新規アミノアシルtRNA合成リボザイムの創製
新規アミノアシルtRNA合成リボザイムの創製
批准号:
17750151
负责人:
村上 裕
金额:
$2.3万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2006
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非天然アミノ酸変異法は、人工的な官能基を蛋白質に部位特異的に導入する優れた方法である。この変異法にはアシルtRNAの合成が必須であり、我々はリボザイムを人工的に進化させることでアシルtRNAの合成を簡便化することを提案してきた。これまでに試験管内分子進化により創製したRNA触媒を用いて、Phe誘導体でアシル化されたtRNAの合成に成功している。本課題では、RNA触媒を進化させ、本方法をPhe誘導体以外の非天然アミノ酸に拡張することを目的とした。RNA触媒の基質となるアミノ酸は、カルボン酸をエステル化して弱く活性化したものを用いている。これまでの研究から、RNA触媒は基質の脱離基を認識せず、側鎖の芳香環を認識するため、側鎖に芳香環を持つアミノ酸のみがRNA触媒の基質となることが分かっていた。そこで、もしRNA触媒の基質認識部位を、側鎖から脱離基に変更できれば、様々な側鎖をもつアミノ酸をtRNAに連結することが可能になると考えた。この設計指針によって、脱離基に芳香環(認識部位)をもつ新しい基質を合成した。この基質は当初の考え通り、既存のRNA触媒の基質となったが、そのアシル化効率は低かった。そこで新しい基質に対してRNA触媒を最適化するため、試験管内進化を行なった。得られたRNA触媒は進化を行なう前のものに比べ、5倍以上の活性を持っていた。このRNA触媒と、脱離基に芳香環(認識部位)をもつ基質を用いることで、これまでの基質の制限を大幅に取り払ったtRNAアシル化法が完成した(Nat.Methods 2006)。今後、本方法によりアシルtRNAの合成が簡略化され、非天然アミノ酸を用いた蛋白質の改変が容易になると考えられる。さらには、RNA触媒を遺伝暗号のリプログラミングと組み合わせ、非天然型ペプチドを調整することで、革新的な創薬技術の開発に応用できると期待される。
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遺伝暗号リプログラミングによるポリエステルの翻訳合成
通过遗传密码重编程翻译合成聚酯
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
高分子 56・4月号
影响因子:
--
作者:
[太田 淳, 村上 裕, 菅 裕明]
通讯作者:
菅 裕明
Programmable ribozymes for mischarging tRNA with nonnatural amino acids and their applications to translation.
用于将 tRNA 与非天然氨基酸错配的可编程核酶及其在翻译中的应用。
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Methods 36(3)
影响因子:
--
作者:
[Kourouklis, D., Murakami.H., Suga, H.]
通讯作者:
H.
特殊ペプチドのコンビナトリアル翻訳合成
特殊肽的组合翻译合成
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
化学工業 58・4月号
影响因子:
--
作者:
[後藤佑樹, 太田淳, 村上裕, 菅裕明]
通讯作者:
菅裕明
フレキシザイム~遺伝暗号の拡張とリプログラミングへの応用
Flexizyme ~ 遗传密码的扩展及其在重编程中的应用
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
バイオテクノロジージャーナル 6(6)
影响因子:
--
作者:
[村上裕, 菅裕明]
通讯作者:
菅裕明
フレキシザイムを用いた遺伝暗号の拡張とリプログラミング
使用 Flexizyme 进行遗传密码扩展和重编程
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
蛋白質核酸酵素 51・16
影响因子:
--
作者:
[村上 裕, 菅 裕明]
通讯作者:
菅 裕明
共 6 条
Significance and Issues related to board member diversity
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批准号:23K01163
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.91万
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财政年份:2023
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负责人:村上 裕
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依托单位:
Development of single-molecule peptide sequencing method
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批准号:23H05456
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$133.54万
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财政年份:2023
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负责人:村上 裕
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依托单位:
広汎用リボソームの開発
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批准号:23350076
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$7.07万
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财政年份:2011
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负责人:村上 裕
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依托单位:
ランダムサイトコドン変異法による非天然アミノ酸導入蛋白質の作製
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批准号:00J06468
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2000
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负责人:村上 裕
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依托单位:
非天然アミノ酸の蛋白質への導入による蛋白質の人工機能化
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批准号:98J06020
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1998
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负责人:村上 裕
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依托单位:
海外基金