偶蹄目の家畜および野生動物における環境適応性に関する遺伝子のcSNPs探索
偶蹄目の家畜および野生動物における環境適応性に関する遺伝子のcSNPs探索
批准号:
16710147
负责人:
田中 和明
金额:
$1.86万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005
中文摘要
1)家畜豚品種およびイノシシ数亜種において、β3アドレナリン受容体遺伝子コード領域の完全長配列を決定し、そこに存在する1塩基多型(SNPs)を探索した。その結果、終止コドンの5塩基上流にT(チミン)の1塩基挿入変異を発見した。この変異によりフレームシェフトが生じアミノ酸配列は変異型においてC末側2アミノ酸残基を欠く受容体を生産すると考えられる。この変異型遺伝子の商業用豚品種における分布を調査した結果、ランドレース種および一部の系統豚では、変異型を持つ個体が非常に少ないのに対し、系統造成の過程にあるデュロック種の集団には、高頻度で存在することが明らかになった。また、梅山豚において、新たな変異を発見した。β3アドレナリン受容体は脂肪細胞において、エネルギー収支の調節に重要な役割を担っており、このSNPsによって豚の産業的形質に差異が生じるかどうかさらなる研究の必要がある。2)ウシ属の家畜および野生動物に、加えて河川水牛およぶ沼沢水牛において、βグロビン遺伝子の完全長塩基配列を決定した。その結果、血液中のヘモグロビンの電気泳動的多型に対応するSNPsの存在を明らかにし、タンパク質の電気泳動マーカーをDNAマーカーに置き換えることに成功した。さらに、河川水牛と沼沢水牛間における多型を発見したことから、両者の交雑群における適正な選抜マーカーを提供することが可能となった。3)家畜牛およびガウールの家畜型であるミタンにおいて、セロトニンレセプター1b遺伝子のコード領域の配列を決定し多型を探索した、その結果、北方系牛であるヘレフォード種とトカラ牛の間には多型は存在しなかった。しかし、ミタンにおいては家畜牛との間にアミノ酸置換を伴う変異が存在することを明らかにした。またインド系牛ではこの遺伝子の配列決定にはいたらなかったが、北方系牛との間には遺伝子の上流域において変異があることが示唆された。
英文摘要
1)家畜豚品種およびイノシシ数亜種において、β3アドレナリン受容体遺伝子コード領域の完全長配列を決定し、そこに存在する1塩基多型(SNPs)を探索した。その結果、終止コドンの5塩基上流にT(チミン)の1塩基挿入変異を発見した。この変異によりフレームシェフトが生じアミノ酸配列は変異型においてC末側2アミノ酸残基を欠く受容体を生産すると考えられる。この変異型遺伝子の商業用豚品種における分布を調査した結果、ランドレース種および一部の系統豚では、変異型を持つ個体が非常に少ないのに対し、系統造成の過程にあるデュロック種の集団には、高頻度で存在することが明らかになった。また、梅山豚において、新たな変異を発見した。β3アドレナリン受容体は脂肪細胞において、エネルギー収支の調節に重要な役割を担っており、このSNPsによって豚の産業的形質に差異が生じるかどうかさらなる研究の必要がある。2)ウシ属の家畜および野生動物に、加えて河川水牛およぶ沼沢水牛において、βグロビン遺伝子の完全長塩基配列を決定した。その結果、血液中のヘモグロビンの電気泳動的多型に対応するSNPsの存在を明らかにし、タンパク質の電気泳動マーカーをDNAマーカーに置き換えることに成功した。さらに、河川水牛と沼沢水牛間における多型を発見したことから、両者の交雑群における適正な選抜マーカーを提供することが可能となった。3)家畜牛およびガウールの家畜型であるミタンにおいて、セロトニンレセプター1b遺伝子のコード領域の配列を決定し多型を探索した、その結果、北方系牛であるヘレフォード種とトカラ牛の間には多型は存在しなかった。しかし、ミタンにおいては家畜牛との間にアミノ酸置換を伴う変異が存在することを明らかにした。またインド系牛ではこの遺伝子の配列決定にはいたらなかったが、北方系牛との間には遺伝子の上流域において変異があることが示唆された。
期刊论文(4)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Development and Characterization of CATS Markers for Genetic Linkage Mapping in the House Musk Shrew, Sunncus murinus.
用于家麝鼩 (Sunncus murinus) 遗传连锁图谱的 CATS 标记的开发和表征。
DOI:
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发表时间:
2005
期刊:
Experimental Animal 54(2)
影响因子:
--
作者:
[Adjei S, Sato A, Tanaka S, Kobayashi E, Tanaka K, Namikawa T, Ishikawa A]
通讯作者:
Ishikawa A
A Tandem Gene Duplication Followed by Recruitment of a Retrotransposon Created the Paralogous Bucentaur Gene (bcntp97) in the Ancestral Ruminant.
串联基因复制和逆转录转座子的招募在祖先反刍动物中产生了旁系同源的 Bucentaur 基因 (bcntp97)。
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Molecular Biology and Evolution (印刷中)
影响因子:
--
作者:
[Iwashita S, Ueno S, Nakashima K, Song SY, Ohshima K, Tanaka K, Endo H, Kimura J, Kurohmaru M, Fukuta K, David L, Osada N.]
通讯作者:
Osada N.
Cytogenetic comparison of the lesser mouse deer(Tragulus javanicus) and the greater mouse deer(T.napu).
小鼷鹿(Tragulus javanicus)和大鼷鹿(T.napu)的细胞遗传学比较。
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Cryologia 57
影响因子:
--
作者:
[K.S.Kim., K.Tanaka, H.Endo, K.Fukuta, J.Kimura et al.]
通讯作者:
J.Kimura et al.
ニホンカモシカの全ゲノム解読および地理的遺伝構造の解明
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批准号:22K05695
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2022
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负责人:田中 和明
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依托单位:
無性生殖世代の形質データ統合による植物寄生・腐生小房子のう菌類の分類体系構築
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批准号:18870002
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
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资助金额:$1.68万
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财政年份:2006
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负责人:田中 和明
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依托单位:
アジア地域におけるウシ亜科家畜とその野生近縁種の遺伝学的類縁関係と遺伝子資源保全
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批准号:99J00514
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$2.62万
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财政年份:1999
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负责人:田中 和明
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依托单位:
人工現実感を用いた内部構造の視覚化システムの構築
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批准号:09780351
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1997
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负责人:田中 和明
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依托单位:
海外基金