外被蛋白質遺伝子に基づく魚類病原ノダウイルスの分子進化学的解析

基于外壳蛋白基因的鱼类致病性诺达病毒分子进化分析

• 批准号: 08660230
• 负责人: 西澤 豊彦
• 金额: $ 0.83万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 1996
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1996 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08660230/
• 关键词: ノダウイルス; 外被タンパクシ質遺伝子; 分子進化

魚類ノダウイルスはウイルス性神経壊死症の原因ウイルスで、種苗生産過程の海産仔稚魚に壊滅的な被害をもたらすことから産業上問題となっている。本ウイルスは国内外合わせて16種以上の海産仔稚魚から検出されており、その外被蛋白質遺伝子には長さ約250塩基の変化に富んだ領域(可変領域)が存在する。本研究では、異なる地域、年度あるいは魚種から検出された魚類ノダウイルス25株の可変領域の塩基配列を決定し、これを基に魚類ノダウイルス株間の分子進化学的関係について解析をおこない以下のことを明らかにした。1)魚類ノダウイルス国内株は分子進化学的に独立したSJ、TP、BF、RG系統群の4系統群に分けられ、国外株は何れもRG系統群と密接に関わっていた。2)各系統群内における塩基配列およびアミノ酸配列の類似性は何れも95%以上で、少なくとも各系統群内の株は同一ウイルスであると考えられた。3)解析した遺伝子領域の塩基配列を算出した魚類ノダウイルスの分子進化速度は2.6×10^<-3>/座位/年で、これにより魚類ノダウイルスの4系統群は100〜150年前に分岐時期したことが示唆された。この結果は、魚類ノダウイルスが異なる宿主間での感染を繰り返しながら宿主範囲を広げてきたことを示している。4)各系統群内における細かな分岐はここ10年の間に起こったと推察され、海産魚の種苗の移動が頻繁に行われるようになった時期に一致することから、魚類ノダウイルスの伝播に人為的要因が関与したことが窺われる。5)作成した分子系統樹から、魚類ノダウイルスの国内伝播にはヒラメが関与していた可能性が示唆された。

Fish ノ ダ ウ イ ル ス は ウ イ ル ス sex god 経 壊 die の reason ウ イ ル ス で の sea breed, seedlings production process summed に 壊 quenched な murdered を も た ら す こ と か ら industry problem と な っ て い る. This ウ イ ル ス は at home and abroad and わ せ て more than 16 の sea litter summed か ら 検 out さ れ て お り, そ の is outside but 伝 protein sequence に は long さ about 250 salt base の variations change に rich ん だ areas (can) - field が exist す る. This study で は, different な る regions, annual あ る い は species か ら 検 out さ れ た fish ノ ダ ウ イ ル ス 25 strains の - field の salt base with を decided し, こ れ を base に fish ノ ダ ウ イ ル ス among strains の molecules into chemical masato に つ い て parsing を お こ な い following の こ と を Ming ら か に し た. 1) fish ノ ダ ウ イ ル ス domestic strains は molecules into chemical に independent し た SJ, TP, BF, RG systems group の 4 system group に け ら れ, foreign plants は れ も RG system group と contact に masato わ っ て い た. 2) within the group of each system に お け る salt base with column お よ び ア ミ ノ acid with column の similarity は what れ も 95% で, less な く と も group of each system の は strains within the same ウ イ ル ス で あ る と exam え ら れ た. 3) parsing し た heritage 伝 sub-fields の salt base with column を calculate し た fish ノ ダ ウ イ ル ス の molecular evolution speed は 2.6 * 10 ^ < - > 3 / seat/year で, こ れ に よ り fish ノ ダ ウ イ ル ス の 4 system group は period of 100 ~ 150 years ago in に し た こ と が in stopping さ れ た. こ の results は, fish ノ ダ ウ イ ル ス が different な る hosts で の infection を Qiao り return し な が ら host fei 囲 を hiroo げ て き た こ と を shown し て い る. 4) within the group of each system に お け る fine か な branching は こ こ に up between 10 years の こ っ た と push examine さ れ, Marine fish の seedlings の mobile line が frequent に わ れ る よ う に な っ た period に consistent す る こ と か ら, fish ノ ダ ウ イ ル ス の 伝 sowing に artificially by が masato and し た こ と が peep わ れ る. 5) done し た molecular phylogenetic tree か ら, fish ノ ダ ウ イ ル ス の domestic 伝 sowing に は ヒ ラ メ が masato and し て い が た possibility in stopping さ れ た.

项目成果

Nishizawa, T.: "Genomic classification of fish nodaviruses by a molecular phylogenetic analysis of the coat protein gene" Applied and Environmental Microbiology. (発表予定). (1997)

Nishizawa, T.：“通过外壳蛋白基因的分子系统发育分析对鱼类诺达病毒进行基因组分类”，《应用与环境微生物学》（即将发表）。

西澤豊彦: "海産魚のssRNAウイルス" ウイルス. 46. 67-79 (1996)

西泽丰彦：“海水鱼类的 SSRNA 病毒”病毒。 46. 67-79 (1996)