全ゲノム情報に基づいたファイトプラズマの病原性メカニズムの解明
全ゲノム情報に基づいたファイトプラズマの病原性メカニズムの解明
基于全基因组信息阐明植原体致病机制
批准号：
05J12116
负责人：
嵐田 亮
金额：
$1.73万
依托单位：
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2005
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2005 至 2007
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英文摘要
申請者らが解読したCandidatus Phytoplasma asteris OY-Mの全ゲノムに続き,米国においてcandidatus Phytoplasma asteris AY-WB(Aster yellows witches' broom)系統の全ゲノムが2006年に決定された、AY-WBはOY-Mと同種であるが,宿主植物や媒介昆虫が異なり,ゲノムサイもOY-Mよりも約150 kbp小さい.そこで,OY-MとAY-WBの比較ゲノム解析を行い,両ゲノムにおける転移性遺伝子クラスターの分布およびゲノム構造の差異について解析した.相同性検索を用いた手法によりAY-WBゲノム上の重複遺伝子を探索したところ,シングルコピー遺伝子の数はAY-WBとOY-Mでほぼ一致しており,AY-WBとOY-Mの遺伝子数の差は重複遺伝子の数の差によるものであることが示唆された.OY-MとAY-WB間におけるオーソログを相同性検索を用いた手法で同定し,遺伝子の並び順を比較した.その結果,OY-MとAY-WBとは同一種でありながら,両ゲノム間には遺伝子の並び方の保存されていない,多様性に富んだ約300 kbpの領域が認められた,この領域は転移性遺伝子クラスターが多数存在する領域と一致しており,転移性遺伝子クラスターがゲノムの多様性を生み出す原因の一つである可能性が示唆された.
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DOI：
10.1094/phyto-98-7-0769
发表时间：
2008-07-01
期刊：
PHYTOPATHOLOGY
影响因子：
3.2
作者：
[Arashida, R., Kakizawa, S., Namba, S.]
通讯作者：
Namba, S.
DOI：
10.1089/dna.2007.0654
发表时间：
2008-04-01
期刊：
DNA AND CELL BIOLOGY
影响因子：
3.1
作者：
[Arashida, Ryo, Kakizawa, Shigeyuki, Namba, Shigetou]
通讯作者：
Namba, Shigetou
Presence of two glycolytic gene clusters in a severe pathogenic line of Canadidatus Phytoplasma asteris.
Canadidatus Phytoplasma asteris 的严重致病系中存在两个糖酵解基因簇。
Canadidatus Phytoplasma asteris 的严重致病系中存在两个糖酵解基因簇。
DOI：
--
发表时间：
2007
期刊：
Molecular Plant Pathology (in-press)
影响因子：
--
作者：
[Oshima, K., Kakizawa S., Arashida, R, Ishii, Y., Hoshi, A., Hayashi, Y., Kagiwada, S., Namba, S.]
通讯作者：
S.
Interaction between the membrane protein of a pathogen and insect microfilament complex determines insect-vector
病原体膜蛋白和昆虫微丝复合物之间的相互作用决定了昆虫媒介
病原体膜蛋白和昆虫微丝复合物之间的相互作用决定了昆虫媒介
DOI：
--
发表时间：
2006
期刊：
Proceedings of the National Academy of Sciences 103・11
影响因子：
--
作者：
[Suzuki, S., Oshima, K., Kakizawa, S., Arashida, R., Jung, H.-Y., Yamaji, Y., Nishiwaga, H., Ugaki, M., Namba, S.]
通讯作者：
S.
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