古細菌コハク酸脱水素酵素複合体の構造機能解析
古細菌コハク酸脱水素酵素複合体の構造機能解析
批准号:
11169237
负责人:
岩崎 俊雄
金额:
$2.3万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
2000
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2000 至 --
中文摘要
古細菌スルホロバスのコハク酸脱水素酵素複合体は、4つのサブユニットSdhA,B,C,Dからなり、高い耐熱性を有する。本研究では、古細菌型コハク酸脱水素酵素複合体の構造機能解析を目的として、以下の研究成果を得た。(i)全遺伝子配列決定と各サブユニットの系統解析から、SdhA,Bがミトコンドリア・真正細菌型であり、SdhCがメタン菌フマル酸:チオール酸化還元酵素サブユニットのホモログ、SdhDが新規タンパクであることを見出した。(ii)sdhA-D,sdhAB,sdhB,sdhC,sdhD遺伝子の大腸菌発現系をそれぞれ構築した。その結果、SdhCについては大量発現に成功し、さらにEXAFSおよび共鳴ラマン解析から、鉄および亜鉛を結合すること、少なくとも新規[2Fe-2S]クラスターを有することを見出した。また、EPR解析からSdhCに異方性の高いラジカル中心を見い出したが、同定には至っていない。SdhCは立体構造未知なため、発現酵素を用いた結晶化に着手した。(iii)sdhB遺伝子全長を含むコンストラクトは全て封入体となり、これはシャペロニンGroELSやチオレドキシンとの共発現系によっても状況が改善されなかった。本研究の成果は論文として発表した他、1報投稿中である。また、本課題と関連し、他の酸化還元酵素についても、EPR・EXAFSによる解析を行い、論文として発表した。今後はsdhA-D遺伝子の大腸菌発現系改変を試みるとともに、SdhCの結晶化・機能解析を引続き行う予定である。
英文摘要
古細菌スルホロバスのコハク酸脱水素酵素複合体は、4つのサブユニットSdhA,B,C,Dからなり、高い耐熱性を有する。本研究では、古細菌型コハク酸脱水素酵素複合体の構造機能解析を目的として、以下の研究成果を得た。(i)全遺伝子配列決定と各サブユニットの系統解析から、SdhA,Bがミトコンドリア・真正細菌型であり、SdhCがメタン菌フマル酸:チオール酸化還元酵素サブユニットのホモログ、SdhDが新規タンパクであることを見出した。(ii)sdhA-D,sdhAB,sdhB,sdhC,sdhD遺伝子の大腸菌発現系をそれぞれ構築した。その結果、SdhCについては大量発現に成功し、さらにEXAFSおよび共鳴ラマン解析から、鉄および亜鉛を結合すること、少なくとも新規[2Fe-2S]クラスターを有することを見出した。また、EPR解析からSdhCに異方性の高いラジカル中心を見い出したが、同定には至っていない。SdhCは立体構造未知なため、発現酵素を用いた結晶化に着手した。(iii)sdhB遺伝子全長を含むコンストラクトは全て封入体となり、これはシャペロニンGroELSやチオレドキシンとの共発現系によっても状況が改善されなかった。本研究の成果は論文として発表した他、1報投稿中である。また、本課題と関連し、他の酸化還元酵素についても、EPR・EXAFSによる解析を行い、論文として発表した。今後はsdhA-D遺伝子の大腸菌発現系改変を試みるとともに、SdhCの結晶化・機能解析を引続き行う予定である。
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Iwasaki,T. 他: "Sequence motif-specific assignment of two [2Fe-2S] clusters in rat xanthine oxidoreductase studied by site-directed mutagenesis."J.Biochem.. 127. 771-778 (2000)
Iwasaki, T. 等人:“通过定点诱变研究大鼠黄嘌呤氧化还原酶中两个 [2Fe-2S] 簇的序列基序特异性分配。J.Biochem.. 127. 771-778 (2000)”
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Iwasaki, T.: "Respiratory complex II from the thermoacidophilic archaeon, Sulfolobus sp. Strain 7 : genes and protein"Flavins and Flavoproteins 1999. 779-781 (1999)
Iwasaki, T.:“嗜热嗜酸古菌,硫化叶菌属菌株 7 的呼吸复合体 II:基因和蛋白质”黄素和黄素蛋白 1999. 779-781 (1999)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Iwasaki,T. 他: "Spectroscopic investigation of the selective cluster conversion of archaeal zinc-containing ferredoxin from Sulfolobus sp.strain 7"J.Biol.Chem.. 275. 25391-25401 (2000)
Iwasaki, T. 等人:“来自硫化叶菌 sp.strain 7 的古菌含锌铁氧还蛋白选择性簇转化的光谱研究”J.Biol.Chem.. 275. 25391-25401 (2000)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Ishii,M.,Takishita,S.,Iwasaki,T. 他: "Purification and characterization of membrane-bound hydrogenase from Hydrogenobacter thermophilus strain TK-6, an obligately autotrophic, thermophilic, hydrogen-oxidizing bacterium."Biosci.Biotechnol.Biochem.. 64. 492-
Ishii, M.、Takishita, S.、Iwasaki, T. 等人:“来自嗜热氢杆菌菌株 TK-6(一种专性自养、嗜热、氢氧化细菌)的膜结合氢化酶的纯化和表征。”Biosci.Biotechnol .生物化学.. 64. 492-
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Cosper, N. J.: "Structural conservation of the isolated zinc site in archaeal zinc-containing ferredoxins as revealed by X-ray absorption spectroscopic analysis and its evolutionary implications"J. Biol. Chem.. 274. 23160-23168 (1999)
Cosper, N. J.:“通过 X 射线吸收光谱分析揭示古菌含锌铁氧还蛋白中孤立锌位点的结构保守性及其进化意义”J.
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
共 9 条
生理活性物質による共有結合修飾を受けたmitoNEETレドックス機能の解明
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批准号:23K04951
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2023
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负责人:岩崎 俊雄
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依托单位:
細胞増殖に関わる細菌型mitoNEETの生体内レドックス制御システムの網羅的解析
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批准号:14F04415
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2014
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负责人:岩崎 俊雄
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依托单位:
細菌型mitoNEET新規構造に立脚したレドックスシステム生理学的解析
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批准号:21659111
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$1.86万
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财政年份:2009
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负责人:岩崎 俊雄
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依托单位:
超好熱菌の新規呼吸鎖複合体IIのサブユニット会合に伴う機能変換
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批准号:15770088
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.86万
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财政年份:2003
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负责人:岩崎 俊雄
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依托单位:
一酸化窒素合成酵素活性中心の構造機能解析
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批准号:11780455
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:岩崎 俊雄
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依托单位:
一酸化窒素合成酵素(複合ヘムフラビン蛋白質)の機能解析
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批准号:08780599
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1996
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负责人:岩崎 俊雄
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依托单位:
海外基金