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集団遺伝学に基づく疾患関連遺伝子検出理論の整備

基于群体遗传学的疾病相关基因检测理论发展

基本信息

批准号：
13204067
负责人：
舘田英典
金额：
$ 1.92万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13204067/
关键词：
遺伝学ゲノム進化集団遺伝学有害遺伝子頻度

项目摘要

疾患関連遺伝子マッピング方法の基礎理論を構築するために、有害遺伝子頻度とマーカー遺伝子頻度の変化過程を解析し、原因遺伝子検出可能性と種々パラメーターとの関係解明を行った。まず最も簡単な、任意交配半数体モデルについて、連鎖不平衡の指標であるD'が平均的にどのような価を取るかを近似的に計算した。病因遺伝子aが一遺伝子あたり適応度をs下げるとし、連鎖した中立マーカ(B, b)との組み換え率がr、集団のサイズがNであるとする。病因遺伝子aが単一の突然変異から集団中に広がったと仮定すると、時間とともにD'は減少する。A遺伝子の頻度が最後に1/Nになってから現在に至るまでの時間をT、現在の頻度をpで表すと、D'の平均値は近似的にTの平均値の関数として表現できる。固定確率が非常に小さい有害遺伝子では、Tの平均値は確率過程のreversibilityの議論を使い近似的に「頻度pから出発した過程が1/Nまたは1に至る時間」から計算される。この時間の平均値ははMaruyama等によって求められており、遺伝子頻度変化過程が頻度xで滞在時間する時間G(x, p)を使って積分の形で表される。そこでD'の平均値をこの積分を数値計算した価から計算した。この式が実際のD'をどの程度近似するかを見るために、計算機シミュレーションを行った結果との比較を行った。Jensenの不等式から予想はされたが、近似値はシミュレーションから得られた値を過小評価することがわかった。今後、近似の精度を上げるために、Tの分散などより高次のモーメントを使った近似式などについて解析していく予定である。

The basic theory of the method for the treatment of diseases, diseases, The most common mating, random mating half of the body, link imbalance "refers to the average number of eggs in the average number of eggs, and takes the approximate calculation. The etiology of the disease is different from that of the normal group (B, b). The etiology of the disease is different from that of the control group. The cause of the disease is that there is a sudden change in the number of patients in the cluster, and the number of patients in the cluster is less than normal. The last cycle of the A-cycle sub-cycle is the last one, the last one. The fixed confirmation rate is very small, and the average assurance rate is very small. The process reversibility discussion makes it possible to calculate the temperature of the cycle from 1 pm to 1 pm. On average, Maruyama, etc., need to know whether or not to change the performance of the process. The delay of G (x, p) in the time limit makes it possible to analyze the performance of the table. The average number of positive components is calculated and calculated. The degree of international data acquisition is similar to that of other computer systems, and the results are better than those of other banks. Jensen inequality is based on the fact that you want to make sure that you do not want to know that you are not. In the future, the accuracy of the approximate accuracy, T distribution, high-order accuracy, accuracy, accuracy and accuracy.