Estimation of Large Phylogeny Using Maximum Composite Likelihood
Estimation of Large Phylogeny Using Maximum Composite Likelihood
批准号:
18570217
负责人:
TAMURA Koichiro
金额:
$1.95万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2008
中文摘要
分子系統樹の推定は生命科学の様々な分野で利用される基本的な操作であるが、その方法は理論的側面に長ける最尤法と計算効率に長ける近隣結合法に二分される。そこで、新たに開発した最大複合尤度法を利用し、両者の優れた点を合わせることを試みた。効果はコンピュータ・シミュレーションによって評価した。その結果、最大複合尤度法の適用により、近隣結合法、最尤法のいずれにおいても推定精度、計算時間の改良に成功した
英文摘要
分子系統樹の推定は生命科学の様々な分野で利用される基本的な操作であるが、その方法は理論的側面に長ける最尤法と計算効率に長ける近隣結合法に二分される。そこで、新たに開発した最大複合尤度法を利用し、両者の優れた点を合わせることを試みた。効果はコンピュータ・シミュレーションによって評価した。その結果、最大複合尤度法の適用により、近隣結合法、最尤法のいずれにおいても推定精度、計算時間の改良に成功した
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会议论文
MEGA4による分子系統解析
使用 MEGA4 进行分子系统发育分析
DOI:
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发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Araki, K. & Ohara, M, 田村浩一郎]
通讯作者:
田村浩一郎
巨大系統樹推定のための最尤法の適用
最大似然法在大系统发育树估计中的应用
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kumar S, Nei M, Dudley J, Tamura K., Tamura K, 田村浩一郎, 田村浩一郎, 田村浩一郎]
通讯作者:
田村浩一郎
Application of Maximum Likelihood Methods for Large Phylogeny
最大似然法在大系统发育中的应用
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kumar S, Nei M, Dudley J, Tamura K., Tamura K, 田村浩一郎, 田村浩一郎, 田村浩一郎, 田村浩一郎, Koichiro Tamura]
通讯作者:
Koichiro Tamura
Experimental estimation of evolutionary adaptation to cooler climate by Drosophila albomicans during distribution expansion to the temperate zones
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批准号:23370096
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$12.48万
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财政年份:2011
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负责人:TAMURA Koichiro
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依托单位:
The interactive effects of speciation and introgression on the mitochondrial DNA evolution in Drosophila
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批准号:15570082
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2003
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负责人:TAMURA Koichiro
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依托单位:
海外基金