课题基金 / 基金详情

ランダムサイトコドン変異法による非天然アミノ酸導入蛋白質の作製

ランダムサイトコドン変異法による非天然アミノ酸導入蛋白質の作製
使用随机位点密码子诱变方法生产非天然氨基酸引入的蛋白质
批准号:
00J06468
负责人:
村上 裕
金额:
$2.3万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 2002

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
非天然アミノ酸の蛋白質への部位特異的導入は、蛋白質に新たな機能を付与するための有用な方法である。この変異法は1989年にShultzらにより、アンバーコドンを非天然アミノ酸に対応させる方法として発表された。我々の研究室では、新しく4塩基や5塩コドンを非天然アミノ酸に対応させることで、非天然アミノ酸の導入効率を改善し、さらには2個の非天然アミノ酸を導入して蛋白内の電子移動を観測することにも成功している(J.A.C.S. 2002)。しかし、非天然アミノ酸でアシル化されたtRNAの作成が非常に複雑であるため、その応用には限界があるのも事実である。本年度は、アミノアシルtRNAの簡便な作成法を開発するべく、ニュヨーク州立大学の菅裕明教授との共同研究を行った。菅裕明教授は、tRNAをアミノアシル化する様々なリボザイム(RNA触媒)を、進化工学的手法を用いて得ている。このうち、r24と名付けられたリボザイムは、カルボキシル基を弱く活性化したアミノ酸を基質としtRNAの3'末端を特異的にアミノアシル化する。しかし、r24はtRNAと強く結合し、生成物であるアミノアシルtRNAを解離することができず、結果として1ターンオーバーの触媒となる。この問題点を逆手に取り、r24をレジンに固定化することで効率良くアミノアシルtRNAを作成し精製することに成功した。実際には、r24の3'末端にpolyAを付加し、この3'末端を酸化してジアルデヒドを作成し、これをヒドラジドを表面にもつレジンに固定化した。このr24を固定化したレジンにtRNAとアミノ酸を含む水溶液を加え、アミノアシル化反応を行った。反応後、レジンを洗浄し、尿素を含む溶出液でr24を変性させることで、アミノアシルtRNAが回収できた。さらに、r24を固定化したレジンは、水で洗浄するだけで簡単に再生でき、複数回の再利用が可能であった。本結果は本年度の(H. M. et al. JA.CS. 2002)に発表した。今後、本方法が「ランダム挿入削除変異法(ランダムサイトコドン変異法)」を含む様々な方法に応用されるものと考えられる。
英文摘要
非天然アミノ酸の蛋白質への部位特異的導入は、蛋白質に新たな機能を付与するための有用な方法である。この変異法は1989年にShultzらにより、アンバーコドンを非天然アミノ酸に対応させる方法として発表された。我々の研究室では、新しく4塩基や5塩コドンを非天然アミノ酸に対応させることで、非天然アミノ酸の導入効率を改善し、さらには2個の非天然アミノ酸を導入して蛋白内の電子移動を観測することにも成功している(J.A.C.S. 2002)。しかし、非天然アミノ酸でアシル化されたtRNAの作成が非常に複雑であるため、その応用には限界があるのも事実である。本年度は、アミノアシルtRNAの簡便な作成法を開発するべく、ニュヨーク州立大学の菅裕明教授との共同研究を行った。菅裕明教授は、tRNAをアミノアシル化する様々なリボザイム(RNA触媒)を、進化工学的手法を用いて得ている。このうち、r24と名付けられたリボザイムは、カルボキシル基を弱く活性化したアミノ酸を基質としtRNAの3'末端を特異的にアミノアシル化する。しかし、r24はtRNAと強く結合し、生成物であるアミノアシルtRNAを解離することができず、結果として1ターンオーバーの触媒となる。この問題点を逆手に取り、r24をレジンに固定化することで効率良くアミノアシルtRNAを作成し精製することに成功した。実際には、r24の3'末端にpolyAを付加し、この3'末端を酸化してジアルデヒドを作成し、これをヒドラジドを表面にもつレジンに固定化した。このr24を固定化したレジンにtRNAとアミノ酸を含む水溶液を加え、アミノアシル化反応を行った。反応後、レジンを洗浄し、尿素を含む溶出液でr24を変性させることで、アミノアシルtRNAが回収できた。さらに、r24を固定化したレジンは、水で洗浄するだけで簡単に再生でき、複数回の再利用が可能であった。本結果は本年度の(H. M. et al. JA.CS. 2002)に発表した。今後、本方法が「ランダム挿入削除変異法(ランダムサイトコドン変異法)」を含む様々な方法に応用されるものと考えられる。
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Masumi Taki, Takahiro Hohsaka, Hiroshi Murakami, Kazunari Taira, Masahiko Sisido: "Position-specific incorporation of a fluorophore-quencher pair into a single streptavidin through orthogonal four-base codon/anticodon pairs"J. Am. Chem. Soc.. 124・49. 1458
Masumi Taki、Takahiro Hohsaka、Hiroshi Murakami、Kazunari Taira、Masahiko Sisido:“通过正交四碱基密码子/反密码子对将荧光团淬灭剂对定位到单个链霉亲和素中”J. Soc. 124。・49.1458
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Hiroshi Murakami, Neil Bonzagni, Hiroaki Suga: "Aminoacyl-tRNA Synthesis by a Resin-Immobilized Ribozyme"J. Am. Chem. Soc.. 124・24. 6834-6835 (2002)
Hiroshi Murakami、Neil Bonzagni、Hiroaki Suga:“树脂固定核酶的氨基酰基-tRNA 合成”J. Am. 124・24 (2002)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Hiroshi Murakami, Takahiro Hohsaka, Kazunari Taira, Masahiko Sisido: "Random Insertion and Deletion Mutagenesis"Methods in Molecular Biology. (in press).
Hiroshi Murakami、Takahiro Hohsaka、Kazunari Taira、Masahiko Sisido:“随机插入和缺失突变”分子生物学方法。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
村上裕, 芳坂貴弘, 宍戸昌彦: "新規変異タンパク質創出のためのランダム挿入削除変異法"BIOベンチャー. 2・4. 94-97 (2002)
Yutaka Murakami、Takahiro Yoshisaka、Masahiko Shishido:“用于创建新型突变蛋白的随机插入/缺失诱变方法”BIO Venture 94-97(2002)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Significance and Issues related to board member diversity
  • 批准号:
    23K01163
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $1.91万
  • 财政年份:
    2023
  • 负责人:
    村上 裕
  • 依托单位:
Development of single-molecule peptide sequencing method
  • 批准号:
    23H05456
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
  • 资助金额:
    $133.54万
  • 财政年份:
    2023
  • 负责人:
    村上 裕
  • 依托单位:
広汎用リボソームの開発
  • 批准号:
    23350076
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $7.07万
  • 财政年份:
    2011
  • 负责人:
    村上 裕
  • 依托单位:
新規アミノアシルtRNA合成リボザイムの創製
  • 批准号:
    17750151
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 资助金额:
    $2.3万
  • 财政年份:
    2005
  • 负责人:
    村上 裕
  • 依托单位:
海外基金