NMR Investigations of the Molecular Regulation of Proteinase 3c from Picorna Viruses

小核糖核酸病毒蛋白酶 3c 分子调控的 NMR 研究

• 批准号: 5310208
• 负责人: Professor Dr. Thomas Peters
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Virologie und Zellbiologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2000-12-31 至 2006-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5310208?language=en
• 关键词: NMR; Investigations; Molecular; Regulation; Proteinase

Die Chymotrypsin-ähnlichen Cystein-Proteinasen 3C spielen eine zentrale Rolle bei der Genexpression und -replikation der Picornaviren und können daher als Ziel antiviraler Therapie dienen. Ihre Bifunktionalität als Proteasen und RNA-bindende Proteine lässt vermuten, dass sie die gegenläufigen und kompetitiven Prozesse der viralen Protein- und RNA-Synthese im viralen Lebenszyklus steuern und möglicherweise als molekulare Schalter in die verschiedenen Schritte dieses Zyklus eingreifen. Atomare Details der Bindung picornaviraler RNA an Proteinase 3C sind bisher unbekannt. Insbesondere ist die gegenseitige Beeinflussung von RNA-Bindung und Bindung von Liganden im aktiven Zentrum unerforscht. Mit NMR-Experimenten soll die Bindung viraler RNA und von Liganden für das aktive Zentrum an Proteinase 3C untersucht werden. Zuerst soll die RNA-Bindungsstelle mit atomarer Auflösung lokalisiert werden, wobei auf bekannte Kristallstrukturanalysedaten zurückgegriffen werden kann. Darauf aufbauend werden mögliche allosterische Interaktionen zwischen RNA- und Ligandenbindung untersucht. Mit weiteren NMR-Experimenten sollen die bioaktiven Konformationen und die Bindungsepitope der Liganden ermittelt werden. Komplementär zu den NMR-Studien werden thermodynamische und kinetische Parameter der Bindungsreaktionen mit Hilfe von Oberflächenplasmonresonanz ermittelt. Da auch in anderen Viren wie z.B. dem Hepatitis C oder dem Adenovirus Nukleinsäure-bindende Proteasen aktiv sind, werden die gewonnenen Erkenntnisse von allgemeinem virologischen Interesse sein.

胰凝乳蛋白酶-半胱氨酸蛋白酶3C在小RNA基因表达和复制中发挥着重要作用，并可用于抗病毒治疗。由于蛋白质和RNA结合蛋白质的双功能性，病毒蛋白质和RNA合成在病毒生命中的发生和竞争过程，以及在病毒宿主中的分子迁移过程，使蛋白质和RNA结合蛋白质的功能丧失。小核糖核酸病毒RNA与蛋白酶3C结合的详细信息是未知的。在研究中心的活动中，RNA结合和配体结合的影响是不可忽视的。Mit NMR-实验解决了病毒RNA和用于激活Zentrum和蛋白酶3C的配体的结合韦尔登。只有当RNA与原子相互作用时才能结合韦尔登，这样才能对晶体结构数据进行韦尔登分析。Darauf aufbauend韦尔登mögliche allosterische Interaktionen zwischen RNA- und Ligandenbindung untersucht.通过核磁共振实验，我们可以确定配体韦尔登的生物活性构象和结合表位。NMR谱图中的韦尔登和动力学参数是通过Oberflächenplasmonresonanz的Hilfe结合的。你也可以像z.B.一样做一个女人。丙型肝炎或腺病毒核结合蛋白酶激活，韦尔登可以从所有病毒学兴趣中获得诊断。