集団遺伝学を取り入れた種形成機構の解析
集団遺伝学を取り入れた種形成機構の解析
批准号:
16057201
负责人:
舘田 英典
金额:
$25.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2007
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英文摘要
この研究では種多様化が急速に進んだと考えられる生物種群、特に東アフリカ・ビクトリア湖のシクリッド等を中心に、現存集団の遺伝的変異を解析することによって、集団のサイズや地理的構造などが、どのように種分化に寄与したかを明らかにすることを目的とする。ビクトリア湖のシクリッドについては岩場性、沿岸性の3属5種(Paralabidochromis)"rockkribensis",Lithochromis rubripinnis, L.rufus, Neochromis greenwoodi, N.rufocaudalis)でマイクロサテライト12遺伝子座の多型を調査した。沖合性二種(Haplochromis pyrrhocephalus, H.laparogramma)のデータも合わせて解析したところ、生態的に異なる岩場性・沿岸性・沖合性の種群間、及び種群内の種問に、弱いながらも階層的な遺伝的分化ができつつあることを見いだした。染色体の解析では東工大岡田グループと共同で単離したBACクローン24個のうち、20個が染色体マーカーとして使用可能なことが判明した。20個全てにおいて、マルチカラーFISH法による解析を終了させ、これら20個は18対の染色体を識別できることがわかった。一方TAARと呼ばれる化学受容体遺伝子ファミリーの進化について、9種の脊椎動物のゲノム情報を使って解析した。魚類では四足動物に較べ特に遺伝子数が増えており、また多くの遺伝子が嗅覚器官で発現していることが明らかになった。嗅覚遺伝子の分化が種の認識に関与している可能性もあり興味深い。更に、系統特異的に進化したシス転写制御領域の分子進化学を取り入れた比較ゲノムによる推定法と、トランスジェニックマウスを用いたシス転写制御領域の機能解析法の開発を行い、哺乳類特異的な転写制御領域を発見した。
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DOI:
10.1534/genetics.104.032797
发表时间:
2005-03-01
期刊:
GENETICS
影响因子:
3.3
作者:
[Sano, A, Tachida, H]
通讯作者:
Tachida, H
DOI:
10.1266/ggs.81.29
发表时间:
2006-02-01
期刊:
GENES & GENETIC SYSTEMS
影响因子:
1.1
作者:
[Yamanoue, Yusuke, Miya, Masaki, Nishida, Mutsumi]
通讯作者:
Nishida, Mutsumi
Identification and evolutionary origin of a limb enhancer in the Dlx3-7 bigene cluster
Dlx3-7 双基因簇中肢体增强子的鉴定和进化起源
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hiroshi Masuya, Hideki Sezutsu, Yoshiyuki Sakurba, Tomoko Sagai, Masaki Hosoya, Hideki Kaneda, Ikuo Miura, Kimio Kobayashi, Kenta Sumiyama, Aya Shimizu, Junko Nagano, Haruka Yokoyama, Satoko Kaneko, Noriko Sakurai, Yuka Okagaki, Tetsui Noda, Shigeharu Wak, 隅山 健太]
通讯作者:
隅山 健太
DOI:
10.1016/j.ygeno.2006.09.005
发表时间:
2007-02-01
期刊:
GENOMICS
影响因子:
4.4
作者:
[Masuya, Hiroshi, Sezutsu, Hideki, Shiroishi, Toshihiko]
通讯作者:
Shiroishi, Toshihiko
Comparative phylogeograpby of closely related freshwater fishes, Tanakia lanceolata and T. limbata (Teleostei, Cyprinidae) in western Japan, based on mitochondrial DNA analysis.
基于线粒体 DNA 分析,对日本西部密切相关的淡水鱼类 Tanakia lanceolata 和 T.limbata(Teleostei,Cyprinidae)进行比较系统地理学。
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Zool. Sci. 23
影响因子:
--
作者:
[Y., Hashiguchi・M., Nishida, H.Masuya et al., Y.Hashiguchi et al.]
通讯作者:
Y.Hashiguchi et al.
共 12 条
集団遺伝学に基づく疾患関連遺伝子検出理論の整備
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批准号:15012239
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2003
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负责人:舘田 英典
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依托单位:
集団遺伝学に基づく疾患関連遺伝子検出理論の整備
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批准号:14013046
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2002
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负责人:舘田 英典
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依托单位:
集団遺伝学に基づく疾患関連遺伝子検出理論の整備
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批准号:13204067
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2001
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负责人:舘田 英典
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依托单位:
生物における遺伝的冗長性に関する理論的研究
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批准号:08233220
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1996
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负责人:舘田 英典
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依托单位:
DNA配列に周期的パターンをもたらす要因についての集団遺伝学的研究
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批准号:02740313
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1990
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负责人:舘田 英典
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依托单位:
海外基金