权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

塩基配列を精密に認識するインテリジェント核酸プローブのデザインと開発

精准识别碱基序列的智能核酸探针的设计与开发

基本信息

批准号：
13202021
负责人：
清尾康志
金额：
$ 2.94万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

「相補的な配列とは強固にハイブリダイズし、非相補的配列はこれを積極的に拒絶する」知的な新規メカニズムにより核酸プローブの塩基配列認識能を向上させる。具体的には、塩基対形成に際してダイナミックに構造変化するカルバモイル化核酸塩基をデザインした。シトシンへの応用から検討を開始し、2'-デオキシシチジンのカルバモイル化、オリゴDNAへの導入とハイブリダイゼーション特性を検討する。その後、順次アデニン塩基、グアニン塩基へ展開する。最終的には精密な塩基配列識別能を持った「インテリジェントプローブ」を創製し、ゲノム解析やゲノム機能解析技術のクオリティー向上を目指す。2001年度の計画種々のN^4-カルバモイルシトシンとそれを含むオリゴデオキシヌクレオチドを合成し、相補的DNA及びミスマッチDNAとの二重鎖形成能を測定し、N^4-カルバモイルシトシンの相補鎖識別能を評価する。得られた知見を元に、更に分子デザインを行い、二重鎖形成能および相補鎖識別能の向上をはかる。2001年度の成果種々のカルバモイルシチジン誘導体を合成し、そのコンホメーション特性を^1H-NMRスペクトルにより解析した。その結果カルバモイルシトシンが塩基対形成に伴いダイナミックに構造変化することが判った。次に合成したカルバモイルシチジンを合成DNA中に組み込み、その二重鎖形成能とミスマッチ識別能を調べた。当初の予想に反しカルバモイルシトシン誘導体はグアニンだけでなく、アデニンとも安定な塩基対を形成することが判った。この原因について計算化学的手法により解析すると、カルバモイルシトシンは通常のシトシンと比較し、イミノ型構造に互変異性しやすいことが判った。またカルバモイルシトシンの構造類縁体であるアルコキシカルボニルシトシンの塩基対形成能から、カルバモイルシトシンはアデニンと非ワトソンクリック型塩基対を形成する可能性も示唆された。

"Complementary alignment and strong alignment, non-complementary alignment and positive rejection" of the new regulation of nucleic acid alignment recognition upward Specific to the formation of nucleic acid base pairs, the structure of nucleic acid base pairs Start of study on the application of the drug, study on the characteristics of the drug in the 2'-D chain, and study on the introduction of the drug in the DNA chain After the completion of the project, the project will be completed in sequence. The final goal is to create and analyze the precise base alignment recognition technology. In 2001, the double lock formation ability of N^4-cluster DNA and complementary DNA was measured and the complementary lock recognition ability of N^4-cluster DNA was evaluated. The double lock formation energy and the phase complementary lock recognition energy can be reversed. The results of 2001 were: synthesis of the inducer, characterization of the inducer by 1H-NMR As a result, the structure of the base pair is determined. In the synthesis of DNA, the double lock formation and recognition can be adjusted. In the first place, we want to make a decision on the formation of a stable base pair. The reason for this is that computational chemistry techniques are used to analyze, compare, and determine the general structure of the structure. The structural class of the structure of the structure can form a matrix, and the possibility of forming a matrix can be demonstrated.