X線結晶構造解析学的手法を用いたHomer1cによる受容体集積機構の解明

使用X射线晶体学方法阐明Homer1c受体积累机制

基本信息

  • 批准号:
    02J01835
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.24万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2002
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2002 至 2004
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

Homer1cはシナプス伝達に関わる多くの機能分子が集積している後シナプス肥厚部(PSD)に代謝型グルタミン酸受容体やIP_3受容体(IP_3R)などを局在・集積させる足場タンパク質である。本研究の目的はHomer1cによる膜タンパク質のPSDへの局在・集積化機構を立体構造に基づいて明らかにすることである。これまでに、Homer1cのHomer1ファミリー保存領域(CRH1:Conserved Region of the Homer 1 families)の構造を決定し、集積制御機構のモデルを提唱した。そこで次に、結合相手と複合体を形成することによるHomer1cの構造変化を明らかにすることで、提唱した集積制御機構を明らかにできると考え、結合相手にIP_3Rを選択し複合体の三次元構造解析を開始した。その結果、IP_3RのHomer1cの結合領域とIP_3の結合領域とを含む細胞内領域であるIP_3R_<1-604>の精製条件を検討し大量調製を可能にした。さらに、還元剤にトリス(2,-カルボキシエチル)フォスフィン(TCEP)、溶液中の塩に硫酸ナトリウムを用いることで、溶液中での均一性が増すことを明らかにした。複合体の形成による構造変化を比較することと、単体の構造解析によって得られる立体構造に基づくことでIP_3R細胞内領域のCRH1との複合体を形成する最適な領域を決定できるため、このタンパク質試料を用いてIP_3R_<1-604>単体の結晶化を行った。その結果、0.1M Hepes-NaOH(pH7.5),2.0Mギ酸アンモニウム,3%メタノールの結晶化条件で偏光を示す針状結晶が得られた。現在は、この針状結晶を回折実験が行える大きさにするために、結晶化条件の最適化を行っている。
Homer1c has a wide range of functional molecules that are involved in the accumulation of protein, such as the hypertrophic portion (PSD), the metabotropic acid receptor and the IP_3 receptor (IP_3R). The purpose of this study is to improve the quality of the PSD system and its spatial structure. The structure of CRH1:Conserved Region of the Homer 1 families was determined and the integrated control mechanism was proposed. The structural analysis of Homer1c in combination with IP_3R in combination with IP_3R in combination with IP As a result, the binding domain of IP_3R and Homer1c, the binding domain of IP_3 and <1-604>the refining condition of IP_3R, including intracellular domain, are discussed. In addition, the reduction factor is (2,-)(TCEP), and the sulfuric acid in solution is (2, -)(TCEP), and the homogeneity in solution is increased. The structure of the complex formation was compared with that of the single crystal. The structure of the single crystal was analyzed. The three-dimensional structure was determined. The optimal domain for the formation of the complex was determined. The crystallization of the IP_3R single <1-604>crystal was performed. As a result, 0.1M Hepes-NaOH(pH7.5), 2.0M hydrochloric acid and 3% aqueous solution were obtained under different crystallization conditions. The optimization of crystallization conditions is carried out in the process of crystallization.

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Katsumasa Irie: "Crystal structure of the Homer 1 family conserved region reveals the interaction between the EVH1 domain and own proline-rich motif"Journal of Molecular Biology. 318. 1117 (2002)
Katsumasa Irie:“Homer 1 家族保守区的晶体结构揭示了 EVH1 结构域和自身富含脯氨酸基序之间的相互作用”《分子生物学杂志》。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

