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藍藻ホスホリブロキナーゼのX線構造解析による反応機構と活性制御機構の解明

通过蓝绿藻磷酸脂激酶的X射线结构分析阐明反应机制和活性控制机制

基本信息

批准号：
18770087
负责人：
松村浩由
金额：
$ 2.18万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究は,藍藻ボスホリブロキナーゼ(PRK)の反応機構ならびに活性調節機構をX線構造解析によって解明することを目的とし,以下の実験を行った。藍藻Synecococcus由来PRKの大量培養・精製系を構築した。精製手順は、藍藻PRKを大量に生産した大腸菌を破砕し,硫安分画,Niアフィニティークロマトグラフィー、ゲル濾過クロマトグラフィーで精製を行った。その後、動的溶液光散乱法装置(DLS)を用いて,溶液状態でのサンプルの結晶化能を確認した。続いて、His-tagドメインを有した酵素を用いて、結晶化を行った。恒温インキュベータ(20℃と4℃)で、種々の結晶化条件の検討を行ったところ、PEG3350を沈殿剤として用いた条件で、0.2x0.2x0.2mm程度のX線回折実験に適した大きさの単結晶を作成することに初めて成功した。しかし、大型放射光施設Spring-8にてX線回折実験を行ったところ回折能3.8Å程度と、構造解析には不十分であった。次に,ThrombinによってHis-tagドメインを切断し、さらに、PRKの本体をゲル濾過クロマトグラフィーにより精製した。その後、結晶化を行ったところ,0.05mm程度の単結晶を作成することに成功したが、大きさが不十分であり、構造解析可能な回折データが得られなかった。次に、PRKの活性調節因子であるCP12タンパク1質の精製系の構築にとりくんだ。PRKとCP12の結合をpull-downassayにて確認したが、結晶が得られなかった。続いて、CP12タンパク質のPRK結合ペプチドを合成し、PRKとCP12の結合をpull-down assayにて確認し、その後結晶化を行ったところ、0.05mm程度の単結晶を作成することができた。現在、結晶の改善を目指し、PRKとCP12ペプチド複合体の結晶化を行っている。

This study aims to elucidate the mechanism of cyanobacteria in vivo and its activity regulation by X-ray structural analysis. Cyanobacteria Synecoccus is derived from the construction of a mass culture and purification system of PRK Refined hand, cyanobacteria PRK large production of Escherichia coli, sulfur painting,Ni After the use of the dynamic solution light scattering device (DLS), the crystallization ability of the solution state was confirmed. In addition, His-tag can also be used for crystallization. The crystallization conditions of PEG 3350 were studied at constant temperature (20℃ to 4℃). The crystallization conditions of PEG3350 and PEG3350 were studied. The crystallization conditions of PEG3350 and PEG3350 were studied. The crystallization conditions of PEG 3350 and PEG 3350 were determined by X-ray diffraction. Spring-8 X-ray retroflexion energy 3.8 degrees, structural analysis 3.0 degrees. In addition,Thrombin can also be used to cut off and refine the body of PRK. After the crystallization, the crystallization was successfully completed at the level of 0.05 mm, and the structural analysis was possible. Secondly, the regulation factor of PRK activity is determined by CP12. Prk CP12 and pull-down assay confirm that crystallization is possible. In addition, CP12 was synthesized by a pull-down assay to confirm the bond between PRK and CP12, and a single crystal of 0.05 mm was prepared. Now, the crystallization of CP12 complex has been improved.