DNA多型を用いたギンブナの進化と多様化に関する研究

利用DNA多态性研究银鱼的进化和多样化

• 批准号: 01J07163
• 负责人: 大原 健一
• 金额: $ 2.3万
• 依托单位: Lake Biwa Museum (2002-2003)Lake Biwa Environmental Research Institute (2001)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 2003
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-01J07163/
• 关键词: マイクロサテライトDNA; ギンブナ; クローン; 遺伝的多様性; ヨシノボリ; mtDNA; Carassius; Rhinogobius; Aphyocypris chinensis; Allozyme; Endangered secies; Genetic diversity; Cyprinid fish; G-C distance; Recombination; Carassus

ギンブナ集団構造を解析するために高感度DNA多型マーカーを用いてクローン構成の解明を試みた。日本の6地点、琵琶湖、高知、鳥取県湖山池、新潟県福島潟、千葉県印旛沼、茨城県霞ヶ浦より採集したギンブナのクローン構成について調査した。ギンブナはすべての地点で複数のクローンからなる混合クローン集団を構成していた。それらの中にそれぞれの地点で特異的なクローンと、2地点以上の地域に認められる共通クローンが存在していた。総クローン数は61系統であり、そのうち14系統が共通クローンであった。共通クローンの多く(13/14)が琵琶湖で確認されたことから、共通クローンは琵琶湖を中心として分布していることが示された。琵琶湖水系のトウヨシノボリRhinogobius sp.ORとビワヨシノボリRhinogobius sp.BWの遺伝的変異を,D-loop領域を含むミトコンドリアDNAの制限酵素断片長多型(RFLP)法により調査した。ビワヨシノボリは2沿岸域から採集された。両型は同一のハプロタイプを全く共有していなかったことから,RFLP法は両型を区別するめに効果的であることが示唆された。トウヨシノボリのハプロタイプ多様度(0.214-0.543)はビワヨシノボリ(0.543-0.682)よりも低かった。ビワヨシノボリおよびトウヨシノボリにおいて地域間のハプロタイプ頻度に違いは見られなかった。この結果から,トウヨシノボリではこれらの地点間に頻繁な遺伝子流動が存在しており,そして琵琶湖水系のトウヨシノボリは1つの個体群から構成されていることが示唆される。トウヨシノボリ(R.sp OR)は極めて多くの色彩変異を含んでいるが、それらの遺伝的な関係は不明のままである。トウヨシノボリから13個のマイクロサテライトプライマーを設計した。それらすべてに高い変異性が認められ、2〜17個のalleleが検出された。ヘテロ接合体率は、0.1〜0.9であった。1つを除いて、すべてのマーカー座でHardy-Weinberg equilibriumからの有意なずれは検出されなかった。

