転位活性を持つビフィズス菌挿入配列の単離と変異導入系の構築

具有转座活性的双歧杆菌插入序列的分离和诱变系统的构建

• 批准号: 18780050
• 负责人: 吹谷 智
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18780050/
• 关键词: ビフィズス菌; 挿入配列; 転位; 変異導入

平成19年度はビフィズス菌からの挿入配列の単離および単離された挿入配列の詳細な解析を行った.1.新規挿入配列様因子TLS16の解析昨年度同定されたBifidobacterium longum BK28株由来の挿入配列様因子TLS16について塩基配列の解析および各種ビフィズス菌における保存性について解析を行った.TLS16は1.59kbpの挿入配列であり,その内部には転位に関与するタンパク質であるトランスポゼースをコードする単一の遺伝子が存在していた.アミノ酸レベルの相同性解析,および因子末端に存在する特徴的なステム・ループ構造などの特徴から,TLS16は挿入配列IS605ファミリーに属する因子と考えられた.またサザンハイブリダイゼーション解析により,TLS16はB.longum,B. breve,B.adolescentis,B.gallicumの基準株にそのホモログが保存されている事を明らかにした.2.転位活性を持つ挿入配列様因子TLS143の解析咋年度構築した転位因子のスクリーニング系を用いて,B.longum 105-A株を用いて転位活性を持つ因子を探索した.その結果,1.43kbpの長さの因子がスクリーニングベクターに挿入されていたため,本因子をTLS143と命名した.TLS143は末端に逆方向反復配列を持つ典型的なIS因子であり,その相同性からからIS3ファミリーに属する因子であると考えられた.1.と同様に各種ビフィズス菌における保存性を調べたところ,TLS16に比べて多くのビフィズス菌種壕存在する普遍性の高い因子であることが明らかになった.ビフィズス菌の転位因子の研究はほとんど行われていなかったが,本研究により二つの因子が同定された.特に,TLS143は転位活性を持つことが証明されたビフィズス菌由来の初めての因子であり,今後更なる応用が期待される.

1. Analysis of the new entry alignment factor TLS 16 was determined last year. Analysis of the origin of the entry alignment factor TLS16 was determined last year. Analysis of the origin of the entry alignment factor TLS16 was determined last year. Analysis of the base alignment of the entry alignment factor TLS 16 was determined last year. Analysis of the preservation of the entry alignment factor TLS16 was determined last year. The internal relationship between the two sides of the border is not simple. TLS16 is assigned to IS605, and the identity analysis of the acid sequence, the existence of the characteristic at the end of the factor, and the structure of the characteristic at the end of the factor. TLS16 B.longum, B. longum,B.longum, breve,B. indolescentis,B.gallicum, and B.longum 105-A strain. As a result, the length factor of 1.43 kbp is called TLS143. The TLS143 is repeatedly arranged in the opposite direction to the terminal. The typical IS factor is called IS3. The identity factor is called IS 3. The identity factor is called IS 1. The identity factor is called IS 1. The identity factor is called IS 143. TLS16 has a high prevalence factor for the presence of multiple species. A study on the position factors of bacteria was carried out in this paper. In particular,TLS143 has been shown to be active in the first place and expected to be used in the future.

项目成果

Bifidobacterium longum内在性プラスミドからの挿入配列の同定と塩基配列解析

长双歧杆菌内源质粒插入序列的鉴定和核苷酸序列分析

• 发表时间: 2007
• 作者: 吹谷 智;杉山智彦;加納康正;横田篤
• 通讯作者: 横田篤

ランダム変異導入系構築に向けたビフィズス菌からのトランスポゾン様因子の同定と解析

双歧杆菌转座子样因子的鉴定与分析及其构建随机突变导入系统

• 发表时间: 2007
• 作者: 吹谷 智;杉山智彦;加納康正;横田篤
• 通讯作者: 横田篤

Identification and characterization of a transposon-like sequence in a cryptic plasmid from Bifidobacterium longum

长双歧杆菌隐秘质粒中转座子样序列的鉴定和表征

• 发表时间: 2007
• 作者: Satoru Fukiya;Tomohiko Sugiyama;Yasunobu Kano and Atsushi Yokota
• 通讯作者: Yasunobu Kano and Atsushi Yokota

ビフィズス菌からの転位能をもつ挿入配列の単離と同定

双歧杆菌转座插入序列的分离和鉴定

• 发表时间: 2008
• 作者: 小林諒子;吹谷 智;加納康正;横田篤
• 通讯作者: 横田篤

ビフィズス菌Bifidobacterium longum内在性プラスミドからの挿入配列の同定と塩基配列解析

长双歧杆菌内源质粒插入序列的鉴定和核苷酸序列分析

• 发表时间: 2007
• 作者: 吹谷 智;杉山智彦;加納康正;横田篤
• 通讯作者: 横田篤