硝酸呼吸系に含まれる銅タンパク質の構造と機能の研究
硝酸呼吸系に含まれる銅タンパク質の構造と機能の研究
批准号:
11116218
负责人:
鈴木 晋一郎
金额:
$0.96万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1999
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1999 至 --
中文摘要
我々は昨年Achromobacter cycloclastes IAM1013からの電子伝達ブルー銅タンパク質、シュウドアズリン(pAz)の酸化体(135Å分解能)と還元体(1.6Å分解能)におけるX線結晶構造解析に成功した。このタンパク質は、銅型亜硝酸還元酵素に電子を供与する。従って、平成11年度は主としてこの結晶構造解析で得られた知見に基づいて、pAzの構造と機能を研究した。X線のデータによると、pH6.0における両者の構造において、銅の周りの構造変化は小さいが、銅イオンから約12Å離れたところに位置しているHis6残基の変位が観測された。すなわち、酸化型では、His6(Nδ1)はThr36(Oγ1)と水素結合(2.73Å)しているが、還元型では、His6(Nε2)がGlu4(Oε1)と水素結合しており、両者においてHis6のイミダゾール環はThr36とGlu6の間でシャトルのように振る舞っている。これらの残基の機能を調べるために、変異体pAzからNIRへのタンパク質間電子移動反応をサイクリックボルタンメトリーにより測定した(pH7.0,25℃)。His6Alaでは野生型pAzの電子移動速度の85%に減少し、Thr36Valでは67%に減少したのに比べて、Glu4Alaの場合には14%と大きく減少していた。これらの結果は、還元型pAzにおけるGlu4とHis6との水素結合形成、すなわちHis6の固定がNIRとの相互作用に重要であることを示唆している。他の菌種からのpAzにおいてもThr36は保存されていないが(Alc.faecalis S-6ではVal36)、Glu4は保存されていることから考えても、このHis6およびGlu4との水素結合が両タンパク質の認識に関与しているのであろうと結論された。
英文摘要
我々は昨年Achromobacter cycloclastes IAM1013からの電子伝達ブルー銅タンパク質、シュウドアズリン(pAz)の酸化体(135Å分解能)と還元体(1.6Å分解能)におけるX線結晶構造解析に成功した。このタンパク質は、銅型亜硝酸還元酵素に電子を供与する。従って、平成11年度は主としてこの結晶構造解析で得られた知見に基づいて、pAzの構造と機能を研究した。X線のデータによると、pH6.0における両者の構造において、銅の周りの構造変化は小さいが、銅イオンから約12Å離れたところに位置しているHis6残基の変位が観測された。すなわち、酸化型では、His6(Nδ1)はThr36(Oγ1)と水素結合(2.73Å)しているが、還元型では、His6(Nε2)がGlu4(Oε1)と水素結合しており、両者においてHis6のイミダゾール環はThr36とGlu6の間でシャトルのように振る舞っている。これらの残基の機能を調べるために、変異体pAzからNIRへのタンパク質間電子移動反応をサイクリックボルタンメトリーにより測定した(pH7.0,25℃)。His6Alaでは野生型pAzの電子移動速度の85%に減少し、Thr36Valでは67%に減少したのに比べて、Glu4Alaの場合には14%と大きく減少していた。これらの結果は、還元型pAzにおけるGlu4とHis6との水素結合形成、すなわちHis6の固定がNIRとの相互作用に重要であることを示唆している。他の菌種からのpAzにおいてもThr36は保存されていないが(Alc.faecalis S-6ではVal36)、Glu4は保存されていることから考えても、このHis6およびGlu4との水素結合が両タンパク質の認識に関与しているのであろうと結論された。
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T. Inoue, N. Nishio, S. Suzuki, K. Kataoka, T. Kohzuma, Y. Kai: "Crystal Structure Determinations of Oxidized and Reduced Pseudoazurins from Achromobacter cycloclastes"Journal of Biological Chemistry. 274. 17845-17852 (1999)
T. Inoue、N. Nishio、S. Suzuki、K. Kataoka、T. Kohzuma、Y. Kai:“来自环碎无色杆菌的氧化和还原假天青素的晶体结构测定”生物化学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
K. Kataoka, H. Furusawa, K. Tagagi,K. Yamaguchi,S. Suzuki: "Functional Analysis of Conserved Aspartate and Histidine Residues Located Around the Type 2 Copper Site of Copper-Containing Nitrite Reductase"Journal of Biochemistry. 127. 345-350 (2000)
K. Kataoka、H. Furusawa、K. Tagagi、K.
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
S. Suzuki, N. Nakamura, K. yamaguchi, K. kataoka et al.: "Spectroscopic and Electrochemical Properties of Two Azurins from the Obligate Methylotroph Methylomonas sp. Strain J and structure of Novel Az"Journal of Biological Inorganic Chemistry. 4. 749-758
S. Suzuki、N. Nakamura、K. yamaguchi、K. kataoka 等人:“来自专性甲基营养型甲基单胞菌菌株 J 的两个天青蛋白的光谱和电化学性质以及新型 Az 的结构”生物无机化学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
S. Suzuki, K. Kataoka, K. Yamaguchi, T. Inoue, Y. Kai: "Structure-Function relationships of Copper-containing Nitrite Reductases"Coordination Chemistry Review. 190-192. 245-265 (1999)
S. Suzuki、K. Kataoka、K. Yamaguchi、T. Inoue、Y. Kai:“含铜亚硝酸还原酶的结构-功能关系”配位化学评论。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 6 条
硝酸呼吸系に含まれる銅タンパク質の構造と機能の研究
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批准号:10129217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1998
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负责人:鈴木 晋一郎
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依托单位:
硝酸呼吸系に含まれる銅タンパク質の構造と機能の研究
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批准号:09235216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1997
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负责人:鈴木 晋一郎
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依托单位:
硝酸呼吸系に含まれる銅タンパク質の構造と機能の研究
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批准号:08249221
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.47万
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财政年份:1996
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负责人:鈴木 晋一郎
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依托单位:
ヘム蛋白質と銅蛋白質の活性中心に関する生物無機化学的研究
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批准号:62540463
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.64万
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财政年份:1987
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负责人:鈴木 晋一郎
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依托单位:
Non-blue銅タンパク質の活性中心における銅の配位環境について
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批准号:X00210----574230
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1980
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负责人:鈴木 晋一郎
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依托单位:
海外基金