课题基金 / 基金详情

The new method to identify small molecules binding proteins by usingmutants and genome sequences

The new method to identify small molecules binding proteins by usingmutants and genome sequences
利用突变体和基因组序列识别小分子结合蛋白的新方法
批准号:
19380066
负责人:
菅原 二三男
金额:
$12.73万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2009

项目摘要

项目成果

菅原 二三男的其他基金

相似基金

相关文献

中文摘要
翻译
本研究旨在鉴定利用基因突变果蝇及CPT建立新药感受性评价方法的作用新的体内靶蛋白,采用T7噬菌体展示法结合晶体分离摆微天平(QCM)装置鉴定CPT-20-B连接肽(NSASRGGSQRGRGEH)。该肽测序显示了每个阵列以及人HshnRNP A1和黑腹果蝇DmHrb 87 F的同源性。CPT来自使用HshnRNP A1的HeLa细胞可熔化图片的珠下拉检查。CPT使HshnRNP A1-GST结合改变蛋白质,进行QCM相互作用分析,为HshnRNP A1,解离常数为82.7 nM。微生物敏感性试验结果表明,通过基因缺失的果蝇(Drosophila melanogaster),两株Hrb 87 FKG 02089和DmHrb 87 F基因突变株Hrb 87 FBG 02743对CPT的感受性高于野生株。拓扑异构酶I的作用是消除质粒DNA的超螺旋。在CPT和HshnRNP A1存在下观察到这种拓扑变化。CPT阻碍了所报告的topo I再生。此外,hnRNP A1也同样阻碍了拓扑I的再生。此外,CPT在二者共同存在下均增强了对HshnRNPA 1的topo I活性抑制,将上述结果与CPT结合,提出了HshnRNPA 1或DmHrb 87 F调节topo I激活的可能性。
英文摘要
The present study aimed at the identification of the action new and in vivo target protein of the establishment of the new medicine receptivity evaluation method that used gene mutation Drosophila melanogaster and CPT that used it.CPT-20-B connecting peptide (NSASRGGSQRGRGEH) is identified by using the T7 phage display method with crystal departure pendulum microbalance (QCM) device. This peptide sequencing showed each array and the homology of human HshnRNP A1 and Drosophila melanogaster DmHrb87F. CPT united from the bead pull-down examination that used HeLa cell meltable picture with HshnRNP A1. CPT made HshnRNP A1-GST united changing protein, did the QCM interaction analysis, and was HshnRNP A1 and was dissociation constant 82.7 nM.As a result of the microbial sensitivity test, by gene loss Drosophila melanogaster, two Hrb87FKG02089 and Hrb87FBG02743 that was the DmHrb87F gene mutant showed CPT high receptivity compared with the wild strain. Topo I has working that cancels a super-coil of plasmid DNA. This topology change was observed under CPT and the HshnRNP A1 existence. CPT obstructed the topo I revitalization as reported. Moreover, hnRNP A1 also similarly obstructed the topo I revitalization. In addition, CPT has improved the topo I active inhibition to HshnRNP A1 under both existence.HshnRNP A1 or DmHrb87F united from the above-mentioned result with CPT, and the possibility of adjusting the topo I revitalization was suggested.
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
固相合成用樹脂を利用した結合タンパク質探索
使用固相合成树脂搜索结合蛋白
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [榎本好宏, 他]
通讯作者: 他
Identification of macrolide antibiotic-binding Human_p8 protein.
大环内酯类抗生素结合 Human_p8 蛋白的鉴定。
DOI: --
发表时间: 2008
期刊: J Antibiot (Tokyo) 61(5)
影响因子: --
作者: [Morimura T, Hashiba M, Kameda H, Takami M, Takahama H, Ohshige M, Sugawara F.]
通讯作者: Sugawara F.
The inhibitory action of SQDG (sulfoquinovosyl diacylglycerol) from spinach on Cdtl-geminin interaction.
菠菜中的 SQDG(磺基喹诺酰基二酰基甘油)对 Cdtl-geminin 相互作用的抑制作用。
DOI: --
发表时间: 2008
期刊: Biochimie 90
影响因子: --
作者: [Mizushina Y, Takeuchi T, Hada T, Maeda N, Sugawara F, Yoshida H, Fujita M.]
通讯作者: Fujita M.
海洋天然物SQAGによるDNA polymerase lambdaの阻害様式の解明
阐明海洋天然产物 SQAG 对 DNA 聚合酶 lambda 的抑制模式
DOI: --
发表时间: 2009
期刊:
影响因子: --
作者: [高草木香織, 太田慶祐, 高草木洋一, 青木仁子, 菅原二三男, 坂口謙吾]
通讯作者: 坂口謙吾
共 121 条
    抗ウイルス抗体を産生する新規抗ウイルス剤EdAPの研究
    • 批准号:
      15K07419
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $3.16万
    • 财政年份:
      2015
    • 负责人:
      菅原 二三男
    • 依托单位:
    ディスプレイクローニングと計算科学による結合タンパク質の戦略的決定
    • 批准号:
      15651101
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额:
      $2.18万
    • 财政年份:
      2003
    • 负责人:
      菅原 二三男
    • 依托单位:
    植物病原性物質マルホルミン類の作用機構
    雑草を宿主とする植物病菌のより生産される新植物制御活性物資に関する研究
    海外基金