シアノバクテリアがコードする遺伝子産物機能の網羅的解析

蓝藻编码基因产物功能综合分析

• 批准号: 13206012
• 负责人: 園池 公毅
• 金额: $ 3.52万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13206012/
• 关键词: シアノバクテリア; ゲノム; 遺伝子機能解析; 光合成; クロロフィル; 蛍光; 光化学系II; トランスポゾン

現在までに数多くの生物において、全ゲノムのシークエンスが完了し、その網羅的解析が進行中である。光合成のモデル生物として非常に重要な位置をしめるSynechocystisにおいても、かずさDNA研究所によってその全ゲノムのシークエンスが完了し、ゲノムがコードする遺伝子の数はおよそ3,000と見積もられている。また、遺伝子の発現に関してもDNAマイクロアレイの利用によって網羅的な解析が可能となっている。ところが、これらの遺伝子の機能解析は、残念ながら網羅的とはとうてい言えない状況である。我々は、シアノバクテリアにおいては、光合成関連遺伝子だけではなく、ほとんどすべての代謝系の遺伝子の変異を、光合成色素であるクロロフィルの蛍光の変化としてとらえうることを見いだした。本研究では、この新たに開発された方法をシアノバクテリアにおいて確立し、これを用いて、シアノバクテリアのゲノムがコードする約3,000の遺伝子のすべての破壊株の表現型をゲノムワイドに解析することによって、シアノバクテリアのゲノム機能を明らかにすることを目的とする。平成12年度までに基本的な方法を確立したことから、平成13年度からは、実際にゲノムワイドな解析に着手した。トランスポゾンを用いたランダムな遺伝子破壊株を用いて網羅的な解析が進行中である。全ゲノム遺伝子の約2%にあたるコスミドを解析した現段階で116個のORFを対象に176個の変異体を作成・解析し、12個の蛍光変異体を取得した。これらの蛍光変異体は、7つのORFに変異が入っており、6つのクラスに分類できることがわかった。このことから、全ゲノムの解析が終了すれば、数百個の蛍光変異体が得られ、おそらく、最低限数十のORFが多数のクラスに分類できるのではないかと考えている。

At present, the resolution of the Internet is in the process of analyzing multiple biological systems, full-system systems, and the Internet. The position of photosynthesis is very important, the position is very important, the Synechocystis is very important, the DNA Institute is full, the whole body is finished, the number of children is over, the number is 3000. It is possible for DNA users to take advantage of the resolution of the Internet network to make use of the resolution of the Internet. If you are not able to parse and read the messages of the Internet, you will not be able to parse the messages of the Internet. I, In this study, new methods are used in this study. the results show that there are significant differences between the two methods in this study. in this study, new methods are used in this study. in this study, new methods are used in this study. in this study, new methods are used in this study. in this study, new methods are used in this study. in this study, new methods are used in this study. in this study, new methods are used in this study. The basic methods used in Pingcheng 12, Pingcheng 13, and international financial institutions are established and analyzed. Please tell me that you need to use the profile analysis of the Internet to break the tree. About 2% of the full-scale data were analyzed. 116 ORF images were made into parsers, and 12 optical images were obtained. You need to know that you are not in the market for light, 7 ORF, and 6 years. The whole system has been used for many years, hundreds of optical devices have been approved, and a minimum of dozens of ORF has been obtained. Most of them are classified as well.

项目成果

Higuchi, M., Noguchi, T, Sonoike, K.: "Reduction of Mn cluster in the oxygen evolving complex"PS2001 Proceedings. S22-017.

Higuchi, M.、Noguchi, T、Sonoike, K.：“氧气放出复合物中锰簇的还原”PS2001 论文集。

Aiba, H. et al.: "Analysis of a cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 genome"PS200l Proceedings. S41-010. (2001)

Aiba, H. 等人：“蓝藻集胞藻属 PCC 6803 基因组的分析”PS2001 论文集。

Sonoike, K., Kudoh, H.: "Photoinhibition of photosystem I"PS2001 Proceedings. S8-002. (2001)

Sonoike, K., Kudoh, H.：“光系统 I 的光抑制”PS2001 论文集。

Kudoh, H., Sonoike, K.: "Development of chlorophyll bleaching in cucumber leaves"PS2001 Proceedings. S8-022. (2001)

Kudoh, H., Sonoike, K.：“黄瓜叶叶绿素漂白的进展”PS2001 论文集。

Sonoike, K., Hihara, Y., Ikeuchi, M.: "Physiological Significance of the Regulation of Photosystem Stoichiometry"Plant Cell Physiology. 42(4). 379-384 (2001)

Sonoike, K.、Hihara, Y.、Ikeuchi, M.：“光系统化学计量调节的生理意义”植物细胞生理学。