权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

グリーン関数を導入したフラグメント分子軌道法によるDNA電荷移動機構の解明

利用格林函数片段分子轨道法阐明 DNA 电荷转移机制

基本信息

批准号：
05J05747
负责人：
仙石康雄
金额：
$ 1.22万
依托单位：
Toyohashi University of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

採用2年目である今年度は、前年度導入した非平衡Green関数法を用いた伝導計算法をFragment Molecular Orbital (以下FMO)法に組み込み、計算を行う予定であったが、テスト計算を行ったところ母体となる当研究室で開発中のFMOプログラムに問題点が見つかったため、これの修正を行う事になった。またプログラム面での理解の向上に伴い、問題視していたDNAのダイナミクスを取り入れた伝導シミュレーション実現の可能性が見えたため、こちらの開発を優先した。このため今年度中にDNAの伝導計算を行うことはできなかったが、当研究室で開発しているNWChem-FMOについて、以下のような成果を得た。1.DFT計算時の精度向上→当研究室では、米Pacific Northwest National Laboratoryが中心となって開発されている量子化学計算プログラムNWChemにFMO法を実装している。これまで開発してきたFMOは、HF計算時にくらべDFT計算の際に大きなエラーが出るという問題が発見されたため、これを修正し、HF計算と同様の精度(数kcal/mol程度)での計算を可能にした。2.分極率及び超分極率計算の実装→解析的手法(CPHF法)による分極率の計算、及び数値的な手法(Finite-Field法)を用いた分極率・超分極率のFMO計算を実現した。3.Gradient計算の実装→FMOによってエネルギー、双極子、分極率の勾配を求める試みを行った。これについては現在論文を執筆中である。

This year's and the previous year's non-equilibrium Green data method is used to calculate the data of the current year and the previous year by using the Fragment Molecular Orbital (following FMO) method to calculate the number of data in the current year and the previous year, using the Fragment Molecular Orbital (following FMO) method to analyze, calculate, calculate It is important to understand that it is important to have an upward partner, and that you are concerned about the possibility that you can realize the possibility that you are not aware of the possibility that you are not aware of the possibility that you will be able to do so. In this year's DNA program, the following results will be awarded after the opening of the NWChem-FMO program in the laboratory. The time accuracy of 1.DFT calculation is higher than that of the laboratory and the Pacific Northwest National Laboratory center. Quantum chemistry calculation is very important. NWChem FMO method is widely used. Please start the FMO calculation, the HF calculation, the DFT calculation, the HF calculation, the kcal/mol calculation, the correction, the accuracy (kcal/mol), the accuracy, the accuracy. two。 The calculation of the dividing rate and the over-dividing rate the method of analyzing the equipment (CPHF method), the calculating method of the dividing rate (Finite-Field method), the calculating method of the overdividing rate (FMO), the calculating method of the counting rate, and the calculating method of the number. 3.Gradient calculates that you need to match the FMO, double, and split rates to calculate the number of lines. Please tell me that you are now in the process of writing a text.