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ヒメツリガネゴケで植物ホルモンオーキシン、サイトカイニン機能解明への網羅的研究

阐明三叶立碗藓植物激素生长素和细胞分裂素功能的综合研究

基本信息

批准号：
13202066
负责人：
長谷部光泰
金额：
$ 3.84万
依托单位：
Okazaki National Research Institutes
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究は、ヒメツリガネゴケをモデルとして、植物の形態形成に重要な働きを持つ植物ホルモンであるオーキシンとサイトカイニンの作用機作に関わる遺伝子群を網羅的に探索することを目的とした。研究方法は、(1)ホルモン無処理、オーキシン処理、サイトカイニン処理サンプルを用いて完全長cDNAライブラリーを作成、(2)ESTの配列決定、(3)カタログ化したクローンを順次ヒメツリガネゴケで過剰発現させオーキシン処理、サイトカイニン処理したときと同じ表現型を示す遺伝子を網羅的に探索するという3段階ですすめた。その結果、1)予定全ライブラリーについて合計5万ESTの塩基配列を決定しほとんどを一般公開した(遺伝研、新井理、小原雄治との共同研究)。2)本研究で構築したEST配列データと既公開のものを合わせた統合ヒメツリガネゴケESTデータベースを構築した(投稿準備中)。各クローンのBLAST検索結果、contig地図、過剰発現時表現型などが一覧できる。3)ESTの中から興味深いクローンについて全長塩基配列を決定し遺伝子系統樹解析から被子植物ゲノムとヒメツリガネゴケゲノムの比較、その進化について考察した。4)単離プロトプラストにDNAを導入後偏光下で培養することにより第1不等分裂の方向を一方向にそろえる条件を確立した。これにより効果的スクリーニングができるようになった。5)過剰発現用に約1500クローンをサブクローニング、約500cDNAの過剰発現表現型の観察をし、オーキシン、サイトカイニンに対する応答性が異なる10cDNAの単離に成功した。これに加え不等分裂異常など生物学的に興味深い表現型を示すcDNAをカタログ化した。

This study aims to explore the important factors in plant morphogenesis and the role of plant morphogenesis in the formation of genetic subgroups. The research method comprises the following steps: (1) creating a complete long cDNA library by using a library without processing, a library processing, a library processing,(2) determining EST alignment, and (3) sequentially selecting a library from among the library processing, and a library phenotype to display a library of ESTs. Results: 1) Total 50,000 ESTs are scheduled to be released to the public (joint research by Hikken, Arai and Yuji Ohara). 2) This study was conducted to construct the EST list (in preparation). A list of BLAST search results, contig locations, and current phenotypes for each query. 3)EST is interesting and interesting, and the sequence of full-length EST bases is determined. The phylogenetic tree analysis of EST is based on the comparison and evolution of angiosperms. 4) The conditions for the introduction of DNA under polarization are established. This is the first time I've ever seen a woman. 5)About 1500 cDNAs were successfully isolated from about 500 cDNAs and about 10 cDNAs were successfully isolated from about 500 cDNAs. The expression of cDNA is of great interest to the biology of heterozygotic abnormalities.