繰り返し配列として持つ。本研究の代表者(小林薫 通称 深海薫)により既に、RNA結合タンパク質が持つRNA結合ドメインの1、2、4回繰り返し構造の確率時期が、タンパク質の機能の確立時期と非常によい対応を示すことが明らかにされている。本研究はRNA結合ドメインを3回繰り返して持つタンパク質において、ドメイン構造のレベルでのタンパク質進化の道筋を明らかにすることが目的で行われた。まず、RNA結合ドメインを3回繰り返して持っているタンパク質のアミノ酸配列を、配列データベース・文献から集めた。集められたタンパク質には、発現パターンに組織特異性や発生段階特異性を示すものが多かった。以前解析を行った、RNA結合ドメインを1、2、4、回繰り返して持っているタンパク質が、主として細胞内に恒常的に存在するものであったのに対し、大きく異なる結果を得た。次に、集められたタンパク質のRNA結合ドメインから系統樹を作成した。得られた系統関係から、解析に用いたタンパク質のRNA結合ドメイン3回繰り返し構造は、3回繰り返し構造を持っていた一祖先タンパク質に由来することがわかった。また3つのRNA結合ドメインのうち、N端側から数えて1番目・2番目のドメイン間の分岐時期より、それらと3番目のドメインとの間の分岐時期がはるかに古いこともわかった。RNA結合ドメインを4回繰り返して持っているタンパク質ではドメイン間の分岐時期がほぼ同じであったのと比べ、この点でも今までの解析では得られなかった新たな結果を得た。

The combination of RNA and the interaction between the two systems, the combination of the RNA and the interaction, and the combination of the RNA and the interaction, the interaction. In this study, the representative (Kobayashi Kobayashi commonly known as the Deepwater Deepwater) is responsible for the use of existing, RNA and RNA systems in combination with cycles 1, 2, and 4 cycles. It is very important to make sure that the time period is accurate. In this study, RNA was used to improve the quality of the system. In this study, the results of this study were reviewed in this study. The purpose of this study is to improve the performance of the system. In this paper, the combination of RNA and computer is used to analyze the distribution of acid and the collection of literature. In this case, you will be able to organize special information about the birth of the child, and the special information will be shown in this section. In the previous analysis, we used to analyze the results of the previous analysis of the results of the RNA combined with the data 1, 2, 4, the results of the previous analysis, the For the second time, the whole system has been built by combining the RNA with the system of the system. The purpose of this paper is to improve the system performance, to analyze the origin of the system, the combination of the RNA and the three cycles, and the origin of the ancestral system. The combination of 3-year RNA and the number of times in the N-terminal, the number of times, the times, the times. RNA is used to compare the difference between the time period and the time period, and the results of the current analysis are satisfactory.