Effiziente und Selektive Erkennung von DNS auf Oberflächen

高效、选择性地检测表面 DNS

• 批准号: 5312808
• 负责人: Professor Dr. Clemens Richert
• 金额: --
• 依托单位: Institut für Organische Chemie (IOC)
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2000-12-31 至 2003-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5312808?language=en
• 关键词: Effiziente; und; Selektive; Erkennung; von

Die massiv parallele Erkennung von DNA-Strängen durch Hybridisierung an Gegenstränge, die auf einer Oberfläche immobilisiert sind, kann durch sogenannte "DNA-Chips" erreicht werden. Diese Technik befindet sich in einer stürmischen Entwicklung und ist für die Genomforschung eine "enabling technique". Die bisher verfügbaren Chips weisen eine zu geringe Sequenz-Selektivität auf, so dass es zu erheblichen Lesefehlern kommt. Ziel der hier vorgeschlagenen Arbeit ist es, die molekulare Erkennung auf der Oberfläche von Chips besser zu verstehen und in Bezug auf die Sequenzselektivität zu optimieren. Dazu sollen modifizierte Oligonucleotidstränge auf Glasoberflächen immobilisiert werden und mit molekularen Kappen versehen werden. Zusammen mit Modifikationen im Rückgrat und den Kernbasen sollen so die Schmelzpunkte der sich bildenden Duplexen weitgehend unabhängig von dem A/T-Gehalt der involvierten Stränge gemacht werden und die wenig selektiven Basenpaarungen an den Termini der Duplexe stabilisiert werden. Weiterhin soll die nicht DNA-tragende Oberfläche des Chips so modifiziert werden, daß das Rückfalten der aufgebrachten DNA minimiert wird. Hybridisierungskinetik und Selektivitäten sollen mittels Fluoreszenzmikroskopie und quantitativer MALDI-TOF Massenspektrometrie vermessen werden. Es besteht die Hoffnung, damit die Entwicklung von "high fidelity chips" voranzutreiben.

通过杂交和基因组杂交的DNA序列的平行识别，可以通过“DNA芯片”韦尔登。这种技术被认为是一种“使能技术”。更好的芯片是一个简单的序列选择，所以这是一个很好的选择。Ziel der Schlagenen Arbeit is，die molekulare Erkennung auf der Oberfläche von Chips besser zu verstehen and in Bezug auf die Sequenzselektivität zu optimieren.因此，必须将修饰的寡核苷酸链固定在韦尔登上，并与韦尔登的分子一起作用。通过对Rückgrat和Kernbasen的修改，使双路复用器的Schmelzpunkte不受A/T-Gehalt对韦尔登的影响，并使选择性的Basenpaarungen和双路复用器稳定的终端韦尔登。然而，芯片上的DNA并没有被如此修饰韦尔登，相反，DNA被最小化的Rückfalten将被使用。混合动力学和选择性动力学解决了MALDI-TOF质谱法的快速和定量问题。这是最好的选择，因为“高保真芯片”的开发是为了更好的发展。