金属錯体抗生物質・センサー蛋白質による遺伝子発現制御機構

金属复合物抗生素和传感器蛋白的基因表达控制机制

基本信息

  • 批准号:
    11116222
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.02万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
  • 财政年份:
    1999
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1999 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

センサー蛋白質BLMAとブレオマイシン(Bm)複合体の結晶を作製し、そのX線結晶構造解析を行なった。その結果、Bmの金属結合部位および2つの糖はlarge concavityに、リンカー部位およびビチアゾール部位はlong grooveに収容されていた。金属結合部位を構成するβ-aminoalanine,pyrimidyl propioneamideおよび糖部分のひとつguloseは、蛋白質分子と水素結合を形成し、安定化されていた。また、ビチアゾール部位は、片側からPhe33およびPhe38のスタッキングにより安定化されており、もう一方側からは、Pro101の疎水的相互作用により安定化されていた。一方、リンカー部位は蛋白質分子と相互作用しておらず、蛋白質にゆるく結合しているものと思われた。また、BmのN末端アミン部位は、電子密度図上で観測されず、非常にflexibleな構造をとっているものと推測された。複合体構造をBm非結合型BLMAと比較すると、両者の間で際立った構造変化は認められなかったものの、Ser100-Gly103からなるループがBm結合部位の方向へ数Åシフトしていることがわかった。この構造変化は、Pro101をBm分子に近づけ、ビチアゾール部位を疎水的相互作用により安定化するために重要であると考えられた。本複合体構造におけるBmは金属と配位していないものの、その金属結合部位は金属と配位できるコンフォーメーションをとっていた。また、Bmのβ-aminoalanine部位のα-アミノ基は、金属配位部位である平面の上方に位置しており、かつ、柔軟性を持った構造をとっていた。また、トランスポゾンTn5由来のセンサー蛋白質/Bmとの複合体におけるBmの結合様式は、BLMA/Bm複合体のそれとほぼ同じであった。
Crystal preparation and X-ray crystal structure analysis of BLMA and Bm complex As a result, the metal binding sites of Bm are too large for sugar, too large for sugar. Metal binding sites are composed of β-aminoalanine, pyridyl propionate and sugar moieties, protein molecules and water binding are formed and stabilized. Phe33 and Phe38 are located on the opposite side of the plate and are stabilized by the interaction of water with Pro101. A protein molecule interacts with a protein molecule. The N-terminal position of Bm is not determined by electron density, and the structure of Bm is very flexible. The structure of the complex is Bm non-binding BLMA. The structure of the complex is different from that of the Bm non-binding BLMA. The structural transformation of Pro-101 is important for the stability of Bm molecules. The structure of the complex is composed of metal coordination sites and metal binding sites. The α-aminoalanine site of Bm is located above the plane of the metal coordination site, and the flexibility of the structure is maintained. Tn5 is derived from the protein/Bm complex and the BLMA/Bm complex.

项目成果

期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Sugiyama,M.: "A mammalian vector carrying the bleomycin N-acetyltransferase gene from bleomycin-producing Streptomyces verticillus as a selective marker"J.Antibiotics.. 52. 895-899 (1999)
Sugiyama,M.:“携带来自产博莱霉素轮枝菌的博莱霉素 N-乙酰转移酶基因作为选择标记的哺乳动物载体”J.Antibiotics.. 52. 895-899 (1999)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Ishikawa,Y.: "Oxidative and random cleavage of DNA by the novel iron (II) complex capable of yielding an iron (III) hydroperoxide intermediate"Chem.Lett.. 1998. 39-40 (1998)
Ishikawa,Y.:“能够产生铁(III)氢过氧化物中间体的新型铁(II)复合物对DNA的氧化和随机切割”Chem.Lett.. 1998. 39-40 (1998)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Kumagai,T.: "Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of bleomycin-binding protein encoded on the transposon Tn5"Acta Cryst.Sec.D. 55. 1095-1097 (1999)
Kumagai,T.:“转座子 Tn5 上编码的博莱霉素结合蛋白的结晶和初步 X 射线衍射研究”Acta Cryst.Sec.D.
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Ikeda,K.: "Construction of a new cloning vector utilizing a cryptic plasmid and the highly expressed melanin-synthesizing gene operon from Streptomyces castaneoglobisporus" FEMS Microbiol.Lett.168. 195-199 (1998)
Ikeda,K.:“利用隐秘质粒和来自栗球孢链霉菌的高表达黑色素合成基因操纵子构建新的克隆载体”FEMS Microbiol.Lett.168。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

