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ミスマッチ塩基対安定化能を有する人工DNAのデザインと開発

具有错配碱基对稳定能力的人工DNA的设计与开发

基本信息

批准号：
14011218
负责人：
清尾康志
金额：
$ 2.5万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

オリゴヌクレオチドを用いた遺伝子修復技術はゲノムを直接書き換える遺伝子操作技術として、基礎研究や臨床での応用が期待されている。本研究ではこの遺伝子修復技術のための新素材を人工核酸のデザインと有機合成の手法を用い開発することを検討した。具体的にはミスマッチ修復酵素MutS-DNA複合体の3次元構造モデルからヒントを得た、アデニン塩基とreverse wobble型ジオメトリーでしかも非常に安定な塩基対を形成しうる人工シトシン塩基をデザインしその合成とオリゴDNAへの導入を行った。また合成した人工オリゴDNAについてはその二重鎖形成能や塩基識別能などを評価した。その結果、予想通り、今回合成した環状シトシン誘導体は、グアニン、アデニンの双方と安定な塩基対を形成することが分った。特に、アデニンとのミスマッチ塩基対については、天然型のシトシンに比べ10度以上も高いTm値を示し、そのミスマッチが著しく安定化されていることが分った。また、その塩基対構造がreverse wobble型である可能性についても示唆された。おどろいたことに、合成した環状シトシンは蛍光を有することが分り、この化合物が遺伝子診断やSNPs解析などのゲノムテクノロジーの分野でも興味深い特性を示すことがわかった。現在、遺伝子修復系のたんぱく質などと相互作用の解析などを行うための準備を検討しており、最終的には優れた遺伝子修復能を有する人工核酸新素材と開発を目指す。また予想外に得られたこの化合物の蛍光特性も引き続き検討を加え、遺伝子診断の分野への展開も検討する予定である。

In order to improve the quality of the technology, we should use the technology to improve the operation of the technology, and the basic research should be carried out in the field of research. In this study, artificial nucleic acids were used in the preparation of artificial nucleic acids and organic synthesis methods were used in this study. The specific enzyme MutS-DNA complex was modified in three dimensions, and the reverse wobble gene was successfully synthesized. The gene was very stable and stable. The gene was synthesized in the form of an artificial gene. The DNA gene was introduced into the industry. To synthesize the energy of the two-fold formation of the artificial compound, such as DNA, and so on, that is to say, the basic knowledge can be easily recognized. The results of the review, you want to know, this round into the environment, the economy, the economy, the environment, the economy, the economy, This is the first time to know that it is more than 10 degrees higher than 10 degrees, and that it is more than 10 degrees higher than 10 degrees. It is important to know that the Tm is higher than 10 degrees, and that the stability is better. Make a reverse wobble model, make a possibility, make an instigation. The chemical composition of the environment is characterized by the separation of the compounds, the separation of the compounds, the analysis of the SNPs, the deep taste of the compounds, and the deep taste of the compounds. At present, the system of artificial nucleic acid is widely used in the analysis of the interaction between artificial nucleic acid and artificial nucleic acid. The optical properties of the compound are introduced in this paper, and the results show that the optical properties of the compound are different from each other.