時系列蛍光データを用いた表現型データベースの構築

使用时间序列荧光数据构建表型数据库

• 批准号: 17017010
• 负责人: 園池 公毅
• 金额: $ 2.56万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17017010/
• 关键词: 光合成; クロロフィル蛍光; ゲノム; 遺伝子機能解析; シアノバクテリア; 光化学系量比調整; s111961; pmgA

1)研究をスタートする時点で、二次元クロロフィル蛍光画像解析システムを用いて、シアノバクテリアの蛍光挙動を観察する測定システム自体はほぼ完成していた。シアノバクテリアの変異株はさまざまな研究者によって作成されているが、本研究のように蛍光の微妙な変化を検出するためにはバックグラウンド(変異株の親株)を揃える必要があり、ばらばらの変異株のコレクションでは残念ながら本研究には使用できないことがわかった。京都大学の福澤らによって作成されたトランスポゾンによって遺伝子を破壊したコスミドについて、そのクローン化および、シークエンスによる挿入部位確認作業を進めた。1588のコスミドクローンのシークエンスを行なった結果、1369クローンについて変異部位(トランスポゾン挿入部位)を決定することができた。2)この変異クローンの中で独立な遺伝子を持つものを選抜した1240クローンを遺伝子破壊コンストラクトとしてシアノバクテリアの形質転換を行なった。これにより、843の遺伝子破壊株を得ることができた。3)この遺伝子破壊株のクロロフィル蛍光挙動を測定し、644株について、クロロフィル蛍光データを取得することが出来た。4)網羅的なクロロフィル蛍光測定を進めるにあたって、s111961という遺伝子の破壊株が、光化学系量比調節に関与することが報告されていたpmgA遺伝子の変異株と、極めてよく似たクロロフィル蛍光挙動を示すことに気がつき、このs111961変異株の詳細な解析を進めた結果、この遺伝子も、光化学系量比調節に関与していることを見いだした。この例は、クロロフィル蛍光挙動によって、遺伝子の機能推定が可能であることの1つの証明になったと考えている。

1)Study the time, the second dimension, the light image analysis system, the measurement system, the detection system and the detection system. In this study, the subtle changes in light were detected by the researchers, and the changes in light were necessary for the study. Kyoto University's Fukuzawa Institute of Technology has been established to examine and confirm the entry site of the university. 1588 and 1369 are different parts of the system. 2) This is the first time that a person's identity has been changed from a person's identity to a person's identity. 843, the original son of the original son. 3) 644 strains were detected for the presence of light in these strains. 4)A report on the progress of the photometric determination of pmgA gene, the regulation of photochemical system ratio, and the detailed analysis of pmgA gene, the results of the photometric determination of pmgA gene, and the detailed analysis of pmgA gene. Photochemical system ratio adjustment is related to the change of photochemistry ratio. This example shows that it is possible to estimate the function of the gene by the method of light and light.

项目成果

The mutant of sII1961. which encodes a putative transcriptional regulator, has a defect in regulation of photosystem stoichiometry in the cyanobacterium Synechocystis sp.PCC 6803

sII1961的突变体。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Plant Physiology 139
• 作者: fujimori;t.;Higuchi;M.;Sato;H.;Aiba;H.;Muramatsu;M.;Hihara;Y.;Sonoike;K.
• 通讯作者: K.