固体高分解能NMR分光法による人工生体膜中ペプチドの精密立体構造解析
固体高分解能NMR分光法による人工生体膜中ペプチドの精密立体構造解析
批准号:
08640652
负责人:
内藤 晶
金额:
$1.41万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
1996
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1996 至 --
中文摘要
本研究では原子間距離を精密に測定する回転エコー二重共鳴法(REDOR)の手法を用いて、固体状態および生体膜中でのペプチドの立体構造を精密に決定する方法論の確立と応用を目的として研究を行った。1.立体構造を決定する対象として鎮痛作用のある5量体オピオイドペプチドであるLeu-エンケファリンを選んだ。まず、隣り合うペプチド面に位置するアミド窒素とカルボニル炭素をそれぞれ安定同位体^<15>Nと^<13>Cで二重標識したペプチドを6種類化学合成し、さらに結晶化した。次に、合成した各ペプチドの二重標識位置の原子間距離を精密に測定し二面体角情報に変換した。その結果から、Leu-エンケファリンについては、N末端とC末端付近はextended構造であり、分子の中心付近で折れ曲がった構造をとっていることが判明した。この構造はこれまでにX線回折の研究から得られている構造と違った構造であることが分かった。2.エンケファリンと同様にオピオイドペプチドであるが、その活性がエンケファリンの100倍も強いダイノルフィンをリン脂質二重膜に取り込み、膜中での立体構造を、ペプチドに標識した^<13>Cの化学シフト値から決定した。その結果、生体膜中でダイノルフィンは少なくともC末端から12番目のLeuまでのα-ヘリックス構造をとっていることが判明した。さらに、^<31>P NMRを測定した結果、ダイノルフィン分子は生体膜の相転移点付近で生体膜を可逆的に細分化したり、融合する性質のあることが判明した。さらに精密な立体構造を決定するため、二重標識ダイノルフィンを化学合成し、REDOR法を適用して、膜中の立体構造を決定する計画である。
英文摘要
本研究では原子間距離を精密に測定する回転エコー二重共鳴法(REDOR)の手法を用いて、固体状態および生体膜中でのペプチドの立体構造を精密に決定する方法論の確立と応用を目的として研究を行った。1.立体構造を決定する対象として鎮痛作用のある5量体オピオイドペプチドであるLeu-エンケファリンを選んだ。まず、隣り合うペプチド面に位置するアミド窒素とカルボニル炭素をそれぞれ安定同位体^<15>Nと^<13>Cで二重標識したペプチドを6種類化学合成し、さらに結晶化した。次に、合成した各ペプチドの二重標識位置の原子間距離を精密に測定し二面体角情報に変換した。その結果から、Leu-エンケファリンについては、N末端とC末端付近はextended構造であり、分子の中心付近で折れ曲がった構造をとっていることが判明した。この構造はこれまでにX線回折の研究から得られている構造と違った構造であることが分かった。2.エンケファリンと同様にオピオイドペプチドであるが、その活性がエンケファリンの100倍も強いダイノルフィンをリン脂質二重膜に取り込み、膜中での立体構造を、ペプチドに標識した^<13>Cの化学シフト値から決定した。その結果、生体膜中でダイノルフィンは少なくともC末端から12番目のLeuまでのα-ヘリックス構造をとっていることが判明した。さらに、^<31>P NMRを測定した結果、ダイノルフィン分子は生体膜の相転移点付近で生体膜を可逆的に細分化したり、融合する性質のあることが判明した。さらに精密な立体構造を決定するため、二重標識ダイノルフィンを化学合成し、REDOR法を適用して、膜中の立体構造を決定する計画である。
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Akira Naito: "Deternination of the three-dimensional structure of a new crystalline form of N-acetyl-Pro-Gly-Phe as revealed by ^<13>C REDOR, X-ray diffraction, and molecular dynamics calculation" J. Phys. Chem.100. 14995-15004 (1996)
Akira Naito:“通过 ^13C REDOR、X 射线衍射和分子动力学计算揭示了 N-乙酰基-Pro-Gly-Phe 新晶型的三维结构的确定”J. Phys。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Akira Naito: "State-correlated two-dimensional NMR spectroscopy : Separation of local dipolar fields of protons in nematic phase of 4′-methoxybenzylidene-4-acetoxyaniline" J. Chem. Phys.105. 4504-4510 (1996)
Akira Naito:“状态相关二维核磁共振波谱:4-甲氧基亚苄基-4-乙酰氧基苯胺向列相中质子的局部偶极场的分离”J. Chem.105(1996)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Misako Aida: "Molecular dynamics simulations of a simple tripeptide, N-acetyl-Pro-Gly-Phe in the crystalline state : distinction of the β-turn type I from the type II form" J. Mol. Struct.388. 187-200 (1966)
Misako Aida:“结晶状态下的简单三肽 N-乙酰基-Pro-Gly-Phe 的分子动力学模拟:I 型 β 转角与 II 型β 转角的区别”J. Mol. 187-。 200 (1966)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Satoru Tuzi: "Conformation and dynamics of [3-^<13>C] Ala-labeled bacteriorhodopsin and bacterioopsin, induced by interaction with retinal and its analogs, as studied by ^<13>C nuclear magnetic resonance" Biochemistry. 23. 7520-7527 (1996)
Satoru Tuzi:“通过与视网膜及其类似物相互作用诱导的[3-^ 13 C] Ala标记的细菌视紫红质和细菌视紫红质的构象和动力学,通过^ 13 C核磁共振进行研究”生物化学。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
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通讯作者:
Atsuo Tamura: "Dynamics of the three methioyl side chains of Steptomyces subtilisin inhibitor. Deuterium NMR studies in solution and in the solid state" Protein Science. 5. 127-139 (1996)
Atsuo Tamura:“Steptomyces 枯草杆菌蛋白酶抑制剂的三个甲硫酰基侧链的动力学。溶液和固态中的氘核磁共振研究”蛋白质科学。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
共 6 条
固体NMRによる膜生体分子の動的膜結合構造と膜相互作用解析法の開発
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批准号:19036006
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.78万
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财政年份:2007
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
異方的磁気相互作用を利用した膜結合生理活性分子と生体膜との相互作用解析
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批准号:17048010
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2005
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
異方的磁気相互作用を利用した膜結合生理活性ペプチド構造解析法の開発
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批准号:13024263
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2001
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
自発的磁場配向膜中生理活性ペプチドの高分解能構造解析法の開発
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批准号:12034217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2000
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
自発的磁場配向膜を用いた膜機能性生体分子の精密立体構造解析
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批准号:11440208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$5.82万
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财政年份:1999
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
磁場配向ニ重膜中生理活性ペプチドの動的構造解析法の開発
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批准号:11160217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1999
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
磁場配向二重膜を用いた生体膜中ペプチドの立体構造解析法の開発
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批准号:10179217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
固体高分解能NMR分光法によるペプチドの結晶中における静的および動的構造解折
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批准号:06640665
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1994
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
状態相関二次元NMR分光法による光記憶型液晶の動的構造の解明
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批准号:05640575
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1993
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
シクロデキストリンの金属錯体包接化合物における構造と動的挙動に関する研究
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批准号:61740249
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1986
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
海外基金