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21番目のアミノ酸セレノシステインの蛋白質への取込み機構の立体構造基盤の解明と人工システムの構築

阐明第21位氨基酸硒代半胱氨酸掺入蛋白质机制的三维结构基础并构建人工系统

基本信息

批准号：
04F04186
负责人：
神田大輔
金额：
$ 1.54万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

セレノシステインは酸化還元に関わる蛋白質の活性残基として働く.セレノシステインをコードするコドンは、通常終止コドンとして使用されているUGAである。原核生物の場合,終止コドンUGAの下流にSECIS(selenocysteine insertion sequence)と呼ばれる特殊なRNA配列が存在すると、UGAはセレノシステインを指定するコドンへと変化する。このとき、リボゾームのA-siteに結合するのはセレノシステイニルtRNASecであり、蛋白質の翻訳は終結せずにセレノシステインが取り込まれる。伸長因子SelBはtRNAを結合するN末端部分とSECISに特異的に結合するC末端部分からなる.昨年度は酢酸生産菌Moorella thermoacetica由来のSelBのC末端ドメインの一部であるRNA結合最小ドメイン(残基512-634C末端)とSECIS(ヘアピン構造RNA)の複合体の構造決定を行った.その結果DNAに結合する有名なウィングドヘリックス(WH)モチーフがSECIS RNAの先端にあるループ構造を新規の認識モードで結合することがわかった.また、SECISの結合によりSelB分子の構造変化は見られず、これまで提案されてきたSECIS結合によるSelBのN末端ドメインとC末端ドメインの協同的な働きは、リボソームを介するものである可能性が示唆された。そのため、本年度はSelBのより大きな領域の構造解析を進めるべく、C末端ドメイン全体とSECIS RNAとの複合体の結晶化に取り組んだ。その結果、2種類の条件で結晶が得られた。分子置換法による解析により、正しい解を得ることに成功した。初期解析を終了した段階であるが、予想外のSECIS RNAとSelBの結合様式が観察された。

It is necessary to study the effect of acidification on the activity of protein and its active residues. I don't know what to do. I don't know what to do. I don't know. I don't know. I don't know The prokaryotes are closed, and the prokaryotes are divided into two groups: the UGA, the obscene SECIS (selenocysteine insertion sequence), the special RNA, the existence, the UGA, the chemical, the designated, the chemical. Please tell me that you need to know that you have tRNASec problems, and that you need to know what to do. You need to know if you want to know what you want to do. You need to know if you want to know what you want to do. You need to know if you want to know what to do. The combination of the elongation factor SelB terminal tRNA and the N-terminal partial SECIS characteristic combines the C-terminal partial restriction. The origin of SelB acid-producing fungus Moorella thermoacetica last year was determined by the combination of SelB and SECIS (residue 512-634C-terminal) RNA. The results of the DNA results show that there is a significant difference between the two systems (WH). The front end of the SECIS RNA system is responsible for the creation of new rules. The combination of SECIS and SelB molecules makes it possible to introduce the possibility that SECIS should be combined with SelB N-terminal and C-terminal to indicate the possibility of instigation. In recent years, the field of SelB analysis has been analyzed, and all the C-terminal SECIS RNA complexes have been crystallized to obtain the results. The results of the test results and the results of the 2-year condition test were satisfactory. The molecular method was used to analyze the data, and the positive solution was successful. In the initial stage, we analyzed the information in the first place, and we did not want to use the combination of SECIS RNA SelB to observe the situation.