Y染色体の多様性に関連した肥満・糖尿病の遺伝的要因の研究

肥胖和糖尿病的Y染色体多样性相关遗传因素研究

• 批准号: 12204083
• 负责人: 中堀 豊
• 金额: --
• 依托单位: The University of Tokushima
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12204083/
• 关键词: Y染色体; 肥満; 糖尿病; SNPs; USP9Y遺伝子

我々はY染色体の構造の多様性と男性の表現型の関連に興味を抱いてきた。特に日本人の男性のY染色体が3種類のDNA多型を用いることで4種類のハプロタイプに分類できることを明かにし,精子数を含むいくつかの表現型がこれらのハプロタイプと関連することを示してきた。本研究では,現在までの成果を踏まえ,日本人集団でY染色体上のSNPや他のDNAマーカーを収集し,Y染色体上に想定される肥満・糖尿病関連遺伝子または遺伝子群を同定することを目的としている。今年度はY染色体上のSNPsを収集することに重点を置いた。ハプロタイプIからIVのY染色体を持つ4人分の男性ゲノムDNAを混合したものを7セット準備し,Y染色体上の合計100種類のSTSについてPCR-DHPLC解析を行った。その結果,日本人男性Y染色体全体の50%近くを占めるハプロタイプをさらにIα,Iβの2種類に分類可能となった。IαおよびIβがハプロタイプIに占める頻度はおのおの約50%程度であった。またUSP9Y遺伝子のArg211Cys多型がハプロタイプIIに特異的に認められた。今回の研究で日本人Y染色体上に2種類の新規SNP候補が見いだされた。しかしながら,いずれも複数コピーをなして存在するY染色体領域に存在することが予想され,塩基配列の決定は困難であった。一方で,新たにハプロタイプIが2種類に分類できたことで,より詳細に男性の表現型とY染色体ハプロタイプとの関連が解析できるようになり,現在解析を進行中である。USP9Yは脱ユビキチン化酵素であり,タンパク質代謝に重要な役割を担っていると予想される。Arg211Cys多型の意義について発現実験等で検討する必要がある。我々のSTSマーカーは200bp以下のものが多く,これがSTSの数に比して,SNPsが少なかった原因の一つと考えた。

The structure of the Y chromosome is diverse and the phenotype of the male is related to the interest of the female. In particular, Japanese men have three types of DNA polytypes on the Y chromosome, four types of DNA polytypes on the Y chromosome, and sperm counts on the Y chromosome. The results of this study are based on the Japanese population's ability to identify SNPs and other DNA sequences on the Y chromosome and to identify diabetes-related genes on the Y chromosome. This year, SNPs on the Y chromosome are collected and focused. PCR-DHPLC analysis was performed on the Y chromosome with a total of 100 STS species. As a result, 50% of the total Y chromosome in Japanese males is nearly accounted for by Iα,Iβ and 2 types of classification. IαUSP9Y gene Arg211Cys polytype II In this study, two new SNP candidates on the Japanese Y chromosome were identified. There is no easy way to determine the sequence of the Y chromosome. A party, new USP9Y is an important enzyme for metabolism. Arg211Cys polytype significance, such as the development of the necessary discussion The number of STS is less than 200bp, and the reason why SNPs are less than 200bp is a test.

项目成果

Ewis,A.: "Occupational cancer genetics : Infrequent ras oncogenes point mutations in lung cancer samples of chromate workers."Amer.J.Industrial Med..

Ewis,A.：“职业癌症遗传学：铬酸盐工人肺癌样本中罕见的 ras 致癌基因点突变。”Amer.J.工业医学..

Shinka,T.: "A rapid and simple method for sex identification by analysis of a heteroduplex using denaturing high performance liquid chromatography(DHPLC)."J Hum Genet..

Shinka,T.：“一种通过使用变性高效液相色谱 (DHPLC) 分析异源双链体来进行性别鉴定的快速而简单的方法。”J Hum Genet..

Lee, J.W.: "Y-chromosome compound haplotypes with the microsatellite markers DXYS265, DXYS266, and DXYS241"J.Hum.Genet.. 46. 80-84 (2001)

Lee, J.W.：“带有微卫星标记 DXYS265、DXYS266 和 DXYS241 的 Y 染色体复合单倍型”J.Hum.Genet.. 46. 80-84 (2001)

Tomomasa, H.: "Pericentric inversion of the Y chromosome of infertile male"Archives of Andrology. 45. 181-185 (2000)

Tomomasa, H.：“不育男性 Y 染色体的着丝粒倒位”男科学档案。