DNA多型を用いたギンブナの進化と多様化に関する研究

利用DNA多态性研究银鱼的进化和多样化

• 批准号: 01J07163
• 负责人: 大原 健一
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: Lake Biwa Museum (2002-2003)Lake Biwa Environmental Research Institute (2001)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 2003
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-01J07163/
• 关键词: マイクロサテライトDNA; ギンブナ; クローン; 遺伝的多様性; ヨシノボリ; mtDNA; Carassius; Rhinogobius; Aphyocypris chinensis; Allozyme; Endangered secies; Genetic diversity; Cyprinid fish; G-C distance; Recombination; Carassus

ギンブナ集団構造を解析するために高感度DNA多型マーカーを用いてクローン構成の解明を試みた。日本の6地点、琵琶湖、高知、鳥取県湖山池、新潟県福島潟、千葉県印旛沼、茨城県霞ヶ浦より採集したギンブナのクローン構成について調査した。ギンブナはすべての地点で複数のクローンからなる混合クローン集団を構成していた。それらの中にそれぞれの地点で特異的なクローンと、2地点以上の地域に認められる共通クローンが存在していた。総クローン数は61系統であり、そのうち14系統が共通クローンであった。共通クローンの多く(13/14)が琵琶湖で確認されたことから、共通クローンは琵琶湖を中心として分布していることが示された。琵琶湖水系のトウヨシノボリRhinogobius sp.ORとビワヨシノボリRhinogobius sp.BWの遺伝的変異を,D-loop領域を含むミトコンドリアDNAの制限酵素断片長多型(RFLP)法により調査した。ビワヨシノボリは2沿岸域から採集された。両型は同一のハプロタイプを全く共有していなかったことから,RFLP法は両型を区別するめに効果的であることが示唆された。トウヨシノボリのハプロタイプ多様度(0.214-0.543)はビワヨシノボリ(0.543-0.682)よりも低かった。ビワヨシノボリおよびトウヨシノボリにおいて地域間のハプロタイプ頻度に違いは見られなかった。この結果から,トウヨシノボリではこれらの地点間に頻繁な遺伝子流動が存在しており,そして琵琶湖水系のトウヨシノボリは1つの個体群から構成されていることが示唆される。トウヨシノボリ(R.sp OR)は極めて多くの色彩変異を含んでいるが、それらの遺伝的な関係は不明のままである。トウヨシノボリから13個のマイクロサテライトプライマーを設計した。それらすべてに高い変異性が認められ、2〜17個のalleleが検出された。ヘテロ接合体率は、0.1〜0.9であった。1つを除いて、すべてのマーカー座でHardy-Weinberg equilibriumからの有意なずれは検出されなかった。

ギンブナ団structural analysis するために High-sensitivity DNA polytype マーカーを いてクローン constitute の Explain を test みた. 6 places in Japan, Lake Biwa, Kochi, Tottori Prefecture Lake Sanchi, Niigata Prefecture Fukushima Lago, Chiba Prefecture Seal Banner Numa, Ibaraki Prefecture Kasumi Ura Yura collected and collected the information and made the survey.ギンブナはすべてのlocationでpluralのクローンからなるmixedクローン集団を composedしていた. There is a unique location-specific Nakano in Nakano, and there is a common Nakano that exists in areas with more than 2 locations.総クローンは61 system であり, そのうち14 system がshared クローンであった. Common クローンの多く(13/14)が琵琶湖でconfirmationされたことから, common クローンはPipa Lake をcenter として distribution していることが Show された. Lake Biwa Water System Rhinogobius sp.OR Rhinogobius The difference of sp.BW's legacy was investigated using the restricted restriction enzyme fragment long polytype (RFLP) method of DNA in the field of D-loop.ビワヨシノボリは2 Coastal area collection された.両typeは同のハプロタイプを全くshareしていなかったことから, The RFLP method has a different type and a different effect.トウヨシノボリのハプロタイプ多様degree(0.214-0.543)はビワヨシノボリ(0.543-0.682)よりもlowかった.ビワヨシノボリおよびトウヨシノボリにおいて地The domain's frequency is the same as the frequency of the domain.このRESULTS から, トウヨシノボリではこれらの に frequent な伝子流がexistent しており between locations,そしてふいることが のトウヨシノボリは1つのIndividual group から constitutes されていることが时攆される.トウヨシノボリ (R.sp OR) は极めて多くの色変different を contain んでいるが, それらの伝's な relationship is unknown のままである.トウヨシノボリから13のマイクロサテライトプライマーを design した.それらすべてに高い変 heterosexual recognition められ, 2~17 のallele 検出された. The ratio of ヘテロ joint body is 0.1~0.9. 1つを出いて、すべてのマーカーseatでHardy-Weinberg equilibriumからの意なずれは検出されなかった.

项目成果

Ohara K, D Takahashi, M Takagi: "Isolation of microsatellite loci in the freshwater goby, Rhinogobius sp. (Gobiidae)"Molecular Ecology Notes. in press.

Ohara K、D Takahashi、M Takagi：“淡水虾虎鱼、Rhinogobius sp.（Gobiidae）中微卫星位点的分离”分子生态学笔记。

Ohara K, N Taniguchi: "Preliminary study on genetic diversity evaluated by eleven microsatellite makers in Kuromejina, Girella leonina and Mejina, G.punctata"Fisheries Science. 69. 861-863 (2003)

Ohara K, N Taniguchi：“由 Kuromejina、Girella leonina 和 Mejina, G.punctata 的 11 个微卫星制造商评估的遗传多样性初步研究”渔业科学。

Ohara K, T Ariyoshi, E Sumida, N Taniguchi: "Clonal Diversity in the Japanese Silver Crucian Carp, Carassius langsdorfii inferred from Genetic markers"Zoological Science. 20. 797-804 (2003)

Ohara K、T Ariyoshi、E Sumida、N Taniguchi：“从遗传标记推断的日本银鲫、Carassius langsdorfii 的克隆多样性”动物学科学。

Takahashi D, K Ohara: "Genetic variations estimated from PCR-RFLP analysis on the freshwater goby Rhinogobius in Lake Biwa"Ichthyological Research. in press.

Takahashi D、K Ohara：“通过对琵琶湖淡水虾虎鱼 Rhinogobius 进行 PCR-RFLP 分析估计的遗传变异”鱼类学研究。

Ohara, K., M.Takagi, Y.Kaneko, M.Takai: "Allozymic variation in an endangered Japanese minnow, Aphyocypris chinensis"Ichthyological Research. 50. 86-89 (2003)

Ohara, K.、M.Takagi、Y.Kaneko、M.Takai：“濒临灭绝的日本米诺鱼 Aphyocypris chinensis 的异酶变异”鱼类学研究。