集団遺伝学を取り入れた種形成機構の解析

结合群体遗传学的物种形成机制分析

• 批准号: 16057201
• 负责人: 舘田 英典
• 金额: $ 25.79万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16057201/
• 关键词: 種分化; 適応進化; 集団遺伝学; 集団間分化; 遺伝的変異; シクリッド; 染色体; 遺伝子間機能部位; 種文化; フタバガキ科樹木; 集団間文化; 遺伝子マーカー

この研究では種多様化が急速に進んだと考えられる生物種群、特に東アフリカ・ビクトリア湖のシクリッド等を中心に、現存集団の遺伝的変異を解析することによって、集団のサイズや地理的構造などが、どのように種分化に寄与したかを明らかにすることを目的とする。ビクトリア湖のシクリッドについては岩場性、沿岸性の3属5種(Paralabidochromis)"rockkribensis",Lithochromis rubripinnis, L.rufus, Neochromis greenwoodi, N.rufocaudalis)でマイクロサテライト12遺伝子座の多型を調査した。沖合性二種(Haplochromis pyrrhocephalus, H.laparogramma)のデータも合わせて解析したところ、生態的に異なる岩場性・沿岸性・沖合性の種群間、及び種群内の種問に、弱いながらも階層的な遺伝的分化ができつつあることを見いだした。染色体の解析では東工大岡田グループと共同で単離したBACクローン24個のうち、20個が染色体マーカーとして使用可能なことが判明した。20個全てにおいて、マルチカラーFISH法による解析を終了させ、これら20個は18対の染色体を識別できることがわかった。一方TAARと呼ばれる化学受容体遺伝子ファミリーの進化について、9種の脊椎動物のゲノム情報を使って解析した。魚類では四足動物に較べ特に遺伝子数が増えており、また多くの遺伝子が嗅覚器官で発現していることが明らかになった。嗅覚遺伝子の分化が種の認識に関与している可能性もあり興味深い。更に、系統特異的に進化したシス転写制御領域の分子進化学を取り入れた比較ゲノムによる推定法と、トランスジェニックマウスを用いたシス転写制御領域の機能解析法の開発を行い、哺乳類特異的な転写制御領域を発見した。

こ の research で は kind of many others in the が に rapidly into ん だ と exam え ら れ る species, に east ア フ リ カ · ビ ク ト リ ア lake の シ ク リ ッ ド に を center, such as the existing set 団 の but 伝 - different analytical す を る こ と に よ っ て, set 団 の サ イ ズ や geography tectonic な ど が, ど の よ う に differentiation of に send し た か を Ming ら か に す る こ と を purpose と す Youdaoplaceholder0. Youdaoplaceholder0 ビ トリア トリア lake <s:1> シ <e:1> リッドに リッドに リッドに て て rock field and coastal type <s:1> 3 genera and 5 species (Paralabidochromis)"rockkribensis",Lithochromis rubripinnis, L. Rufus Neochromis greenwoodi, N.rufocaudalis)で た ロサテラ ロサテラ ト ト12 伝 subza polymorpha を investigation た た. Two types (Haplochromis pyrrhocephalus) H.l aparogramma) の デ ー タ も close わ せ て parsing し た と こ ろ, ecological に different な る climbing resistance, coastal sex, blunt or の populations, and between の び populations in this kind of q に, weak い な が ら も class な of 伝 differentiation が で き つ つ あ る こ と を see い だ し た. Chromosome の parsing で は DongGong big okada グ ル ー プ と common で 単 from し た BAC ク ロ ー ン 24 の う ち, 20 が chromosome マ ー カ ー と し て use may な こ と が.at し た. 20 full て に お い て, マ ル チ カ ラ ー FISH method に よ る parsing を end さ せ, こ れ ら 20 は 18 を の chromosome recognition seaborne で き る こ と が わ か っ た. Chemical by one party TAAR と shout ば れ る let body heritage 伝 son フ ァ ミ リ ー の evolution に つ い て, nine の vertebrates の ゲ ノ ム intelligence を make っ て parsing し た. Fish で は quadrupeds に more べ, に heritage 伝 son number が raised え て お り, ま た more く の posthumous son 伝 が olfactory organs 覚 で 発 now し て い る こ と が Ming ら か に な っ た. It is of great interest to understand the に relationship and the possibility of <s:1> て る る る る る る あ あ あ あ 覚 覚. More specific に に, system evolution し た シ ス planning write suppression area の molecular evolutionary を take り れ た compare ゲ ノ ム に よ る estimate と, ト ラ ン ス ジ ェ ニ ッ ク マ ウ ス を with い た シ ス の function planning write suppression field analytical method の open 発 を い, mammals specific な planning write suppression area を 発 see し た.

项目成果

Gene genealogy and properties of test statistics of neutrality under population growth

• DOI: 10.1534/genetics.104.032797
• 发表时间: 2005-03-01
• 期刊: GENETICS
• 影响因子: 3.3
• 作者: Sano, A;Tachida, H
• 通讯作者: Tachida, H

The mitochondrial genome of spotted green pufferfish Tetraodon nigroviridis (Teleostei: Tetraodontiformes) and divergence time estimation among model organisms in fishes

• DOI: 10.1266/ggs.81.29
• 发表时间: 2006-02-01
• 期刊: GENES & GENETIC SYSTEMS
• 影响因子: 1.1
• 作者: Yamanoue, Yusuke;Miya, Masaki;Nishida, Mutsumi
• 通讯作者: Nishida, Mutsumi

Identification and evolutionary origin of a limb enhancer in the Dlx3-7 bigene cluster

Dlx3-7 双基因簇中肢体增强子的鉴定和进化起源

• 发表时间: 2007
• 作者: Hiroshi Masuya;Hideki Sezutsu;Yoshiyuki Sakurba;Tomoko Sagai;Masaki Hosoya;Hideki Kaneda;Ikuo Miura;Kimio Kobayashi;Kenta Sumiyama;Aya Shimizu;Junko Nagano;Haruka Yokoyama;Satoko Kaneko;Noriko Sakurai;Yuka Okagaki;Tetsui Noda;Shigeharu Wak;隅山 健太
• 通讯作者: 隅山 健太

A series of ENU-induced single-base substitutions in a long-range cis-element altering Sonic hedgehog expression in the developing mouse limb bud

• DOI: 10.1016/j.ygeno.2006.09.005
• 发表时间: 2007-02-01
• 期刊: GENOMICS
• 影响因子: 4.4
• 作者: Masuya, Hiroshi;Sezutsu, Hideki;Shiroishi, Toshihiko
• 通讯作者: Shiroishi, Toshihiko

Comparative phylogeograpby of closely related freshwater fishes, Tanakia lanceolata and T. limbata (Teleostei, Cyprinidae) in western Japan, based on mitochondrial DNA analysis.

基于线粒体 DNA 分析，对日本西部密切相关的淡水鱼类 Tanakia lanceolata 和 T.limbata（Teleostei，Cyprinidae）进行比较系统地理学。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Zool. Sci. 23
• 作者: Y.;Hashiguchi・M.;Nishida;H.Masuya et al.;Y.Hashiguchi et al.
• 通讯作者: Y.Hashiguchi et al.