トリパノソーマ原虫の遺伝的多型と薬剤耐性の解析

锥虫原虫遗传多态性及耐药性分析

• 批准号: 06F06444
• 负责人: 大橋 和彦 (2007-2008)
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06F06444/
• 关键词: トリパノソーマ原虫; 分子疫学調査; Internal transcribed spacer; 薬剤耐性株; Samorin; samorin

トリパノソーマ原虫(Trypanosoma evansi)を含め、原虫ゲノムにおける遺伝子多型は疫学的な重要性のみならず、薬剤耐性や原虫の病原性など生物学的性状との関連においても重要である。Internal transcribed spacer(ITS)は、18S、5.8S、あるいは28SリボゾームRNA遺伝子の反復配列領域にあり、ゲノムあたり、100〜200コピー存在している。ITSはこれまで遺伝子マーカーとして、各原虫株の分類、進化系統樹解析に用いられてきた。トリパノソーマ原虫は、野外において治療薬に耐性を示す薬剤耐性株が出現しており、今後重要な問題となってくる。しかし、その薬剤耐性機構については、不明な点が多く遺伝子多型と薬剤耐性の関連については、全く知られていない。そこで本研究では、T.evansiのITS領域における遺伝子多型とそれが原虫の生物学的性状に及ぼす影響(特に薬剤耐性)について検討した。フィリピンにおいて、異なる5頭のT.evansi感染水牛から血液由来ゲノム材料を採取し、このゲノム材料から検出したT.evansiのITS領域(31クローン)を水牛由来T.evansiおよびGenBankなどに登録してある各種トリパノソーマ原虫の配列と比較解析した。その結果、T.evansi特異的遺伝子多型を同定したので、さらにITS配列に基づく系統樹解析を行い進化学上の遺伝子変化の同定を試みた。系統樹解析により、今回検出されたT.evansiのITS領域は、T.bruceiやT.congolenseのITS配列とは別の系統に分類され、いくつかのクローンは、既に報告されているT.evansi B18と同系統に分類され、このクローンとの進化上の関連が示唆された。

Trypanosoma evansi is a protozoan that contains protozoa, protozoa and protozoa. It is important to understand the importance of genetic polymorphism in epidemiology, resistance to protozoa, pathogenicity of protozoa, biological characteristics and relationships. Internal transcribed spacer(ITS): 18S, 5.8 S, 28 S, 100 ~ 200 C, 100 ~ 200 C. The classification and phylogenetic tree analysis of the protozoan strains were carried out. The emergence of resistant strains in the field indicates that they are important in the future. For example, if a patient is resistant to drugs, he/she may not be able to detect the drug resistance. In this study, T.evansi's genetic polymorphism in ITS field was investigated, as well as the biological characteristics and effects of protozoa (specific resistance). 5 T.evansi infected buffaloes, origin of blood, selection of materials, identification of materials, identification of T.evansi in ITS field (31), origin of buffaloes, identification of T. evansi in GenBank, and comparative analysis of various species of T.evansi. The results showed that T.evansi specific gene polymorphism was identified and ITS alignment was analyzed by phylogenetic tree analysis. Phylogenetic tree analysis, current search for T.evansi's ITS domain, T.brucei and T.congolense's ITS alignment, classification of different systems, report for T.evansi B18's phylogenetic classification, evolutionary correlation of different systems.

项目成果

Comparative assessment of Th1 and Th2 cytokines of swamp type buffalo and other bubaline breeds by molecular cloning, sequencing and phylogenetics.

通过分子克隆、测序和系统发育对沼泽型水牛和其他水牛品种的 Th1 和 Th2 细胞因子进行比较评估。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Vet.Immunol.Immunopathol. 113
• 作者: Mingala CN;Odbileg R et al.
• 通讯作者: Odbileg R et al.

Development of the resazurin microtiter assay for assessment of anti-Surra drug. Vancouver, Canada

开发用于评估抗 Surra 药物的刃天青微量滴定法。

• 发表时间: 2008
• 作者: Odbileg;R.;et al.
• 通讯作者: et al.

Complete cDNA sequences and phylogenetic analysis to Th1 and Th2 cytokines of bactrian camel (Camelus bactrianus).

双峰驼 (Camelus bactrianus) Th1 和 Th2 细胞因子的完整 cDNA 序列和系统发育分析。

• 发表时间: 2006
• 期刊: J.Vet.Med.Sci. 68
• 作者: Odbileg R;Onuma M et al.
• 通讯作者: Onuma M et al.

Cytokine Responses in Camels (Camelus bactrianus) Vaccinated with Brucella abortus strain 19 Vaccine.

接种流产布鲁氏菌 19 株疫苗的骆驼 (Camelus bactrianus) 的细胞因子反应。

• 发表时间: 2008
• 期刊: J. Vet. Med. Sci. 70
• 作者: Odbileg R;Purevtseren B;Gantsetseg D;Boldbaatar B;Buyannemekh T;Erdenebaatar J. Konnai S;Onuma M;Ohashi K.
• 通讯作者: Ohashi K.

Molecular cloning, sequencing and phylogenetic analysis of inflammatory cytokines of swamp type buffalo contrasting with other bubaline breeds

沼泽型水牛与其他水牛品种炎症细胞因子的分子克隆、测序和系统发育分析

• 发表时间: 2007
• 期刊: Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases 30
• 作者: Mingala N;Konnai S;Ohashi K;et. al.
• 通讯作者: et. al.