Untersuchung dynamischer Prozesse und pathologischer Veränderungen in menschlichen Zellkernen mittels multispektraler Bildfolgenanalyse

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Das Ziel des hier vorgestellten Projektes ist die Weiterentwicklung eines vollautomatischen Systems für Bildsequenzanalyse von dynamischen Prozessen in biomedizinischen Anwendungen. Das System besteht aus drei verschiedenen Modellen, 3D-Segmentierung, 4D-Partikeltracking und mehrdimensionale Visualisierung. Da das existierende System nur die Segmentierung von zweidimensionalen Strukturen erlaubt, werden wir uns zunächst auf die dreidimensionale Segmentierung mittels deformierbarer Konturen konzentrieren. Parallel soll das bereits implementierte 4D-Tracking weiter optimiert werden. Ein integraler Teil dieses Projekts wird der quantitative und qualitative Vergleich des Partikeltrackings mit Optischen-Fluss-Methoden wie dem Strukturtensor (Teilprojekt A) sein. Im Zuge dieses Vergleichs planen wir Richtlinien für Mitglieder anderer Forschungsgruppen aufzustellen, um die Entscheidungsfindung hinsichtlich der geeigneten Methode für die jeweilige Anwendung zu ermöglichen. Wie bereits in Phase II der Forschergruppe werden die entwickelten Module in der Forschergruppe (besonders Teilprojekt E) als auch in externen Kollaborationen zu einer intensiven Anwendung kommen.