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DNA2重螺旋におけるCircular Dichroismの理論分光

DNA2重螺旋におけるCircular Dichroismの理論分光
DNA双螺旋圆二色性的理论光谱
批准号:
19029023
负责人:
長谷川 淳也
金额:
$1.02万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 --

项目摘要

项目成果

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量子・古典論を組み合わせた計算手法を開発し、同方法を光機能性蛋白質の励起状態に応用した。レチナール蛋白質はヒトの視覚やバクテリアのプロトンポンプ等で重要な機能を果たすが、蛋白質の環境に応じて、大きく光吸収エネルギーを変化させることが知られている。今回、我々の方法によりレチナール蛋白質の光吸収エネルギーを定量的かつ系統的に計算することに初めて成功した。これにより、レチナール蛋白質の光吸収特性に関する定量的な解析を行うことができた。種々のレチナール蛋白質における励起エネルギーを色素の構造ひずみ、蛋白質の静電的環境、カウンターイオンとの量子的相互作用の3点に分割して解析を行った。その結果、蛋白質との静電的な相互作用がスペクトル・チューニングに最も重要な役割を果たすことが明らかになった。レチナール蛋白質の励起状態は分子内電荷移動性が強いため、蛋白質による静電的な環境を敏感に反映する。レチナール結合サイトの静電環境は蛋白質により異なるため、多様な光吸収エネルギー示す原因になっている。蛍の蛍光色は発色団であるオキシルシフェリンによる。オキシルシフェリンの発光色は化学発光に関する実験結果を基に、ケト・エノール互変異性により説明されてきた。しかし、近年、エノール型への変換が抑制されたケト型オキシルシフェリンの生物発光において、通常の黄緑色発光が観測されて、従来説が疑問視されてきた。我々の方法を蛍の発光に応用し、北アメリカ蛍のケト型ルシフェリンが、化学発光では赤色、生物発光では黄緑色発光することを理論計算により示した。基底・励起状態の電荷分布と蛋白質の静電ポテンシャルの相互作用が発光色の変化に重要な寄与をしていることが明らかになった。更にこの結果を基に、ルシフェリンの分子設計を行った。アミノ酸残基を置換することにより活性中心の静電場を制御し、赤オレンジ色の発色を示すと期待されるミューテーション実験を提案した。
期刊论文(15)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Color-tuning in Photobiology: A SAC-CI study(招待講演)
光生物学中的色彩调节:SAC-CI 研究(特邀演讲)
DOI: --
发表时间: 2007
期刊:
影响因子: --
作者: [H.Nakashima, J.Hasegawa, H.Nakatsuji, J. Hasegawa, 長谷川淳也, J. Hasegawa, 長谷川淳也, J. Hasegawa, J. Hasegawa, J. Hasegawa]
通讯作者: J. Hasegawa
紅色光合成細菌の反応中心の励起状態と電子移動:電子理論による研究(依頼講演)
紫色光合细菌反应中心激发态与电子转移:基于电子理论的研究(特邀报告)
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [H.Nakashima, J.Hasegawa, H.Nakatsuji, J. Hasegawa, 長谷川淳也]
通讯作者: 長谷川淳也
Exploring Photobiology with the SAC-CI method(招待講演)
用 SAC-CI 方法探索光生物学(特邀演讲)
DOI: --
发表时间: 2007
期刊:
影响因子: --
作者: [H.Nakashima, J.Hasegawa, H.Nakatsuji, J. Hasegawa, 長谷川淳也, J. Hasegawa, 長谷川淳也, J. Hasegawa, J. Hasegawa, J. Hasegawa, J. Hasegawa]
通讯作者: J. Hasegawa
Exploring Photo-Biology and Bio-Spectroscopy with the SAC-CI (Symmetry-Adapted Cluster-Configuration Interaction) Method
使用 SAC-CI(对称自适应簇配置相互作用)方法探索光生物学和生物光谱学
DOI: --
发表时间: 2008
期刊: Radiation Induced Molecular Phenomena in Nucleic Acid: A Comprehensive Theoretical and Experimental Analysis (印刷中)
影响因子: --
作者: [R., Ishikawa, J. Hasegawa and H. Nakatsuji]
通讯作者: J. Hasegawa and H. Nakatsuji
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    波動関数理論を活用する化学反応ポテンシャル面の高精度化:反応座標分離アプローチ
    • 批准号:
      23K17898
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额:
      $4.16万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      長谷川 淳也
    • 依托单位:
    Development of Reaction Concepts and Computational Methods for Chemical Reactions under Mechanochemical Stimulations
    • 批准号:
      20H02685
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.32万
    • 财政年份:
      2020
    • 负责人:
      長谷川 淳也
    • 依托单位:
    光生物学における分子理論の展開:励起状態理論の開発を基盤として
    • 批准号:
      20038026
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $2.05万
    • 财政年份:
      2008
    • 负责人:
      長谷川 淳也
    • 依托单位:
    水素吸蔵の量子的原理:新規材料設計への展開
    • 批准号:
      18033029
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $1.09万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      長谷川 淳也
    • 依托单位:
    海外基金