Biosyntheses and molecular functions of novel biofactors, D-amino acids : from microorganisms to mammals

新型生物因子 D-氨基酸的生物合成和分子功能：从微生物到哺乳动物

• 批准号: 19380059
• 负责人: YOSHIMURA Tohru
• 金额: $ 12.65万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19380059/
• 关键词: D-アミノ酸; D-セリンデヒドラターゼ; D-セリン定量; ピリドキサルリン酸; スクレイピー; 細胞性粘菌; Saccharomyces cerevisiae; Escherichia coli; D-セリン; セリンラセマーゼ; カイコ; 出芽酵母

In this study, we found a novel D-serine dehydratase in Saccharomyces cerevisiae, and studied its properties. With this enzyme exhibiting high substrate specificity for D-serine, we constructed a novel D-serine assay system. We examined the relationship between the concentration of D-amino acids in the various organs of a scrapy-infected hamster and the progress in the disease. We also studied the D-serine metabolism in a slime cellular mold, Dictyostellium discoidium, to understand the role of D-serine in development, and found that the cell contains serine racemase catalyzing D-serine synthesis, and D-serine dehydratase and D-amino acid oxidase catalyzing D-serine degradation. In this study, we also examine the function of E.coli YggS, a homolog of the unknown mammalian protein, PROSC, which exhibits the similarity in the primary structure with the bacterial alanine racemase.

本研究在酿酒酵母中发现了一种新的D-丝氨酸脱氢酶，并对其性质进行了研究。利用该酶对D-丝氨酸的高底物特异性，我们构建了一种新的D-丝氨酸检测体系。我们研究了D-氨基酸的浓度之间的关系，在一个擦伤感染仓鼠的各个器官和疾病的进展。为了了解D-丝氨酸在发育过程中的作用，我们还研究了盘基网柄菌（Dictyostellium discoidium）中D-丝氨酸的代谢，发现盘基网柄菌细胞中含有催化D-丝氨酸合成的丝氨酸消旋酶、催化D-丝氨酸降解的D-丝氨酸脱氢酶和D-氨基酸氧化酶。在这项研究中，我们还研究了大肠杆菌YggS的功能，未知的哺乳动物蛋白，PROSC，表现出在一级结构与细菌丙氨酸消旋酶的相似性的同源物。

项目成果

真核生物型D-セリンデヒドラターゼの触媒機構

真核D-丝氨酸脱水酶的催化机制

• 发表时间: 2008
• 作者: 伊藤智和

D-アミノ酸測定法

D-氨基酸测定方法

• 发表时间: 2009

Eukaryotic D-serine dehydratase from Saccharomyces cerevisiae

来自酿酒酵母的真核 D-丝氨酸脱水酶

• 发表时间: 2009
• 作者: 岡本 紘一;細見 昭;竹川 薫;大熊盛也;Tohru Yoshimura
• 通讯作者: Tohru Yoshimura

The Implication of YggT of Escherichia coli in Osmotic Regulation

• DOI: 10.1271/bbb.90558
• 发表时间: 2009-12-01
• 期刊: BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY
• 影响因子: 1.6
• 作者: Ito, Tomokazu;Uozumi, Nobuyuki;Yoshimura, Tohru
• 通讯作者: Yoshimura, Tohru

d‐Amino acids in the brain: structure and function of pyridoxal phosphate‐dependent amino acid racemases

大脑中的 d-氨基酸：磷酸吡哆醛依赖性氨基酸消旋酶的结构和功能

• DOI: 10.1111/j.1742-4658.2008.06516.x
• 发表时间: 2008
• 期刊: The FEBS Journal
• 作者: T. Yoshimura;M. Goto
• 通讯作者: M. Goto