Estimation of Large Phylogeny Using Maximum Composite Likelihood

使用最大复合似然估计大系统发育

• 批准号: 18570217
• 负责人: TAMURA Koichiro
• 金额: $ 1.95万
• 依托单位: Tokyo Metropolitan University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18570217/
• 关键词: 複合尤度; 最尤法; 系統解析; 分子系統樹; 分子進化; 進化距離; 近隣結合法; 配列データ; コンピュータシミュレーション

分子系統樹の推定は生命科学の様々な分野で利用される基本的な操作であるが、その方法は理論的側面に長ける最尤法と計算効率に長ける近隣結合法に二分される。そこで、新たに開発した最大複合尤度法を利用し、両者の優れた点を合わせることを試みた。効果はコンピュータ・シミュレーションによって評価した。その結果、最大複合尤度法の適用により、近隣結合法、最尤法のいずれにおいても推定精度、計算時間の改良に成功した

Molecular phylogenetic tree の presumption は life science の others 々 な eset で using さ れ る basic な operation で あ る が, そ の way は theory side に long け る most especially と method working rate に long け る close combination with 隣 に binary さ れ る. Open そ こ で, new た に 発 し た maximum composite especially degree を using し, struck の optimal れ た point を わ せ る こ と を try み た. Unseen fruit は コ ン ピ ュ ー タ · シ ミ ュ レ ー シ ョ ン に よ っ て review 価 し た. そ の results, maximum degree of composite especially の applicable に よ り, in combination with recent 隣, most especially の い ず れ に お い て も presumption of improved precision and computing time の に successful し た

项目成果

MEGA4による分子系統解析

使用 MEGA4 进行分子系统发育分析

• 发表时间: 2008
• 作者: Araki;K. & Ohara;M;田村浩一郎
• 通讯作者: 田村浩一郎

巨大系統樹推定のための最尤法の適用

最大似然法在大系统发育树估计中的应用

• 发表时间: 2008
• 作者: Kumar S;Nei M;Dudley J;Tamura K.;Tamura K;田村浩一郎;田村浩一郎;田村浩一郎
• 通讯作者: 田村浩一郎

Application of Maximum Likelihood Methods for Large Phylogeny

最大似然法在大系统发育中的应用

• 发表时间: 2008
• 作者: Kumar S;Nei M;Dudley J;Tamura K.;Tamura K;田村浩一郎;田村浩一郎;田村浩一郎;田村浩一郎;Koichiro Tamura
• 通讯作者: Koichiro Tamura