ギ ン ブ ナ set 団 tectonic analytical す を る た め に Gao Gan degrees of DNA polymorphism マ ー カ ー を with い て ク ロ ー ン constitute の interpret を try み た. Japan の 6 location, pipa lake, kochi, birds take 県 lake mountain pool, niigata 県 fukushima lagoon, chiba 県 printed Fan bogs, ibaraki 県 chardonnay ヶ pu よ り acquisition し た ギ ン ブ ナ の ク ロ ー ン constitute に つ い て survey し た. ギ ン ブ ナ は す べ て の site で plural の ク ロ ー ン か ら な る mixed ク ロ ー ン set 団 を constitute し て い た. In そ れ ら の に そ れ ぞ れ の site で specific な ク ロ ー ン と, more than 2 locations の regional に め ら れ る common ク ロ ー ン が exist し て い た. The number of 総, ロ, ロ, <e:1> is 61. The system であ であった and the system そ, うち, うち are 14. The system が is common to ロ ロ, <e:1>, であった and であった. More than common ク ロ ー ン の く (13/14) が pipa lake で confirm さ れ た こ と か ら, common ク ロ ー ン は pipa lake を center と し て distribution し て い る こ と が shown さ れ た. Pipa lake is の ト ウ ヨ シ ノ ボ リ Rhinogobius sp. The OR と ビ ワ ヨ シ ノ ボ リ Rhinogobius sp. BW の を but 伝 -, D - loop area contains を む ミ ト コ ン ド リ ア DNA break the limitations の enzyme method (RFLP) of running polymorphism に よ り survey し た. Youdaoplaceholder0 ビワヨシノボリ 2 collect された along the coast ら. Type that struck the same の は ハ プ ロ タ イ プ を across く し て い な か っ た こ と か ら, RFLP method は type that struck を difference す る め に unseen fruit で あ る こ と が in stopping さ れ た. ト ウ ヨ シ ノ ボ リ の ハ プ ロ タ イ プ others more degrees (0.214 0.543) は ビ ワ ヨ シ ノ ボ リ (0.543 0.682) よ り も low か っ た. Youdaoplaceholder0 ビワヨシノボリおよびトウヨシノボリにお て the frequency of <s:1> ハプロタ プ プ between regions and に the frequency of プ is different from that of られな られな った. こ の results か ら, ト ウ ヨ シ ノ ボ リ で は こ れ ら の location between に frequent な heritage 伝 son flow exist が し て お り, そ し て pipa lake is の ト ウ ヨ シ ノ ボ リ は 1 つ の individual group of か ら constitute さ れ て い る こ と が in stopping さ れ る. ト ウ ヨ シ ノ ボ リ (R.s p OR) は extremely め て more く の colour - contains different を ん で い る が, そ れ ら の but 伝 な masato is unknown は の ま ま で あ る. Youdaoplaceholder0 ら ら13 <s:1> た ロサテラ ロサテラ ロサテラ ロサテラ トプラ トプラ を を を を を を design た た. Youdaoplaceholder0 high それらすべてに variability が recognize められ, 2 to 17 <s:1> alleles が検 out された. Youdaoplaceholder0 combination ratio ヘテロ, 0.1 to 0.9であった. 1 つ を except い て, す べ て の マ ー カ ー seat で Hardy - Weinberg equilibrium か ら の intentionally な ず れ は 検 out さ れ な か っ た.

项目成果

Ohara K, D Takahashi, M Takagi: "Isolation of microsatellite loci in the freshwater goby, Rhinogobius sp. (Gobiidae)"Molecular Ecology Notes. in press.

Ohara K、D Takahashi、M Takagi：“淡水虾虎鱼、Rhinogobius sp.（Gobiidae）中微卫星位点的分离”分子生态学笔记。

Ohara K, N Taniguchi: "Preliminary study on genetic diversity evaluated by eleven microsatellite makers in Kuromejina, Girella leonina and Mejina, G.punctata"Fisheries Science. 69. 861-863 (2003)

Ohara K, N Taniguchi：“由 Kuromejina、Girella leonina 和 Mejina, G.punctata 的 11 个微卫星制造商评估的遗传多样性初步研究”渔业科学。

Ohara K, T Ariyoshi, E Sumida, N Taniguchi: "Clonal Diversity in the Japanese Silver Crucian Carp, Carassius langsdorfii inferred from Genetic markers"Zoological Science. 20. 797-804 (2003)

Ohara K、T Ariyoshi、E Sumida、N Taniguchi：“从遗传标记推断的日本银鲫、Carassius langsdorfii 的克隆多样性”动物学科学。

Takahashi D, K Ohara: "Genetic variations estimated from PCR-RFLP analysis on the freshwater goby Rhinogobius in Lake Biwa"Ichthyological Research. in press.

Takahashi D、K Ohara：“通过对琵琶湖淡水虾虎鱼 Rhinogobius 进行 PCR-RFLP 分析估计的遗传变异”鱼类学研究。

Ohara, K., M.Takagi, Y.Kaneko, M.Takai: "Allozymic variation in an endangered Japanese minnow, Aphyocypris chinensis"Ichthyological Research. 50. 86-89 (2003)

Ohara, K.、M.Takagi、Y.Kaneko、M.Takai：“濒临灭绝的日本米诺鱼 Aphyocypris chinensis 的异酶变异”鱼类学研究。