Y染色体の多様性に関連した肥満・糖尿病の遺伝的要因の研究

肥胖和糖尿病的Y染色体多样性相关遗传因素研究

• 批准号: 13204064
• 负责人: 中堀 豊
• 金额: $ 4.8万
• 依托单位: The University of Tokushima
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13204064/
• 关键词: Y染色体; SNP; 糖尿病; 肥満; DHPLC; biallelicマーカー; 日本人集団; ハプロタイプ

<背景と目的>我々はY染色体の構造の多様性と男性の表現型の関連に興味を抱いてきた.特に日本人の男性のY染色体が3種類のDNA多型を用いることで4種類のハプロタイプに分類できることを明らかにし,精子数を含むいくつかの表現型がこれらのハプロタイプと関連することを示してきた.本研究では,日本人集団でY染色体上のSNPや他のDNAマーカーを収集し,Y染色体上に想定される肥満・糖尿病関連遺伝子または遺伝子群を同定することを目的とする.<検討結果>今年度はY染色体上のSNPs(single mucleotide polymorphism)を収集することに重点を置いた.特に10個の遺伝子のプロモーター領域および5'UTRのSNPsの検索を進めた.ハプロタイプIからIVのY染色体を持つ男性のゲノムDNAを合計28人分用いて,PCR-DHPLC解析を行った.その結果,新たにTB4Y(thymosinβ4Y)遺伝子のプロモーター領域に存在する,転写因子NF-ATの結合部位にTからCへの塩基置換を見出した.このTalleleは我々が以前にハプロタイプIIと分類したタイプのY染色体で見出された.このSNPは制限酵素MluIの認識部位に存在していた.TB4Yは免疫応答に関与する遺伝子であるが,この多型によって他の何らかの細胞生物学的応答性が異なる可能性がある.現在TB4Yプロモーター上のこのSNPの意義を検討するために,ルシフェラーゼをレポーターとした転写活性の測定を行っている.さらに他のbiallelic DNAマーカーとの組み合わせによって全体で7種類のY染色体ハプロタイプが構築できた.これらのハプロタイプに特徴的なY染色体上の遺伝子構造を明らかにすることで,Y染色体上に想定される肥満・糖尿病関連遺伝子または遺伝子群に迫ることができると考えている.

<Background and Purpose> I am interested in the relationship between the structural diversity of the Y chromosome and the male phenotype. In particular, Japanese men have three types of DNA polymorphisms on the Y chromosome, four types of DNA polymorphisms, and sperm count, including three phenotypes. The purpose of this study was to identify SNPs and other DNA markers on the Y chromosome in the Japanese population, and to identify genes associated with diabetes mellitus on the Y chromosome. This year, SNPs(single nucleotide polymorphism) on the Y chromosome were collected and focused. In particular, the detection of SNPs in the 5'UTR of the 10 SNPs in the domain of the 5'UTR is progressing. A total of 28 DNA samples were analyzed by PCR-DHPLC. As a result, the new TB4Y (thymosinβ 4Y) gene was found to exist in the domain of T, C and T, which were the binding sites of NF-AT. The Tallele was born on the Y chromosome. The SNP is present at the site of recognition of the restriction enzyme MluI. TB4Y is associated with immune response and genetic variation, and the polymorphism of the SNP is likely to be different in cell biology. Now the significance of this SNP on TB4Y is discussed. The biallelic DNA of the seven species of Y chromosome was constructed. The gene structure on the Y chromosome is characterized by the presence of a gene on the Y chromosome, and the gene structure on the Y chromosome is characterized by the presence of a gene on the Y chromosome.

项目成果

Ewis, A.A.: "Two Y-chromosome-specific polymorphisms 12f2 and DFFRY in the Japanese population and their relations to other Y polymorphisms"J. Med. Invest.. 49(in press). (2002)

Ewis, A.A.：“日本人群中的两种 Y 染色体特异性多态性 12f2 和 DFFRY 及其与其他 Y 多态性的关系”J.

Ewis, A.A.: "Linkage between prostate cancer incidence and different alleles of the human Y-linked tetranucleotide polymorphism DYS19"J. Med. Invest.. 49(in press). (2002)

Ewis, A.A.：“前列腺癌发病率与人类 Y 连锁四核苷酸多态性 DYS19 的不同等位基因之间的联系”J。

Lee, J.W.: "Y-chromosome compound haplotypes with the microsatellite markers DXYS265, DXYS266 and DXYS241"J Hum Genet.. 46. 80-84 (2001)

Lee, J.W.：“带有微卫星标记 DXYS265、DXYS266 和 DXYS241 的 Y 染色体复合单倍型”J Hum Genet.. 46. 80-84 (2001)

Jabasini, M.: "Fast Analysis of DNA Polymorphims on the Human Y Chromosome by Using Microchip Electrophoresis"Electrophoresis. 23(in press). (2002)

Jabasini, M.：“使用微芯片电泳快速分析人类 Y 染色体上的 DNA 多态性”电泳。

Shinka, T.: "A rapid and simple method for sex identification by analysis of a heteroduplex using denaturing high performance liquid chromatography (DHPLC)"J Hum Genet.. 46. 263-266 (2001)

Shinka, T.：“通过使用变性高效液相色谱 (DHPLC) 分析异源双链体来进行性别鉴定的快速且简单的方法”J Hum Genet.. 46. 263-266 (2001)