ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼリン酸化酵素の結晶構造解析
ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼリン酸化酵素の結晶構造解析
批准号:
14780523
负责人:
松村 浩由
金额:
$2.18万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 2003
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ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼ(PEPC)は、C4植物で光合成初期炭酸固定反応を触媒している酵素である。PEPCをイネに高発現させることによって、炭酸固定効率が増大し、光合成の酸素阻害が低減されるとの報告があったが(Nature Biotech.17,76-80(1999))、その後の報告で、イネで高発現したPEPCは必ずしもその酵素活性を最大限に発揮していない可能性が示唆されている。PEPCの活性調節がうまく機能していないのが原因であると考えられている。そこで、我々はPEPCの活性調節機構の全容解明に向けてPEPC-PKの結晶構造解析を目指ざし、以下の実験を進めた。C4植物フラベリア由来PEPC-PKの大量精製系を二種類(pET16b,His-tagged酵素とpeT43a,thrombin処理酵素)確立し、大量精製に成功した。その後の恒温インキュベータ(20℃と4℃)で、結晶化を行ったところ、0.05mm程度の大きさの結晶を作成することに成功したが、SPring-8にてX線回折実験を行ったところ回折能8.0Å程度と構造解析には不十分なデータしか得られなかった。更なる結晶の品質向上を目指し、溶液状態を制御による結晶の品質およびサイズを向上させる技術を開発した(Jpn.J.Appl.Phys 43,L79-L81(2004))。現在、本技術を用いて結晶化を行っている。更に、PEPCの立体構造に基づくアロステリック活性調節機構に関する論文1報と総説2報を報告した(Structure 10,1721-1730(2002),Arch.Biochem.Biophys.414,170-179(2003),Annual Review Plant Biol.(2004)in press.)。また、PEPCはリンゴ酸などの有機酸によって活性阻害されることが知られているが、生体内でそのリンゴ酸を生成する酵素NADP依存型リンゴ酸酵素の精製・結晶化にも取り組んだ。NADP-リンゴ酸酵素については、微結晶を得ており(0.1mm程度)、5.0Å分解能の回折能を示す結晶を得ている。
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Yamamoto, T.: "Crystallization and preliminary X-ray analysis of TBP-interacting protein from the typerthermophilic archaeon Thermococcus kodakaraensis strain KOD1"Acta Cryst.. S59. 372-374 (2003)
Yamamoto, T.:“来自嗜热古菌 Thermococcus kodakaraensis KOD1 菌株的 TBP 相互作用蛋白的结晶和初步 X 射线分析”Acta Cryst.. S59。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Inoue, T.: "The significance of the flexible loop in the azurin (Az-iso2) from the obligate methylotroph Methylomonas sp.strain J."J.Mol.Biology. 333. 117-124 (2003)
Inoue, T.:“来自专性甲基营养菌甲基单胞菌菌株 J 的天青蛋白 (Az-iso2) 中柔性环的重要性。”J.Mol.Biology。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Adachi, H.: "Laser Irradiated Growth of Protein Crystal."Jpn.J.Appl.Phys.. 42. 798-800 (2003)
Adachi, H.:“蛋白质晶体的激光照射生长”Jpn.J.Appl.Phys.. 42. 798-800 (2003)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Mizohata, E.: "Crystal Structure of Activated Ribulose-1,5-bisphosphate Carboxylase/Oxygenase from Green Alga Chlamydomonas reinhardtii Complexed with 2-Carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate globisporus"J.Mol.Biol.. 316. 679-691 (2002)
Mizohata,E.:“绿藻莱茵衣藻与 2-羧基阿拉伯糖醇-1,5-二磷酸球孢菌复合的活化核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶的晶体结构”J.Mol.Biol.. 316. 679-691
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
Y.Okano, et al.: "X-ray structure of Galdieria Rubisco complexed with one sulfate ion per active site"FEBS Lett.. 527. 33-36 (2002)
Y.Okano 等人:“每个活性位点与一个硫酸根离子复合的 Galdieria Rubisco 的 X 射线结构”FEBS Lett.. 527. 33-36 (2002)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
共 21 条
細菌のDivisomeによる細胞分裂制御メカニズムの解明
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批准号:24K01994
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.81万
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财政年份:2024
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负责人:松村 浩由
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依托单位:
Identification of structural factors to improve Rubisco
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批准号:23K18033
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.08万
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财政年份:2023
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负责人:松村 浩由
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依托单位:
藍藻ホスホリブロキナーゼのX線構造解析による反応機構と活性制御機構の解明
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批准号:18770087
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2006
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负责人:松村 浩由
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依托单位:
超好熱始原菌由来転写関連因子TIPの転写調節機構解明
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批准号:13014213
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.02万
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财政年份:2001
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负责人:松村 浩由
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依托单位:
海外基金