全ゲノム情報に基づいたファイトプラズマの病原性メカニズムの解明

基于全基因组信息阐明植原体致病机制

• 批准号: 05J12116
• 负责人: 嵐田 亮
• 金额: $ 1.73万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-05J12116/
• 关键词: ファイトプラズマ; 比較ゲノム; ゲノミックアイランド; ゲノミックアイラント

申請者らが解読したCandidatus Phytoplasma asteris OY-Mの全ゲノムに続き,米国においてcandidatus Phytoplasma asteris AY-WB(Aster yellows witches' broom)系統の全ゲノムが2006年に決定された、AY-WBはOY-Mと同種であるが,宿主植物や媒介昆虫が異なり,ゲノムサイもOY-Mよりも約150 kbp小さい.そこで,OY-MとAY-WBの比較ゲノム解析を行い,両ゲノムにおける転移性遺伝子クラスターの分布およびゲノム構造の差異について解析した.相同性検索を用いた手法によりAY-WBゲノム上の重複遺伝子を探索したところ,シングルコピー遺伝子の数はAY-WBとOY-Mでほぼ一致しており,AY-WBとOY-Mの遺伝子数の差は重複遺伝子の数の差によるものであることが示唆された.OY-MとAY-WB間におけるオーソログを相同性検索を用いた手法で同定し,遺伝子の並び順を比較した.その結果,OY-MとAY-WBとは同一種でありながら,両ゲノム間には遺伝子の並び方の保存されていない,多様性に富んだ約300 kbpの領域が認められた,この領域は転移性遺伝子クラスターが多数存在する領域と一致しており,転移性遺伝子クラスターがゲノムの多様性を生み出す原因の一つである可能性が示唆された.

The applicant's complete application of Candidatus Phytoplasma asteris OY-M was decided in 2006. The host plant vector insect is different, and the host plant vector insect is about 150 kbp. In this paper,OY-M and AY-WB comparison analysis is carried out, and the distribution of migration genetic data and the analysis of structural differences are carried out. The number of repeat vectors on AY-WB and OY-M is identical. The difference between the number of repeat vectors on AY-WB and OY-M is identical. The difference between the number of repeat vectors on AY-WB and OY-M is identical. The difference between the number of repeat vectors on OY-M and AY-WB is identical. The results show that OY-M and AY-WB are the same species, and the diversity of OY-M and AY-WB is rich in 300 kbp domain. The diversity of OY-M and AY-WB is rich in 300 kbp domain. The diversity of OY-M and AY-WB is rich in 300 kbp domain.

项目成果

Cloning and characterization of the antigenic membrane protein (Amp) gene and in situ detection of Amp from malformed flowers infected with Japanese hydrangea phyllody phytoplasma

• DOI: 10.1094/phyto-98-7-0769
• 发表时间: 2008-07-01
• 期刊: PHYTOPATHOLOGY
• 影响因子: 3.2
• 作者: Arashida, R.;Kakizawa, S.;Namba, S.
• 通讯作者: Namba, S.

Heterogeneic dynamics of the structures of multiple gene clusters in two pathogenetically different lines originating from the same phytoplasma

• DOI: 10.1089/dna.2007.0654
• 发表时间: 2008-04-01
• 期刊: DNA AND CELL BIOLOGY
• 影响因子: 3.1
• 作者: Arashida, Ryo;Kakizawa, Shigeyuki;Namba, Shigetou
• 通讯作者: Namba, Shigetou

Presence of two glycolytic gene clusters in a severe pathogenic line of Canadidatus Phytoplasma asteris.

Canadidatus Phytoplasma asteris 的严重致病系中存在两个糖酵解基因簇。

• 发表时间: 2007
• 期刊: Molecular Plant Pathology (in-press)
• 作者: Oshima;K.;Kakizawa S.;Arashida;R;Ishii;Y.;Hoshi;A.;Hayashi;Y.;Kagiwada;S.;Namba;S.
• 通讯作者: S.

Interaction between the membrane protein of a pathogen and insect microfilament complex determines insect-vector

病原体膜蛋白和昆虫微丝复合物之间的相互作用决定了昆虫媒介

• 发表时间: 2006
• 期刊: Proceedings of the National Academy of Sciences 103・11
• 作者: Suzuki;S.;Oshima;K.;Kakizawa;S.;Arashida;R.;Jung;H.-Y.;Yamaji;Y.;Nishiwaga;H.;Ugaki;M.;Namba;S.
• 通讯作者: S.