Ion transporting mechanism of V-type Na+-ATPase from Enterococcus hirae

海拉肠球菌V型Na-ATP酶的离子转运机制

• 批准号: 18770122
• 负责人: MURATA Takeshi
• 金额: $ 2.58万
• 依托单位: Kyoto University (2007-2008)The Institute of Physical and Chemical Research (2006)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18770122/
• 关键词: V-ATPase; X線結晶構造解析; ポンプ; ナトリウム; モーター; 複合体; 膜タンパク質; Enterococcus hirae

研究代表者らは腸内連鎖球菌に存在するNa+輸送性V 型ATPase の分子生物学的・生化学的・構造生物学的研究を展開し、膜タンパク質部分であるNtpKリングのX線結晶構造解析に成功していた。本研究では本酵素のイオン輸送機構の解明を目的に、Li+結合型及び阻害剤DCCD結合型のNtpKリングのX線結晶構造を明らかにした。これらの構造と生化学的解析から、本酵素のイオン結合/解離のメカニズムが明らかになった。

The representative of the study was the existence of Na+ delivery V-type ATPase molecular biology in the biochemistry of biochemistry. The development of the biological research and the analysis of the X-ray structure of the membrane structure of some of the transmission V-type ATPase molecular biology were successfully analyzed. In this study, the enzyme transmission mechanism was used to explain the purpose, the combination of Li+ and the combination of DCCD and the combination of NtpK and NtpK to establish the X-ray crystal of the device. The purpose of this study is to establish the analytical method of biochemistry, and to combine

项目成果

V-ATPaseの新しい機能とその構造からみえてきたメカニズム

V-ATP酶的新功能及其结构揭示的机制

• 发表时间: 2007
• 期刊: 蛋白質核酸酵素 52
• 作者: 村田 武士;山登 一郎;柿沼 喜己;横山 謙
• 通讯作者: 横山 謙

蛋白質核酸酵素 Vol. 52 No. 4, ,(V-ATPase の新しい機能とその構造からみえてきたメカニズム)

蛋白质核酸酶 Vol. 52 No. 4,（V-ATP酶的新功能及其结构揭示的机制）

• 发表时间: 2007
• 作者: 村田武士;山登一郎;柿沼喜己;横山謙
• 通讯作者: 横山謙

V型Na^+-ATPaseの膜内在性ローターリングの構造 : 結晶構造から見えてきた回転モーターのイオン透過機構

V型Na^+-ATPase整体膜转子环结构：从晶体结构揭示旋转电机的离子渗透机制

• 发表时间: 2006
• 期刊: 生物物理 46
• 作者: 村田武士;山登一郎;柿沼喜己
• 通讯作者: 柿沼喜己

Estimation of ligand binding free energies of F-ATPaseby using molecular dynamics/free energy calculation

使用分子动力学/自由能计算估计 F-ATP 酶的配体结合自由能

• 发表时间: 2008
• 期刊: J. Comput. Chem. Jpn 7
• 作者: Atsushi Suenaga;Osamu Umezu;Tadashi Ando;Ichiro Yamato;Takeshi Murata;Makoto Taiji;Takeshi Murata;Misaki Yamamoto;Atsushi Suenaka
• 通讯作者: Atsushi Suenaka

Structure of Li+ bound rotor ring of the V-type Na+-ATPase from Enterococcus hirae

海拉肠球菌 V 型 Na -ATP 酶的锂结合转子环的结构

• 发表时间: 2006
• 作者: 村田武士;山登一郎;柿沼喜己;Takeshi Murata;村田 武士;Takeshi Murata;村田武士;Takeshi Murata
• 通讯作者: Takeshi Murata