ESTs, Microarrays und Proteomics

EST、微阵列和蛋白质组学

基本信息

项目摘要

Cryptomonaden sind in sekundärer Endosymbiose evolvierte, phototrophe Protisten. Neben dem Zellkern, den Mitochondrien und Plastiden beherbergen die Cryptomonaden mit dem Nucleomorph ein viertes DNA-haltiges Organell. In einem Genomprojekt wurden von uns das Nucleomorph-Genom sowie das Mitochondrien-Chromosom sequenziert; darüber hinaus steht die Sequenz des Plastoms zur Verfügung. In dem hier beantragten Projekt soll eine EST-Analyse Aufschluß über die Kodierungskapazität des Zellkerns geben. Die EST-Daten werden genutzt um a) hochdichte Arrays zu erstellen und b) eine Proteomanalyse zu ermöglichen. Wir erwarten in diesem Projekt die Kodierungskapazität des Zellkerns zu bestimmen sowie die Identität Kern-kodierter Plastidenproteine. Als Nebenprodukt werden Kern-kodierte Proteine des eukaryoten Symbionten und die notwendigen topogenen Signale für deren intrazelluläre Verlagerung identifiziert. Die Microarray-Experimente werden das Netzwerk der koordinierten Expression plastidärer Funktionen aufzeigen; dieses Wissen mündet schließlich in der Proteombestimmung des Stromas der komplexen Plastide der Cryptomonaden. Parallel hierzu sollen methodische Innovationen der Array-Technologie entwickelt werden, sog. Peptid-Arrays, welche ein schnelles Screenen auf Protein-Protein-Interaktionen gestatten.
隐形藻类在内生共生体中进化,原生体。Nben DEM Zellkern,den线粒体and Plattiden Beherbergen die CryptomonadeMIT DEM Nucleomommph ein viertes DNA-haltiges Organell.在Einem Genomprojekt Wurden von n s das核形态-基因组Sowie das线粒体-染色体序列中;darüber hinaus stht die die Sequenz des Plstom zur Verfügung。在DEM HERER BANTGREKET PROJEKT SOL EINE EST-AUFSCHLUüber De Kofschluüber die Kodierungskapazität des Zellkerns geben.这些EST-DATEN被用来分析zu erstellen和b)eine蛋白质分析zu ermöglichen。我们在Zellkerns Zellkerns zu bstiman Sowie Die Projekt de Kodierong skapazität des Zellkerns zu bstimins Sowie die id t?t Kern-Kodierter PlattidenProteine.ALS Nebenprodukt是一种新的真核细胞共生蛋白和新的拓扑发生信号。微阵列-实验被das Netzwerk der Koordinierten Expression pltidärer Funktionen aufzeigen;Dieses Wissen münDet Schlie?lich in der Proteombstimung des Strooma der komplexen plide der Cryptomonden.阵列技术创新的并行方法论。多肽-阵列,在脑沟筛子蛋白-蛋白质-相互作用妊娠。

项目成果

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