Untersuchung von Oxidoreduktasen des Chinon- und Flavocytochromtyps mit Methoden der Bioinformatik und der Biophysikalischen Chemie

使用生物信息学和生物物理化学方法研究醌和黄细胞色素类型的氧化还原酶

• 批准号: 5307122
• 负责人: Dr. Ralf Schmid
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Physikalische Chemie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Fellowships
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2000-12-31 至 2002-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5307122?language=en
• 关键词: Untersuchung; von; Oxidoreduktasen; des; Chinon

Bakterielle Fumaratreduktasen katalysieren die Elektronenübertragung von Hydrochinonen des Chinonpools auf Fumarat. Ein Kernziel des beantragten Projekts ist das Verständnis der Funktionsweise der Fumaratreduktase Flavocytochrom c3 (Fcc3) aus Shewanella frigidimarina. Dieser fehlt, trotz hoher Sequenzhomologie zu anderen bakteriellen Fumaratreduktasen, der membranständige, chinonbindende Proteinteil. Das somit erforderliche eletronenliefernde Partnerprotein von Fcc3 ist noch nicht bekannt. Die zunehmende Zahl aufgeklärter Strukturen von chinonenthaltenden Redoxproteinen erlaubt es, durch Anwendung von Methoden der Bioinformatik, die charakteristischen Proteinsequenzen für verschiedene Typen von Chinonbindungsstellen zu ermitteln. dies ermöglicht die Identifizierung von unbekannten Chinonbindungsstellen und chinonbindenden Proteinen, wie z.B. dem Partnerprotein von Fcc3. Für mechanistische Studien des Elektronentransfers und der Fumaratreduktion soll ein jüngst für Cytochrom-P450-Proteine etabliertes Verfahren Anwendung finden. Dieses erlaubt durch Bestrahlen mit langwelliger Röntgenstrahlung Reduktionsschritte am Proteinkristall zu initiieren, und somit die Struktur verschiedener Zwischenstufen zu studieren. Mit dieser Methode sollen zunächst verschiedene Flavocytochrome des P-450-Typs untersucht werden. Die experimentellen Befunde sollen durch umfassende theoretische Untersuchungen (Biomolekulares Modelling) ergänzt werden. Die hierbei gewonnenen Erfahrungen sollen dann für die Aufklärung des katalytischen Mechanismus von Fcc3 genutzt werden.

Bakterielle Fumaratreduktasen katalysieren die Elektronenübertragung von Hydrochinonen des Chinonpools auf Fumarat。 Ein Kernziel des beantragten Projekts ist das Verständnis der Fumaratreduktase Flavocytochrom c3 (Fcc3) aus Shewanella frigidimarina. Dieser fehlt, trotz hoher Sequenzhomologie zu anderen bakteriellen Fumaratreduktasen, der membranständige, chinonbindende Proteinteil. Fcc3 的伴侣蛋白的全部功能是不存在的。氧化还原蛋白的结构分析，是生物信息学方法的研究，是蛋白质序列的通用类型，是一种基于化学结合的蛋白质序列。 dies ermöglicht die Identifizierung von unbekannten Chinonbindungsstellen und chinonbindenden Proteinen, wie z.B. dem 伙伴蛋白 von Fcc3。对于 Cytochrom-P450-Proteine etabliertes Verfahren Anwendung finden 中的电子传输和 Fumaratreduktion 机械研究。最好将其与 langwelliger Röntgenstrahlung Reduktionsschritte am Proteinkristall zu initiieren 一起使用，并要求学生进行结构优化。使用 P-450-Typs 黄细胞色素方法解决这一问题。实验是通过理论分析来解决的（生物分子建模）。在此之前，我们将讨论 Fcc3 的启动机制。