イネのMITE様転移因子mPingを用いた農業形質関連遺伝子の網羅的構造解析

利用水稻MITE样转座元件mPing进行农业性状相关基因的综合结构分析

• 批准号: 15780005
• 负责人: 堀端 章
• 金额: $ 2.05万
• 依托单位: Kinki University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15780005/
• 关键词: イネ; 転移因子; トランスポゾンディスプレイ; 遺伝子タギング; 農業形質; APCR; AFLP; 選択塩基; 脱粒性; 粒型; 遺伝子構造解析; 植物育種学

本研究は、イネのMITE型トランスポゾンmPingの活発な転移を利用したノックアウト遺伝子の効率的クローニング法の開発を目指している。同様の目的で開発された遺伝子タギング法はこれまでにも存在するが、本法の特色は一般に量的形質であり通常の分離分析を行うことが困難な農業形質関連遺伝子のクローニングを目的とする点である。この目的を達成するため、突然変異分離集団の大規模なトランスポゾンディスプレイを行い、QTL解析に準じた統計処理によって対象形質の変異に密接に関連するmPing挿入多型を見出そうと考えた。平成15年度には、細粒形質に関するキメラ個体をモデルとして、トランスポゾンディスプレイから突然変異遺伝子のタギングに到る一連の技術的基盤を完成させた。平成16年度には、タグライン作成用細粒系統の大規模圃場展開を行って、mPing挿入突然変異体を収集するとともに、分離系統の一部についてトランスポゾンディスプレイを行って脱粒性と密接に関連する117bpの増幅断片を生じるmPing挿入多型を見出した。平成17年度は、前年に得られたmPing挿入突然変異体の個体別次代系統を圃場に展開し、農業形質に関する突然変異の有無を調査すると同時に、農業形質に関する分離が認められた2系統の全個体について個体別にトランスポゾンディスプレイを行い、共分離するmPing挿入多型の検出を試みた。その結果、稈長について合計9つ、穂長について合計9つ、穂数について合計7つのmPing挿入多型が、危険率を5%とするt検定によって当該形質の変異と関連すると判断された。農業形質は年次変動が大きいため、これらの多型と形質との関連についてはもう一年検討を続けた後、タグされたDNA断片のクローニングと構造解析を行う予定である。

This study aims to explore the development of a novel method for the activation of MITE type catalysts by using the catalyst efficiency. For the same purpose, the development of genetic engineering methods is characterized by the existence of general quantitative characteristics, the usual separation analysis, and the difficulty of agricultural qualitative characteristics related to genetic engineering. This goal was achieved by analyzing the large scale genetic diversity of the population, QTL analysis, statistical processing, and close association between the different image characteristics. In the 15th year of Heisei, the foundation for a series of technologies related to the movement of fine particles and the sudden change of genetic particles was completed. In 2016, a large-scale nursery development of fine grain systems for grain production was carried out, and a part of the separation system was developed. In 2017, the company obtained the results of investigation on the presence or absence of sudden changes in individual sub-generation systems related to farm development and agricultural characteristics, and the results of simultaneous investigation on the presence or absence of sudden changes in agricultural characteristics related to separation and identification of the whole individual of 2 systems. The result is that the total length of the stem is 9, the total length of the stem is 9, the total number of the stem is 7, the risk rate is 5%, and the determination is made when the characteristic is different. Agricultural morphology changes year by year, polytype, morphology and relationship change year by year, DNA fragments change year by year, structural analysis year by year,

项目成果

松井和幸: "トランスポゾンディスプレイ法によるmPing転移のモニタリング"育種学研究. 5(別2). 76 (2003)

Kazuyuki Matsui：“通过转座子展示方法监测 mPing 转移”，《育种研究》5（第 2 部分）（2003 年）。

誘発突然変異遺伝子と共分離するmPingのトランスポゾンディスプレイによる同定

通过转座子展示鉴定 mPing 与诱导突变基因的共分离

• 发表时间: 2005
• 期刊: 育種学研究 7(別1,2)
• 作者: 中崎鉄也;堀端章
• 通讯作者: 堀端章

Spontaneous and frequent transposition of a miniature inverted-repeat transposable element, mPing, in an experimental line of rice (Oryza sativa L.)

小型反向重复转座元件 mPing 在水稻实验品系 (Oryza sativa L.) 中的自发和频繁转座

• 发表时间: 2005
• 期刊: 10th International Congress of SABRAO 抄録集
• 作者: 中崎鉄也;堀端章;井上悦子;堀端章
• 通讯作者: 堀端章

Rapid amplification of transposons, Ping and mPing, in japonica rice varieties

粳稻品种中转座子 Ping 和 mPing 的快速扩增

• 发表时间: 2004
• 期刊: World Rice Research Conference 2004 抄録集
• 作者: 中崎鉄也;堀端章;井上悦子;堀端章;松井和幸;松井和幸;堀端 章;松井和幸;大森良弘;堀端 章;奥本 裕
• 通讯作者: 奥本 裕

変異検出法、変異検出プログラムおよび記憶媒体

突变检测方法、突变检测程序及存储介质

• 发表时间: 2005