コリネ型細菌による木質系バイオマスの高効率分解

棒状细菌高效分解木质生物质

• 批准号: 06J07909
• 负责人: 柘植 陽太
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Nara Institute of Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06J07909/
• 关键词: コリネ型細菌; セルラーゼ; 細胞分裂; バイオマス

コリネ型細菌は枯草菌などと比較して菌体外分泌物が少なく、旺盛な増殖力と溶菌しにくいという特性のため、外来遺伝子の発現宿主として非常に高い能力を有している。本年度は当初の目的であるClostridium cellulovorans由来のセルラーゼ複合体であるセルロソームの分泌、再構築を試みた。しかし、通常のセルラーゼの分泌は確認できたが、セルロソームを構成するセルラーゼの分泌は確認できなかった。そこで本研究のもうひとつの目的である、コリネ型細菌のより良いシグナル配列を取得ため、コンピューター解析からシグナル配列を持つ遺伝子を310種類抽出した。それらの遺伝子のシグナル配列をα-アミラーゼ遺伝子と融合させ、ヨウ素でんぷん反応によって検出したところ、22種類の遺伝子の分泌能を確認した。その中で9種類がTatシグナルであると予想された。Tat分泌経路は他の分泌経路とは違い、細胞内で蛋白質が折りたたまれた後、分泌される。従ってプロテアーゼによる分解を受けにくく、加えて細胞内シャペロンを利用することによって、機能的な蛋白質が得られる可能性が高い。現在、どのTatシグナルが一番セルロソームを構成するセルラーゼの分泌に最適かを選定中である。本研究室ではCglutamicum R株の遺伝子破壊株ライブラリーを作製済みである。分泌能を確認した遺伝子の破壊株を顕微鏡で観察したところ、cgR1596破壊株が野生株と比較して3倍程度に伸びた形態変化を示した。染色体分配に異常は認められないことから、CgR1596は細胞分離に関与すると考えられた。本タンパク質はC末端にはエンドペプチダーゼドメインが存在する。本ドメインを同じく有するcgR2070を併せて破壊するとより長い形態を示し、一個体中の核様体数も4.1個に増加した。従ってこれら二つの遺伝子がコリネ型細菌の細胞分離に重要であると考えられた。

The growth of bacteria in vitro is characterized by low secretion, high reproductive capacity, high lytic capacity, and high host capacity for the emergence of foreign pathogens. This year's goal is to restore the secretion and reconstruction of Clostridium cellulovorans. The normal secretion is confirmed. The normal secretion is confirmed. The aim of this study is to extract 310 species of bacteria from the genome. The secretion of 22 kinds of genes was confirmed by the fusion of α-γ- 9 kinds of Tat Tat secretion pathway and other secretion pathway are reversed, intracellular proteins are separated and secreted. The possibility of protein production is high, especially in the case of protein production. Now, the best choice for the secretion of Tat Shura is to select a suitable solution. In our laboratory, we studied the genetic diversity of Cglutamicum R strain. Secretion ability was confirmed by microscopic observation of the growth of cgR1596, which was 3 times higher than that of wild plants. Chromosome distribution abnormalities are recognized, CgR1596 is associated with cell segregation, and The end of this article is the end of the article. The number of nuclei in a body increased by 4.1. It is important to isolate the cells of bacteria with high growth rate.

项目成果

Random segment deletion based on IS31831 and Cre/loxP excision system in Corynebacterium glutamicum.

基于谷氨酸棒杆菌 IS31831 和 Cre/loxP 切除系统的随机片段删除。

• 发表时间: 2007
• 期刊: Appl Microbiol Biotechnol 74
• 作者: Suegami;T. & Michimata;C.;Yuta Orito;Yuta Orito;一番ヶ瀬友紀;一番ヶ瀬友紀;一番ヶ瀬友紀;Yota Tsuge;Yota Tsuge
• 通讯作者: Yota Tsuge

Isolation of a new insertion sequence, IS13655, and its application to Corynebacterium glutamicum genome mutagenesis

新插入序列 IS13655 的分离及其在谷氨酸棒杆菌基因组诱变中的应用

• 发表时间: 2007
• 期刊: Biosci Biotechnol Biochem 71
• 作者: Suegami;T. & Michimata;C.;Yuta Orito;Yuta Orito;一番ヶ瀬友紀;一番ヶ瀬友紀;一番ヶ瀬友紀;Yota Tsuge
• 通讯作者: Yota Tsuge

Comparative analysis of the Corynebacterium glutamicum group and complete genome sequence of strain R.

• DOI: 10.1099/mic.0.2006/003657-0
• 发表时间: 2007-04
• 期刊: Microbiology
• 影响因子: 1.5
• 作者: H. Yukawa;Crispinus A. Omumasaba;H. Nonaka;P. Kós;N. Okai;N. Suzuki;Masako Suda;Y. Tsuge;J. Watanabe;Yoko Ikeda;A. Vertès;M. Inui

Isolation of a new insertion sequence, IS13655 and its application to Corynebacterium glutamicum genome mutagenesis.

新插入序列 IS13655 的分离及其在谷氨酸棒杆菌基因组诱变中的应用。

• 发表时间: 2007
• 期刊: Biosci Biotechnol Biochem (印刷中)
• 作者: Tsuge Y.;Suzuki N.;Ninomiya K.;Inui M.;Yukawa H.
• 通讯作者: Yukawa H.

High throughput transposon mutagenesis and construction mutant library of Corynebacterium glutamicum.

谷氨酸棒杆菌高通量转座子诱变及突变体库构建。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Appl Environ Microbiol 72
• 作者: Suzuki;N.;Okai;N.;Nonaka;H.;Tsuge;Y.;Inui;M.;Yukawa;H.
• 通讯作者: H.