入江 克雅其他文献

原核生物由来ナトリウムチャネルに創出された二価カチオ ンによる電流阻害の分子機構
原核钠通道中产生的二价阳离子抑制电流的分子机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    高橋 祐介;Prasad S. Adusumilli;入江 克雅
  • 通讯作者:
    入江 克雅
四量体型イオンチャネルにおける 二価カチオンによる阻害機構の 構造基盤の解析
四聚体离子通道中二价阳离子抑制机制的结构基础分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Okuda T;Uchiyama S;Sato N;Takahashi Y;Kato F.;入江 克雅
  • 通讯作者:
    入江 克雅
結晶構造と分子動力学計算によるイオンチャネルにおける 二価カチオンの阻害機構の解析
利用晶体结构和分子动力学计算分析离子通道中二价阳离子的抑制机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Junko Ichikawa ;Ryota Okazaki ;Tomoki Fukuda ;Daejoon Yoon ;Makiko Komori;松岡 由里子;入江 克雅
  • 通讯作者:
    入江 克雅
天然の原核生物由来カルシウムチャネルにおけるイオン透過選択性の進化とその決定残基の同定
天然原核钙通道离子选择性通透性的演化及其决定残基的鉴定
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    入江 克雅;下村 拓史;米川 佳樹;名倉 仁;立山 充博;藤吉 好則
  • 通讯作者:
    藤吉 好則
Asymmetric interaction of permeating cation and local anesthetic with homo-tetrameric sodium channel
渗透阳离子和局麻药与同源四聚体钠通道的不对称相互作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Katsumasa Irie;Takushi Shimomura;Toshiki Yonekawa;Hitoshi Nagura;and Yoshinori Fujiyoshi;入江 克雅
  • 通讯作者:
    入江 克雅

入江 克雅的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('入江 克雅', 18)}}的其他基金

イオンチャネルのイオン分別能を究める
探索离子通道的离子分离能力
  • 批准号:
    24K02168
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

相似海外基金

X線結晶構造解析による電位感受性酵素VSPの分子メカニズム解明
X射线晶体结构分析阐明电压敏感酶VSP的分子机制
  • 批准号:
    24KJ0146
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
黄色ブドウ球菌の増殖を根こそぎ断つ抗リパーゼ薬創製のための複合体の結晶構造解析
用于制造消除金黄色葡萄球菌生长的抗脂肪酶药物的复合物的晶体结构分析
  • 批准号:
    24K10199
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
極限環境タンパク質科学を切り拓く、好熱菌タンパク質の高温X線結晶構造解析
高温X射线晶体结构分析嗜热细菌蛋白质开辟极端环境蛋白质科学
  • 批准号:
    24K08718
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
磁場配向セルロース・ヘミセルロース微結晶のX線結晶構造解析
磁取向纤维素/半纤维素微晶的 X 射线晶体结构分析
  • 批准号:
    23K26969
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Next Generation Crystal Structure Analysis by Cryo-Electron Microscopy
通过冷冻电子显微镜进行下一代晶体结构分析
  • 批准号:
    23K18001
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
ダニ・アリ由来オクトパミン受容体群の機能解析・結晶構造解析
蜱和蚂蚁来源的章鱼胺受体的功能分析和晶体结构分析
  • 批准号:
    23K05046
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
先駆的結晶構造解析による低結晶層状酸化物正極の性能を決定する構造メカニズムの解明
通过开创性的晶体结构分析阐明决定低结晶层状氧化物阴极性能的结构机制
  • 批准号:
    23K04379
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
環状逆配向性PIP-DNA複合体のX線結晶構造解析
环状反向PIP-DNA复合物的X射线晶体结构分析
  • 批准号:
    22KJ1706
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
時間分割X線結晶構造解析による鉄硫黄クラスター生合成酵素の触媒反応機構の解明
通过时间分辨X射线晶体结构分析阐明铁硫簇生物合成酶的催化反应机制
  • 批准号:
    22KJ0453
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
X-ray crystal structure analysis of magnetically oriented cellulose and hemicellulose microcrystals
磁取向纤维素和半纤维素微晶的 X 射线晶体结构分析
  • 批准号:
    23H02276
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 2.24万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了