ゲノム修復型遺伝子治療を指向した、機能性DNAドラッグのデザインと創製
ゲノム修復型遺伝子治療を指向した、機能性DNAドラッグのデザインと創製
批准号:
15012218
负责人:
清尾 康志
金额:
$2.24万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 --
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オリゴDNAを用いた遺伝子改変は、新しい遺伝子治療や遺伝子操作の技術として、注目されている。しかし、現段階では、その効率が非常に低いため、実用化にはいたっていない。本起案研究では、オリゴDNAを用いた遺伝子修復のなかでも、生体内のミスマッチ修復機構を利用した遺伝子修復に着目し、この二本鎖DNAに対する優れたストランドインベージョン能と、強力なミスマッチ塩基対形成能を有する人工DNAの創製を計画した。具体的には、高いインベージョン能を有することが期待される新規ペプチド核酸(PNA)のドラッグデザインと、起案者がすでに報告した、高いミスマッチ塩基対を有するN-アルコキシカルボニルシトシン(Roc-dC)とその誘導体の開発を行う。これまでに起案者が独自に開発したアルコキシカルボニルシトシン(Roc-dC)のミスマッチ塩基対形成能を高めるべく、そのコンホメーションを環状構造でロックした新規ヌクレオベースHPPのデザインと合成を行った。新規ヌクレオベースHPPを化学的にDNA中に導入し、そのワトソンクリック塩基対形成能、およびミスマッチ塩基対形成能をUV-融解曲線を用いて評価した。その結果、HPPが予想通り、高いワトソンクリック塩基対形成能とともに、強力なミスマッチ塩基対形成能を有していることが分った。HPPとAとのミスマッチ塩基対を含む二本鎖DNA30量体を化学合成し、ミスマッチ結合タンパクである高度好熱菌由来MutSとの結合実験を行った。その結果HPPは天然型A-Cミスマッチ塩基対と同等の効率でMutSに認識されることが分った。合成したHPPの分光学的性質を詳細に検討したところ、HPPは比較的強い蛍光発光を示すことがわかった。またその蛍光発光は二本鎖DNA中でグアニンと対合すると消失し、アデニンと対合すると発光することが分った。
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Akihiro Ohkubo: "Proton-block strategy for the synthesis of oligodeoxynucleotides without base protection, capping reaction, and P-N bond cleavage reaction"Journal of Organic Chemistry. 124. 12715 (2003)
Akihiro Ohkubo:“用于合成无碱基保护、加帽反应和 P-N 键裂解反应的寡脱氧核苷酸的质子阻断策略”有机化学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Itaru Okamoto: "A New route to 2'-O-alkyl-2-thiouridine derivatives via 4-O-protection of the uracil base and hybridization properties of oligonucleotides incorporating these modified nucleoside derivatives"Journal of Organic Chemistry. 68. 9971 (2003)
Itaru Okamoto:“通过尿嘧啶碱基的 4-O-保护和掺入这些修饰核苷衍生物的寡核苷酸的杂交特性获得 2-O-烷基-2-硫尿苷衍生物的新途径”《有机化学杂志》。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kazuhisa Okada: "Synthesis and biological properties of stable phosmidosine analogs"Nucleic Acid Research Supplement. 3. 105 (2003)
Kazuhisa Okada:“稳定磷米苷类似物的合成和生物学特性”核酸研究增刊。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kohji Seio: "Important factors stabilizing stacking interaction between 3-nitropyrrole and natural nucleobases revealed by ab initio calculations"Nucleic Acid Research Supplement. 3. 49 (2003)
Kohji Seio:“从头计算揭示稳定 3-硝基吡咯和天然核碱基之间堆积相互作用的重要因素”核酸研究增刊。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Kohji Seio: "Enhanced Stereoselectivity in in Internucleotidic Bond Formation by the Effective use of the Potential of the Chiral Ribose Moiety of Thymidine"Journal of Organic Chemistry. 68. 5478 (2003)
Kohji Seio:“通过有效利用胸苷手性核糖部分的潜力增强核苷酸间键形成的立体选择性”有机化学杂志。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
共 8 条
真核生物におけるppGppの機能解明を目指した分子プローブの開発
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批准号:21H02075
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.07万
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财政年份:2021
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负责人:清尾 康志
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依托单位:
電気化学的モレキュラービーコンによる高速遺伝子検出法の開発
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批准号:16651060
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:清尾 康志
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依托单位:
ミスマッチ塩基対安定化能を有する人工DNAのデザインと開発
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批准号:14011218
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2002
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负责人:清尾 康志
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依托单位:
塩基配列を精密に認識するインテリジェント核酸プローブのデザインと開発
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批准号:13202021
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$2.94万
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财政年份:2001
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负责人:清尾 康志
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依托单位:
海外基金