光合成反応におけるエネルギー変換の量子化学

光合作用反应能量转换的量子化学

• 批准号: 12042245
• 负责人: 長谷川 淳也
• 金额: $ 1.02万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12042245/
• 关键词: 光合成反応中心; 電子移動; 量子化学; 密度汎関数法; 電子親和力; 構造緩和

光合成反応中心におけるbacteriopheophytin(H)からubiquinone(UQ)への電子移動について、反応に伴う構造緩和と蛋白が色素の電子状態に及ぼす影響について量子化学的方法を用いて研究した。種々の方法と基底関数を試験し、電子親和力の計算には密度汎関数法、6-31+g基底関数を採用した。構造最適化には6-31+g^*基底関数を用いている。気相中ではmenaquinone(MQ)、UQの電子親和力はHより小さく電子が移動する方向と矛盾する結果を与えるが、蛋白の効果を含めると、電子親和力は気相中より30kcal/mol程度大きくなり、Hの電子親和力を上回り、現象を説明できる結果を与えることがわかった。即ち、蛋白が色素の電子親和力を調節し、電子移動に重要な役割を果たしている事が明らかになった。これはquinoneのアニオンでは酸素原子に大きな負電荷が生じ、蛋白からの水素結合がこれを安定化していることによる。次に電子移動の後の色素の構造緩和について研究した。まず、色素の気相中における構造緩和を調べると、アニオン状態ではSOMOの軌道の性質に由来した構造変化が見られたが、変化の大きさ自体は小さかった。次に周辺アミノ酸残基を加えて、結合サイト中での色素と水素結合しうるプロトンの構造変化を調べた。アニオン状態の色素は水素結合距離がより短くなるよう、蛋白の極性残基の方向に約0.2Å移動するが、色素自体、プロトンの位置に大きい変化は見られなかった。最後に、QM/MM法で電子移動の各状態の蛋白の全構造を最適化したところ、アニオン状態では色素はより強く水素結合するよう移動するが、蛋白の溶媒和構造の変化、蛋白全体の構造変化は小さいことが分かった。以上により、本研究では電子移動後による主な構造変化は結合サイト中での色素の移動である事が分かった。本研究で求めた、構造を用いて反応熱を計算したところ、実験で算出されている値によく一致するものが得られた。反応熱を解析したところ、反応の駆動力は主に色素の電子親和力にあるという結果を得た。

Photosynthetic anti 応 center に お け る bacteriopheophytin (H) か ら ubiquinone (UQ) へ の electronic mobile に つ い て, anti 応 に with ease う structure と protein が の electronic state に and pigment ぼ す influence に つ い て quantum chemistry method を use い て research し た. There are several 々 <s:1> methods, including と basis number を experiments, に calculation of electron affinity <e:1>, に density universal number method, and 6-31+g basis number を using た た. To construct the optimal に に 6-31+g^* base number を, use に て る る. 気 phase で は menaquinone (MQ), UQ の electron affinity は H よ り small さ く electronic が mobile す る direction と contradiction す る results を and え る が, protein の unseen fruit contains を め る と, electron affinity は 気 phase よ り kcal/mol, 30 degree big き く な り, H の electron affinity を り last time, phenomenon を で き る results Youdaoplaceholder0 and える とがわ とがわ った った. Namely ち, protein が の electron affinity を adjust し pigment, electronic mobile に important な "を cut fruit た し て い る matter が Ming ら か に な っ た. こ れ は quinone の ア ニ オ ン で は acid element atoms に big き な negative が じ, protein か ら の water element combination が こ れ を stabilization し て い る こ と に よ る. After the に electron movement <s:1>, the construction of the subsequent <s:1> pigment <e:1> is mitigated. Youdaoplaceholder1 た て て research on <s:1> た た. ま ず, pigment の 気 phase に お け る structure ease を adjustable べ る と, ア ニ オ ン state で は SOMO の orbit の nature に origin し た structure - the が see ら れ た が, - の big き さ autologous は small さ か っ た. Week time に 辺 ア ミ ノ acid residues を plus え て, combined サ イ ト in で の pigment と water element combination し う る プ ロ ト ン の structure variations change を adjustable べ た. ア ニ オ ン state の pigment は water element combined with distance が よ り short く な る よ う, の polar residues of protein に の direction is about 0.2 A mobile す る が, pigment of autologous, プ ロ ト ン の position に big き い variations change は see ら れ な か っ た. Finally に, QM/MM method で electronic mobile の status の protein の を whole structure optimization し た と こ ろ, ア ニ オ ン state で は pigment は よ り strong く water element combination す る よ う mobile す る が, protein の solvent and tectonic の variations, all の protein structure - は small さ い こ と が points か っ た. Above に よ り, this study で は electronic mobile after に よ る main な structure variations change は with サ イ ト in で の pigment の mobile で あ る matter が points か っ た. This study で o め た, tectonic を い て anti 応 hot を computing し た と こ ろ, be 験 で calculate さ れ て い る numerical に よ く consistent す る も の が must ら れ た. Anti 応 thermal analytical し を た と こ ろ, anti 応 の 駆 power は main に pigment の electron affinity に あ る と い た を う results.

项目成果

J.Hasegawa: "Ground state structure of CuO_2 : a CASPT2 study"Chemical Physics Letters. 335. 503-509 (2001)

J.Hasekawa：“CuO_2 的基态结构：CASPT2 研究”化学物理快报。