杉山 政則其他文献

炎症性疾患を改善するための医薬品開発をめざして
旨在开发改善炎症性疾病的药物
  • DOI:
    10.34565/seibutsukogaku.99.11_587
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    野田 正文;杉山 政則
  • 通讯作者:
    杉山 政則
情動行動とタンパク質リン酸化
情绪行为和蛋白质磷酸化
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    野田 正文;杉山 政則;永井拓
  • 通讯作者:
    永井拓
D-サイクロセリン合成酵素DcsGの構造生物学的研究およびホモシステインの定量と光学分割への応用
D-环丝氨酸合酶DcsG的结构生物学研究及其在同型半胱氨酸定量和光学分辨率中的应用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    工藤 真子;的場 康幸;宇田 成利;熊谷 孝則;黒田 照夫;杉山 政則
  • 通讯作者:
    杉山 政則
チロシナーゼの構造化学的研究
酪氨酸酶的结构化学研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2012
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    的場 康幸;坂東 尚彦;小田 康祐;野田正文;東川 史子;熊谷 孝則;杉山 政則;的場 康幸
  • 通讯作者:
    的場 康幸
時間分割解析を用いた二核銅酵素チロシナーゼの反応機構の解明
使用时间分辨分析阐明双核铜酶酪氨酸酶的反应机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    的場 康幸;古川 裕貴;柳澤 幸子;宇田 成利;熊谷 孝則;小倉 尚志;杉山 政則;的場 康幸
  • 通讯作者:
    的場 康幸

杉山 政則的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('杉山 政則', 18)}}的其他基金

サーモセンシングタンパク質の立体構造解析と医療への応用
热敏蛋白的三维结构分析及医学应用
  • 批准号:
    17659012
  • 财政年份:
    2005
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
磁力は骨芽細胞の分化・増殖を著しく亢進させる
磁力显着增强成骨细胞分化和增殖
  • 批准号:
    11877003
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
金属錯体抗生物質・センサー蛋白質による遺伝子発現制御機構
金属复合物抗生素和传感器蛋白的基因表达控制机制
  • 批准号:
    10129223
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
ピロリ菌のホスホリパーゼ〜胃潰瘍・胃癌発症のニュートリガー〜
幽门螺杆菌磷脂酶〜胃溃疡/胃癌的新触发因素〜
  • 批准号:
    09877437
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
金属錯体抗生物質・センサー蛋白質による遺伝子発現制御機構
金属复合物抗生素和传感器蛋白的基因表达控制机制
  • 批准号:
    09235224
  • 财政年份:
    1997
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
金属錯体抗生物質・センサー蛋白質による遺伝子発現制御機構
金属复合物抗生素和传感器蛋白的基因表达控制机制
  • 批准号:
    08249228
  • 财政年份:
    1996
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ブラスティシジンS生産菌の自己耐性機構の解明と自己耐性遺伝子のクローニング
杀稻瘟素S产菌自身抗性机制的阐明及自抗性基因的克隆
  • 批准号:
    61750910
  • 财政年份:
    1986
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
アミノ酸糖体抗生物質生産菌における自己耐性遺伝子のクローニング
氨基酸糖苷类抗生素产生菌自身抗性基因的克隆
  • 批准号:
    59750755
  • 财政年份:
    1984
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
放線菌ブロトプラスト再生による自己耐性の獲得
通过放线菌原生质体再生获得自身抗性
  • 批准号:
    57750820
  • 财政年份:
    1982
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
ストレプトマイシン生産菌の自己耐性を支配する因子の解明
阐明链霉素产生菌自身抗性的影响因素
  • 批准号:
    X00210----575611
  • 财政年份:
    1980
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

相似海外基金

構造生物学・物理化学・計算化学に基づくチロシンキナーゼ阻害剤剤選択性の解明
基于结构生物学、物理化学和计算化学阐明酪氨酸激酶抑制剂的选择性
  • 批准号:
    24K09762
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
キナーゼのリン酸化・脱リン酸化を介したシグナル伝達制御のNMR動的構造生物学
通过激酶磷酸化/去磷酸化控制信号转导的 NMR 动态结构生物学
  • 批准号:
    23K27310
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
ミスマッチ修復を促進するクロマチンリモデラーの構造生物学的解明
促进错配修复的染色质重塑剂的结构生物学阐明
  • 批准号:
    24K09356
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
オートファジー脂質輸送システムの構造生物学的研究
自噬脂质转运系统的结构生物学研究
  • 批准号:
    24K09358
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
DNA複製におけるゲノム安定性維持機構の構造生物学的研究
DNA复制过程中基因组稳定性维持机制的结构生物学研究
  • 批准号:
    24K01966
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
クライオ電子顕微鏡による生体膜構造生物学
使用冷冻电子显微镜进行生物膜结构生物学
  • 批准号:
    23K27132
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
B型肝炎ウイルス細胞侵入機構とその制御に関する構造生物学研究
乙型肝炎病毒细胞侵袭机制及其调控的结构生物学研究
  • 批准号:
    23K27415
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
味覚受容体による「多対多」の化学物質認識メカニズムの構造生物学的究明
味觉受体“多对多”化学识别机制的结构生物学研究
  • 批准号:
    23K27117
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
薬物動態学や構造生物学に基づいた"真の尿毒症物質"の機能解析
基于药代动力学和结构生物学的“真尿毒症物质”功能分析
  • 批准号:
    24K18312
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
ユビキチンリガーゼが制御する病原菌感染と生体防御応答の構造生物学的解析
泛素连接酶调节的病原体感染和生物防御反应的结构生物学分析
  • 批准号:
    24K01968
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 1.02万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了