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黄色ブドウ球菌のペプチドグリカン合成のポストゲノム解析と新規抗菌薬への応用研究

金黄色葡萄球菌肽聚糖合成的后基因组分析及其在新型抗菌药物中的应用

基本信息

批准号：
18790070
负责人：
西田智
金额：
$ 2.24万
依托单位：
Musashino University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18790070/
关键词：
感染症ゲノム抗生物質細菌蛋白質

项目摘要

本研究では免疫力が低下した人への感染症の原因菌である黄色ブドウ球菌について、増殖に必須なペプチドグリカン合成酵素の解析を目的とする。次に、新しい抗菌剤の開発を試みることを目的とする。まず黄色ブドウ球菌のペプチドグリカン合成酵素の活性に必要な部位(アミノ酸残基)を構造情報から推測し、遺伝学的・生化学的実験により検証する。更に、ペプチドグリカン合成酵素の構造情報と遺伝学・生化学的解析結果を基にシミュレーションを行い、抗菌作用を有する物質の基礎となる情報を得る。黄色ブドウ球菌のペプチドグリカンの合成では、MurAとMurBによりNアセチルムラミン酸骨格が合成されMurC, MurD, MurE, MurF, DdlAによりアミノ酸が順次付加されて構造単位が生成し、細胞表層で連結される。MurCの解析では、既にインフルエンザ菌MurCと基質の複合体の結晶構造が解析されているので、そのデータを基にホモロジーモデリングを行った。基質との相互作用が強く示唆されたアミノ酸残基について変異遺伝子及び変異タンパク質の発現ベクターを構築した。変異遺伝子による遺伝学的解析を行うとともに、変異タンパク質の精製とその生化学的解析を行った。今後DdlA, MurDについても活性に必須なアミノ酸残基を順次明らかにしていく必要が有る。また、標的酵素の構造情報と低分子化合物の構造情報をもとにドッキングシミュレーションを行う必要が有る。阻害活性の予測が上位の化合物については実験系において酵素活性の阻害を評価する。既に酵素活性に必須なアミノ酸残基を7つ同定できているMurBについては、MurBの結晶構造解析が既に行われてPDBデータベースに登録されているので、その立体構造情報を基にドッキングシュミレーションによる化合物のin silicoスクリーニングを行っている。

In this study, we studied the cause of infection in people with low immunity. The bacteria that caused the infection, the bacteria, the bacteria, the bacteria, Secondary and new antimicrobial agents will be used for the purpose of anti-bacterial treatment. The activity of the synthetic enzyme was detected in the essential part (acid residue) of the synthetic enzyme, the biochemistry of the biosynthetic enzyme. The results of biochemistry analysis showed that there were significant differences in biochemistry, antibacterial activity and antimicrobial activity. The synthesis of MurC, MurD, MurE, MurF, DdlA, acid, acid MurC was used to analyze the DNA sequence of the bacteria MurC gene. The results showed that the gene was isolated from the bacteria. There is a strong indication of the interaction between acid residues, acid residues, acid residues and acid residues. The analysis of biochemistry is based on the analysis of biochemistry. In the future, the activity of DdlA and MurD must be determined by acid residue analysis. Enzymes, enzymes, low molecular weight compounds, low molecular weight compounds. The inhibitory activity is superior to the epistatic compound, the enzyme activity, the enzyme activity, the epistatic compound, the enzyme activity. The activity of the enzyme must be determined by the homology of acid residues 7, MurB, MurB, and MurB analysis. Both PDB and stereotaxic compounds must be identified, and the compounds must be sequenced.