コリネ型細菌による木質系バイオマスの高効率分解
コリネ型細菌による木質系バイオマスの高効率分解
批准号:
06J07909
负责人:
柘植 陽太
金额:
$1.22万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
中文摘要
コリネ型細菌は枯草菌などと比較して菌体外分泌物が少なく、旺盛な増殖力と溶菌しにくいという特性のため、外来遺伝子の発現宿主として非常に高い能力を有している。本年度は当初の目的であるClostridium cellulovorans由来のセルラーゼ複合体であるセルロソームの分泌、再構築を試みた。しかし、通常のセルラーゼの分泌は確認できたが、セルロソームを構成するセルラーゼの分泌は確認できなかった。そこで本研究のもうひとつの目的である、コリネ型細菌のより良いシグナル配列を取得ため、コンピューター解析からシグナル配列を持つ遺伝子を310種類抽出した。それらの遺伝子のシグナル配列をα-アミラーゼ遺伝子と融合させ、ヨウ素でんぷん反応によって検出したところ、22種類の遺伝子の分泌能を確認した。その中で9種類がTatシグナルであると予想された。Tat分泌経路は他の分泌経路とは違い、細胞内で蛋白質が折りたたまれた後、分泌される。従ってプロテアーゼによる分解を受けにくく、加えて細胞内シャペロンを利用することによって、機能的な蛋白質が得られる可能性が高い。現在、どのTatシグナルが一番セルロソームを構成するセルラーゼの分泌に最適かを選定中である。本研究室ではCglutamicum R株の遺伝子破壊株ライブラリーを作製済みである。分泌能を確認した遺伝子の破壊株を顕微鏡で観察したところ、cgR1596破壊株が野生株と比較して3倍程度に伸びた形態変化を示した。染色体分配に異常は認められないことから、CgR1596は細胞分離に関与すると考えられた。本タンパク質はC末端にはエンドペプチダーゼドメインが存在する。本ドメインを同じく有するcgR2070を併せて破壊するとより長い形態を示し、一個体中の核様体数も4.1個に増加した。従ってこれら二つの遺伝子がコリネ型細菌の細胞分離に重要であると考えられた。
英文摘要
コリネ型細菌は枯草菌などと比較して菌体外分泌物が少なく、旺盛な増殖力と溶菌しにくいという特性のため、外来遺伝子の発現宿主として非常に高い能力を有している。本年度は当初の目的であるClostridium cellulovorans由来のセルラーゼ複合体であるセルロソームの分泌、再構築を試みた。しかし、通常のセルラーゼの分泌は確認できたが、セルロソームを構成するセルラーゼの分泌は確認できなかった。そこで本研究のもうひとつの目的である、コリネ型細菌のより良いシグナル配列を取得ため、コンピューター解析からシグナル配列を持つ遺伝子を310種類抽出した。それらの遺伝子のシグナル配列をα-アミラーゼ遺伝子と融合させ、ヨウ素でんぷん反応によって検出したところ、22種類の遺伝子の分泌能を確認した。その中で9種類がTatシグナルであると予想された。Tat分泌経路は他の分泌経路とは違い、細胞内で蛋白質が折りたたまれた後、分泌される。従ってプロテアーゼによる分解を受けにくく、加えて細胞内シャペロンを利用することによって、機能的な蛋白質が得られる可能性が高い。現在、どのTatシグナルが一番セルロソームを構成するセルラーゼの分泌に最適かを選定中である。本研究室ではCglutamicum R株の遺伝子破壊株ライブラリーを作製済みである。分泌能を確認した遺伝子の破壊株を顕微鏡で観察したところ、cgR1596破壊株が野生株と比較して3倍程度に伸びた形態変化を示した。染色体分配に異常は認められないことから、CgR1596は細胞分離に関与すると考えられた。本タンパク質はC末端にはエンドペプチダーゼドメインが存在する。本ドメインを同じく有するcgR2070を併せて破壊するとより長い形態を示し、一個体中の核様体数も4.1個に増加した。従ってこれら二つの遺伝子がコリネ型細菌の細胞分離に重要であると考えられた。
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Random segment deletion based on IS31831 and Cre/loxP excision system in Corynebacterium glutamicum.
基于谷氨酸棒杆菌 IS31831 和 Cre/loxP 切除系统的随机片段删除。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Appl Microbiol Biotechnol 74
影响因子:
--
作者:
[Suegami, T. & Michimata, C., Yuta Orito, Yuta Orito, 一番ヶ瀬友紀, 一番ヶ瀬友紀, 一番ヶ瀬友紀, Yota Tsuge, Yota Tsuge]
通讯作者:
Yota Tsuge
Isolation of a new insertion sequence, IS13655, and its application to Corynebacterium glutamicum genome mutagenesis
新插入序列 IS13655 的分离及其在谷氨酸棒杆菌基因组诱变中的应用
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Biosci Biotechnol Biochem 71
影响因子:
--
作者:
[Suegami, T. & Michimata, C., Yuta Orito, Yuta Orito, 一番ヶ瀬友紀, 一番ヶ瀬友紀, 一番ヶ瀬友紀, Yota Tsuge]
通讯作者:
Yota Tsuge
DOI:
10.1099/mic.0.2006/003657-0
发表时间:
2007-04
期刊:
Microbiology
影响因子:
1.5
作者:
[H. Yukawa;Crispinus A. Omumasaba;H. Nonaka;P. Kós;N. Okai;N. Suzuki;Masako Suda;Y. Tsuge;J. Watanabe;Yoko Ikeda;A. Vertès;M. Inui]
通讯作者:
H. Yukawa;Crispinus A. Omumasaba;H. Nonaka;P. Kós;N. Okai;N. Suzuki;Masako Suda;Y. Tsuge;J. Watanabe;Yoko Ikeda;A. Vertès;M. Inui
Isolation of a new insertion sequence, IS13655 and its application to Corynebacterium glutamicum genome mutagenesis.
新插入序列 IS13655 的分离及其在谷氨酸棒杆菌基因组诱变中的应用。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Biosci Biotechnol Biochem (印刷中)
影响因子:
--
作者:
[Tsuge Y., Suzuki N., Ninomiya K., Inui M., Yukawa H.]
通讯作者:
Yukawa H.
High throughput transposon mutagenesis and construction mutant library of Corynebacterium glutamicum.
谷氨酸棒杆菌高通量转座子诱变及突变体库构建。
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Appl Environ Microbiol 72
影响因子:
--
作者:
[Suzuki, N., Okai, N., Nonaka, H., Tsuge, Y., Inui, M., Yukawa, H.]
通讯作者:
H.
糖消費速度を感知する代謝センサーシステムの解明
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批准号:21K05359
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.66万
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财政年份:2021
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负责人:柘植 陽太
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依托单位:
海外基金