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Development of reaction prediction system for environmental chemicals and secondary metabolites

Development of reaction prediction system for environmental chemicals and secondary metabolites
环境化学物质及次生代谢物反应预测系统开发
批准号:
18681033
负责人:
HATTORI Masahiro
金额:
$8.07万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2008

项目摘要

项目成果

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英文摘要
本研究では、代謝反応パスウェイのうち未解明のまま残されている部分、すなわち、薬物や環境因子などの細胞にとって通常外来物質と見られる化合物の代謝反応経路、および、植物の二次代謝産物の生合成経路などについて、代謝反応に関するケミカル情報を的確に表現する手法の開発、それら新しい知識をデータベースとして体系化する作業とデータの計算機的利用法の開発、酵素反応データに基づいた代謝経路の予測法の開発を行った。
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会议论文
E-zyme : finding enzyme orthologues from the chemical transformation pattern of substrate-product pairs
E-zyme:从底物-产物对的化学转化模式中寻找酶的直系同源物
DOI: --
发表时间: 2009
期刊: Bioinformatics (in press)
影响因子: --
作者: [Yamanishi, Y., Hattori, M., Kotera, M., Goto, S., and Kanehisa, M.]
通讯作者: M.
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: Journal of Pesticide Science 31 (3)
影响因子: --
作者: [Kadowaki, T., Wheelock, C.E., Hattori, M., Goto, S., Kanehisa, M.]
通讯作者: M.
Reaction graph kernels for discovering missing enzymes in the plant secondary metabolism
用于发现植物次生代谢中缺失酶的反应图内核
DOI: --
发表时间: 2007
期刊: NIPS Workshop on Machine Learning in Computational Biology 2007
影响因子: --
作者: [Saigo, H., Hattori, M., and Tsuda, K.]
通讯作者: K.
未知の酵素反応予測に向けた一般化反応パターンの開発
开发用于预测未知酶反应的通用反应模式
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [清水祐吾, 服部正泰, 五斗進, 金久實]
通讯作者: 金久實
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