偶蹄目の家畜および野生動物における環境適応性に関する遺伝子のcSNPs探索

cSNP 寻找与家养和野生偶蹄动物环境适应性相关的基因

• 批准号: 16710147
• 负责人: 田中 和明
• 金额: $ 1.86万
• 依托单位: Azabu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16710147/
• 关键词: 1塩基多型(SNPs); 偶蹄類; ウシ; ブタ; β3アドレナリンレセプター; βグロビン; セロトニンレセプター; 環境適応性; 遺伝子資源; 機能的SNPs; DNA多型; 偶蹄目; 豚

1)家畜豚品種およびイノシシ数亜種において、β3アドレナリン受容体遺伝子コード領域の完全長配列を決定し、そこに存在する1塩基多型(SNPs)を探索した。その結果、終止コドンの5塩基上流にT(チミン)の1塩基挿入変異を発見した。この変異によりフレームシェフトが生じアミノ酸配列は変異型においてC末側2アミノ酸残基を欠く受容体を生産すると考えられる。この変異型遺伝子の商業用豚品種における分布を調査した結果、ランドレース種および一部の系統豚では、変異型を持つ個体が非常に少ないのに対し、系統造成の過程にあるデュロック種の集団には、高頻度で存在することが明らかになった。また、梅山豚において、新たな変異を発見した。β3アドレナリン受容体は脂肪細胞において、エネルギー収支の調節に重要な役割を担っており、このSNPsによって豚の産業的形質に差異が生じるかどうかさらなる研究の必要がある。2)ウシ属の家畜および野生動物に、加えて河川水牛およぶ沼沢水牛において、βグロビン遺伝子の完全長塩基配列を決定した。その結果、血液中のヘモグロビンの電気泳動的多型に対応するSNPsの存在を明らかにし、タンパク質の電気泳動マーカーをDNAマーカーに置き換えることに成功した。さらに、河川水牛と沼沢水牛間における多型を発見したことから、両者の交雑群における適正な選抜マーカーを提供することが可能となった。3)家畜牛およびガウールの家畜型であるミタンにおいて、セロトニンレセプター1b遺伝子のコード領域の配列を決定し多型を探索した、その結果、北方系牛であるヘレフォード種とトカラ牛の間には多型は存在しなかった。しかし、ミタンにおいては家畜牛との間にアミノ酸置換を伴う変異が存在することを明らかにした。またインド系牛ではこの遺伝子の配列決定にはいたらなかったが、北方系牛との間には遺伝子の上流域において変異があることが示唆された。

1) livestock dolphin species お よ び イ ノ シ シ number 亜 kind に お い て, beta 3 ア ド レ ナ リ ン by let body heritage 伝 son コ ー の ド field completely decided long match column を し, そ こ に exist す る type 1 salt Quito (SNPs) を explore し た. Youdaoplaceholder0 そ result, termination コド <e:1> <s:1> the flow of にT on the 5-base is に (チ チ) <s:1> the entry of the 1-base is abnormal を occurrence た た. こ の - different に よ り フ レ ー ム シ ェ フ ト が raw じ ア ミ ノ acid with column は - alien に お い て side at the end of the 2 C ア ミ ノ acid residues を owe く by the capacity of body を す production る と exam え ら れ る. こ の - traces of alien 伝 son の business with dolphin species に お け る distribution を survey し た results, ラ ン ド レ ー ス kind お よ び a dolphin の system で は, - alien を つ individual が very less に な い の に し seaborne, system caused の に process あ る デ ュ ロ ッ ク の set 団 に は, high frequency exist で す る こ と が Ming ら か に な っ た. Youdaoplaceholder0, meishan dolphin にお て て, new たな variation を occurrence た た. Beta 3 ア ド レ ナ リ ン は by let body fat cells に お い て, エ ネ ル ギ ー の 収 branch cut を bear important な に service っ て お り, こ の SNPs に よ っ て dolphin の industry character に differences born が じ る か ど う か さ ら な る research の necessary が あ る. 2) ウ シ is の livestock お よ び wildlife に, plus え て river buffaloes お よ ぶ bog ohsawa buffalo に お い て, beta グ ロ ビ ン heritage 伝 の completely salt base with long sequence を decided し た. そ の results, in the blood の ヘ モ グ ロ ビ ン の type electric 気 swimming more に 応 seaborne す る SNPs exist の を Ming ら か に し, タ ン パ ク qualitative の electric 気 swimming マ ー カ ー を DNA マ ー カ ー に buy き in え る こ と に successful し た. さ ら に, river buffaloes と bog ohsawa between buffalo に お け る polymorphism を 発 see し た こ と か ら, struck の pay 雑 group に お け る optimum is な choose sorting マ ー カ ー を provide す る こ と が may と な っ た. 3) livestock cattle お よ び ガ ウ ー ル の livestock type で あ る ミ タ ン に お い て, セ ロ ト ニ ン レ セ プ タ ー 1 b heritage 伝 son の コ ー の ド field match column を decided し polymorphism を explore し た, そ の results, northern cattle で あ る ヘ レ フ ォ ー ド kind と ト カ ラ between cow の に は polymorphism は exist し な か っ た. し か し, ミ タ ン に お い て は livestock cattle と の between に ア ミ ノ acid replacement を with う variations exist different が す る こ と を Ming ら か に し た. ま た イ ン ド department cattle で は こ の heritage 伝 の match sequence decision に は い た ら な か っ た が, northern cattle と の between に は heritage in the upper reaches of the son 伝 の に お い て - different が あ る こ と が in stopping さ れ た.

项目成果

Development and Characterization of CATS Markers for Genetic Linkage Mapping in the House Musk Shrew, Sunncus murinus.

用于家麝鼩 (Sunncus murinus) 遗传连锁图谱的 CATS 标记的开发和表征。

• 发表时间: 2005
• 期刊: Experimental Animal 54(2)
• 作者: Adjei S;Sato A;Tanaka S;Kobayashi E;Tanaka K;Namikawa T;Ishikawa A
• 通讯作者: Ishikawa A

A Tandem Gene Duplication Followed by Recruitment of a Retrotransposon Created the Paralogous Bucentaur Gene (bcntp97) in the Ancestral Ruminant.

串联基因复制和逆转录转座子的招募在祖先反刍动物中产生了旁系同源的 Bucentaur 基因 (bcntp97)。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Molecular Biology and Evolution (印刷中)
• 作者: Iwashita S;Ueno S;Nakashima K;Song SY;Ohshima K;Tanaka K;Endo H;Kimura J;Kurohmaru M;Fukuta K;David L;Osada N.
• 通讯作者: Osada N.

Cytogenetic comparison of the lesser mouse deer(Tragulus javanicus) and the greater mouse deer(T.napu).

小鼷鹿(Tragulus javanicus)和大鼷鹿(T.napu)的细胞遗传学比较。

• 发表时间: 2004
• 期刊: Cryologia 57
• 作者: K.S.Kim.;K.Tanaka;H.Endo;K.Fukuta;J.Kimura et al.
• 通讯作者: J.Kimura et al.