SBDD中配体结合亲和力预测方法的发展-猫眼课题宝

SBDD中配体结合亲和力预测方法的发展

批准号：

18590096

负责人：

NAKANISHI Isao

金额：

$2.27万

依托单位：

Kinki University (2008)Kyoto University (2006-2007)

依托单位国家：

日本

项目类别：

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

财政年份：

2006

资助国家：

日本

项目状态：

已结题

起止时间：

2006 至 2008

来源：

https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18590096/

关键词：

医薬分子設計フラグメント分子軌道法結合エネルギー溶媒和エネルギー構造最適化 FKBP HIV-1プロテアーゼタンパク質 SBDD 溶媒和カネルギー HIV-1

项目摘要

项目成果

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フラグメント分子軌道(FMO)法による相互作用エネルギーを用いた薬物活性予測法の開発を行った。水和エネルギーにPCM法用いたFMO/PCM法は、パラメータを用いないab initioな活性(結合自由エネルギー)予測法にもかかわらず、実験値のオーダーの再現性には非常に優れていた。今後、分子運動やエントロピー等を考慮することにより、実用レベルでの予測精度を達成できるものと期待される。

期刊论文(0)

专著(0)

科研奖励(0)

会议论文

C1-π interactions in protein-ligand complexes.

蛋白质-配体复合物中的 C1-π 相互作用。

DOI： --

发表时间： 2008

期刊：

影响因子： --

作者：

[Imai N-Y, Inoue Y, Isao Nakanishi, Kazuo Kitaura, Kitaura Kazuo, 中村真也, 浅田直也, 北浦和夫, 北浦和夫, Asada Naoya, Asada Naoya, Kitaura Kazuo, Kitaura Kazuo, Imai Nakamura-Yumi, Asada Naoya, Nakanishi Isao, Asada Naoya, Imai Nakamura-Yumi]

通讯作者： Imai Nakamura-Yumi

フラグメント分子軌道法による蛋白質-リガンド複合体の分極エネルギーの解析

片段分子轨道法分析蛋白质-配体复合物的极化能

DOI： --

发表时间： 2007

期刊：

影响因子： --

作者：

[浅田直也, 仲西功, D.G. Fedorov, 北浦和夫, 仲西功]

通讯作者：仲西功

Change in a protein's electronic structure induced by an explicit solvent : an ab initio Fragment Molecular Orbital (FMO) study of ubiquitin

显式溶剂诱导蛋白质电子结构的变化：泛素的从头开始片段分子轨道 (FMO) 研究