Molecular Cell Biological Studies of Autophagy

自噬的分子细胞生物学研究

基本信息

  • 批准号:
    10480202
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 9.47万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份:
    1998
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1998 至 1999
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

We discovered autophagy in yeast and defined the whole process., then isolated a set of autophagy-deficient mutants, and have cloned most of APG genes essential for autophagy. We are now characterizing these gene products. We found a novel protein conjugation system required for autophagy. The C-terminal Gly of Apg12 is bound to Lys residue of Apg5 via an isopeptide bond. This conjugation reaction is distinct from but quite similar to ubiquitination. Apg10 functions as an E2 conjugating enzyme by showing thioester bond between Apg12 and Apg10. In a two-hybrid screen with Apg12 as a bait, we identified Apg16. We noticed that the Apg16 is bound to preferentially to Apg12-Apg5 conjugate. Apg16 forms an homo-oligomer via the coiled coil domain. Hence, this hetero-oligomeric large protein complex may play a role in autophagic process.Apg8 is up-regulated upon starvation. Indirect immunofluorescence study showed that intracellular localization of Apg8 drastically changes. Upon starvation, Apg8 appears adjacent to the vacuole, which represents autophagosome or its intermediate and finally autophagic bodies. According to EM analysis, Apg8 is mostly enriched on the intermediate of autophagosome. Thus, Apg8 could be a useful tracer for membrane flow in autophagosome formation. Formation process of autophagosome is accompanied with multiple fusion of small precursor structures to the intermediate structure.
我们在酵母中发现了自噬并定义了整个过程,然后分离了一组自噬缺陷突变体,并克隆了大部分自噬必需的APG基因。我们现在正在表征这些基因产物。我们发现了自噬所需的新型蛋白质缀合系统。 Apg12 的 C 端 Gly 通过异肽键与 Apg5 的 Lys 残基结合。这种缀合反应与泛素化不同但非常相似。 Apg10 通过在 Apg12 和 Apg10 之间显示硫酯键而发挥 E2 结合酶的作用。在以 Apg12 作为诱饵的双杂交筛选中,我们鉴定出了 Apg16。我们注意到 Apg16 优先与 Apg12-Apg5 缀合物结合。 Apg16 通过卷曲螺旋结构域形成同源寡聚体。因此,这种异源寡聚大蛋白复合物可能在自噬过程中发挥作用。饥饿时Apg8上调。间接免疫荧光研究表明 Apg8 的细胞内定位发生了巨大变化。饥饿时,Apg8 出现在液泡附近,液泡代表自噬体或其中间体和最终的自噬体。电镜分析显示,Apg8主要富集在自噬体中间体上。因此,Apg8 可能是自噬体形成中膜流的有用示踪剂。自噬体的形成过程伴随着小的前体结构与中间结构的多重融合。

项目成果

期刊论文数量(22)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Shintani, T. et al.: "Apg10p, a novel protein-conjugating enzyme essential for autophagy in yeast"EMBO J.. 18. 5234-5241 (1999)
Shintani, T. 等人:“Apg10p,一种对酵母自噬至关重要的新型蛋白质缀合酶”EMBO J.. 18. 5234-5241 (1999)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Furukawa, K. et al.: "A protein conjugatian system in yeast with homology to biosynthetic enzyme reaction of prokaryotes."
Furukawa, K. 等人:“酵母中的蛋白质缀合系统与原核生物的生物合成酶反应具有同源性。”
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kirisato, T. et al.: "Formation process of autophagosome is traced with Apg8/Aut7p in yeast"J. Cell Biol.. 147. 435-446 (1999)
Kirisato, T. 等人:“在酵母中用 Apg8/Aut7p 追踪自噬体的形成过程”J.
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Noda, T. et al.: "Apg9/Cvt7p is an integral membrane protein required for transport vesicle formation in the Cvt and autophagy pathways"J. Cell Biol.. (in press).
Noda, T. 等人:“Apg9/Cvt7p 是 Cvt 和自噬途径中转运囊泡形成所需的整合膜蛋白”J.
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Mizushima,N.et al: "A New Protein Conjugation System in Human.The counterpart of the yeast Apg12p conjugation system essential for autophagy." J.Biol.Chem.273. 33889-33892 (1998)
Mizushima,N.et al:“人类新的蛋白质缀合系统。自噬所必需的酵母 Apg12p 缀合系统的对应物。”
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Autophagy: Molecular mechanism and its integration into cell physiology
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    $ 9.47万
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    EP/Z000734/1
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 9.47万
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  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 9.47万
  • 项目类别:
    Standard Grant
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    2024
  • 资助金额:
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  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 9.47万
  • 项目类别:
    Continuing Grant
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    10079301
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 9.47万
  • 项目类别:
    Grant for R&D
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