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構造システム生物学を指向した高度好熱菌の環境応答機構の研究

以结构系统生物学为重点的高嗜热细菌环境响应机制研究

基本信息

批准号：
16700279
负责人：
宮武秀行
金额：
$ 2.18万
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2006
项目状态：
已结题

项目摘要

我が国で実施された「タンパク3000」プロジェクトによって、タンパク質の立体構造が多数解析された。一方で、タンパク質個々の立体構造は生物を構成する部品であり、それらがどのように統合されて、全体として有機的なシステムを形成するのかが今後の構造生物学分野において重要な研課題になっている。そうした背景を踏まえ、私は高度好熱菌の環境応答機構をモデルシステムに選択して、センサーキナーゼタンパク質、転写制御タンパク質の立体構造に基づいて、システムとしての機構を解明することを目的として研究を進めた。研究の手順としては、高度好熱菌由来のセンサーキナーゼタンパク質、転写制御因子タンパク質の大量発現および結晶化を試みた。転写制御因子タンパク質については、2種類について構造解析を終了し、1種類の転写制御因子タンパク質については単結晶を得て、回折データを収集した後、現在構造解析を進行させている段階である。また、低分解能の単結晶が1種類得られたが、構造解析には至らなかった。2種類の転写制御タンパク質の構造を比較した結果、転写制御因子タンパク質は活性中心に存在する残基や、2次構造のパターンなどは高度に保存されている一方で、αヘリックスの位置が微妙に異なることにより、情報伝達経路の下流に位置するタンパク質との相互作用を調節していることが示唆された。一方、センサーキナーゼタンパク質については、1種類について単結晶は得られたものの、分解能が向上せずに、構造解析には至らなかった。

We have implemented the "3000" version of the "3000" version. The three-dimensional structure of one side and two sides is an important research topic in the field of structural biology in the future. The environmental response mechanism of highly pathogenic bacteria in the background is selected, the quality of the environment is controlled, and the three-dimensional structure of the environment is analyzed. Study on the origin of high temperature bacteria, the formation of high temperature bacteria, the formation of high temperature bacteria, the crystallization of high temperature bacteria The structure analysis is completed for 2 types of control factors, and the crystallization is completed for 1 type of control factors. The structure analysis is completed for 2 types of control factors, and the crystallization is completed for 1 type of control factors. The structure analysis of the crystal with low decomposition energy is very important. The results show that the structure of two kinds of molecular control factors exist in the active center of molecular control factors, the structure height of molecular control factors is preserved, the position of molecular control factors is subtly different, and the interaction of molecular control factors in the downstream of molecular control channels is regulated. One side, one kind, one