固体NMRによる膜生体分子の動的膜結合構造と膜相互作用解析法の開発
固体NMRによる膜生体分子の動的膜結合構造と膜相互作用解析法の開発
批准号:
19036006
负责人:
内藤 晶
金额:
$3.78万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008
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アラメチシンは20残基からなる直鎖状ペプチドで、細菌trichoderma virideから得られる抗菌ペプチドである。このペプチドは膜に結合して電位駆動型イオンチャネル活性を持つことが知られている。本研究ではカルボニル炭素の大きな化学シフト異方性に注目して、化学シフトテンソルをペプチドが膜法線の周りで回転している運動モデルを用いて解析した。この結果、N-末端はα-ヘリックスを形成して膜法線から17度傾き、C-末端は3_<10>-ヘリックスを形成して膜法線から32度傾いている詳細な立体構造と膜に対する配向が明らかになった。バクテリオロドプシンはHalobacterium Salinarumの紫膜に存在する内在性膜タンパク質であり、光駆動型プロトンポンプ活性をもっている。本研究では[ζ-^<15>N]Lys-bRの^<15>NCP-mS-NMRスペクトルを観測して、圧力と光により誘起されるレチナールの異性化を観測した。この結果、圧力順応状態では13-cis状態が増加し、明順応状態ではall-trans状態が増加することが判明した。さらにTyr-185近傍のタンパク質の主鎖は2つの構造が共存したことから、レチナールの異性化は近傍のタンパク質に局所的に影響を与えることが分かった。グルカゴンについて脂質二分子膜の存在下で線維形成を行ったところ、水溶液中で形成する線維はN-末端側とC-末端側がβ-sheet構造を形成するのに対し、脂質二分子膜存在下では、N-末端はα-helixを形成したままであることが判明した。また脂質二分子膜存在下では水溶液中に比べて核形成速度は速くなり、線維成長速度は遅くなることが分かった。グルカゴンは脂質膜に結合して濃縮されるので線維核形成速度は速くなったことが明らかになった。
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固体NMRによるアミロイド形成ペプチドのアミロイド線維形成阻害機構の解明
使用固态 NMR 阐明淀粉样蛋白形成肽抑制淀粉样蛋白原纤维形成的机制
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Masako Umeyama, Akira Naito, H. Saito, I. Kawamura, I. Kawamura, I. Kawamura, A. Naito, H. Saito, H.Saito, I.Kawamura, I.Kawamura, I.Kawamura, A.Naito, K. Nishimura, K. Yamamoto, M. Umeyama, Akira Naito, M. Kamihira, K. Nishimura, M. Umeyama, Akira Naito, M. Kamihira, K. Nishimura, K.Nishimura, K.Yamamoto, M.Umeyama, A.Naito, M.Kamihira, K.Nishimura, A.Naito, K.Yamamoto, K. Nishimura, T. Uezono, S. Toraya, K. Nishimura, T. Uezono, S. Toraya, K.Nishimura, T.Uezono, S.Toraya, Akira Naito, Akira Naito, 内藤 晶, Akira Naito, Akira Naito, Akira Naito, 内藤 晶, A. Naito, A. Naito, Akira Naito, Akira Naito, Akira Naito, 内藤 晶]
通讯作者:
内藤 晶
Dynamic aspect of extracellular loop region as a proton release psthway of bacteriorhodopsin studied by relaxation time measurements by solid state NMR
通过固态核磁共振弛豫时间测量研究细胞外环区域作为细菌视紫红质质子释放途径的动态方面
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Biochim. Biophys. Acta 1768
影响因子:
--
作者:
[C. Kato, T. Sato, F. Abe, E. Ohmae, H. Tamegai, K. Nakasone, K. Siddiqui, and T. Thomas, 大前英司, I. Kawamura, I. Kawamura]
通讯作者:
I. Kawamura
アミロイド線維の原子分解能立体構造解析
淀粉样原纤维的原子分辨率三维结构分析
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Masako Umeyama, Akira Naito, H. Saito, I. Kawamura, I. Kawamura, I. Kawamura, A. Naito, H. Saito, H.Saito, I.Kawamura, I.Kawamura, I.Kawamura, A.Naito, K. Nishimura, K. Yamamoto, M. Umeyama, Akira Naito, M. Kamihira, K. Nishimura, M. Umeyama, Akira Naito, M. Kamihira, K. Nishimura, K.Nishimura, K.Yamamoto, M.Umeyama, A.Naito, M.Kamihira, K.Nishimura, A.Naito, K.Yamamoto, K. Nishimura, T. Uezono, S. Toraya, K. Nishimura, T. Uezono, S. Toraya, K.Nishimura, T.Uezono, S.Toraya, Akira Naito, Akira Naito, 内藤 晶]
通讯作者:
内藤 晶
Solid state NMR analysis of the orientation and dynamics of epigallo catechin gallate, a green tea polyphenol, incorpolated into lipid bilayers
表没食子儿茶素没食子酸酯(一种绿茶多酚)掺入脂质双层的取向和动力学的固态核磁共振分析
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
Magn. Reson. Chem. 46
影响因子:
--
作者:
[Mino, H., 伊藤繁(共著), K. Kajiya, Y. Morita, Izuru Kawamura, Ohki Kambara, Izuru Kawamura, K. Kajiya]
通讯作者:
K. Kajiya
DOI:
10.1562/2006-06-20-rc-941
发表时间:
2007-02
期刊:
Photochemistry and Photobiology
影响因子:
3.3
作者:
[I. Kawamura;Y. Degawa;S. Yamaguchi;K. Nishimura;S. Tuzi;H. Saitô;A. Naito]
通讯作者:
I. Kawamura;Y. Degawa;S. Yamaguchi;K. Nishimura;S. Tuzi;H. Saitô;A. Naito
共 23 条
異方的磁気相互作用を利用した膜結合生理活性分子と生体膜との相互作用解析
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批准号:17048010
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2005
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
異方的磁気相互作用を利用した膜結合生理活性ペプチド構造解析法の開発
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批准号:13024263
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2001
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
自発的磁場配向膜中生理活性ペプチドの高分解能構造解析法の開発
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批准号:12034217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2000
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
自発的磁場配向膜を用いた膜機能性生体分子の精密立体構造解析
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批准号:11440208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$5.82万
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财政年份:1999
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
磁場配向ニ重膜中生理活性ペプチドの動的構造解析法の開発
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批准号:11160217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1999
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
磁場配向二重膜を用いた生体膜中ペプチドの立体構造解析法の開発
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批准号:10179217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1998
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
固体高分解能NMR分光法による人工生体膜中ペプチドの精密立体構造解析
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批准号:08640652
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1996
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
固体高分解能NMR分光法によるペプチドの結晶中における静的および動的構造解折
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批准号:06640665
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:1994
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
状態相関二次元NMR分光法による光記憶型液晶の動的構造の解明
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批准号:05640575
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1993
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
シクロデキストリンの金属錯体包接化合物における構造と動的挙動に関する研究
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批准号:61740249
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1986
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负责人:内藤 晶
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依托单位:
海外基金