Bioinformatics using non-metric multidimensional scaling method

使用非度量多维标度方法的生物信息学

• 批准号: 19500254
• 负责人: TAGUCHI Yoshihiro
• 金额: $ 1.66万
• 依托单位: Chuo University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19500254/
• 关键词: 非計量多次元尺度構成法; ゲノム科学; マイクロアレイ; Barcode of Life; DNA copy number異状; プロテオミクス; シアノバクテリア; 概日周期; DNA copy number 異常; 分裂酵母; 細胞分裂周期; DNA copy number variation

近年、遺伝子に関する網羅的な実験結果が広く公開される様になってきた。本研究では数千個の遺伝子に対して行われた遺伝子発現、蛋白質発現、塩基配列、アミノ酸配列などのデータを非計量多次元尺度構成法を用いて解析して、遺伝子の機能などを解明する研究を行った。この結果、この様な様々なデータに対して、非計量多次元尺度構成法を用いた研究が非常に有効であることを確認した。

In recent years, the results of the network have been published. In this study, we studied the gene discovery, protein discovery, gene alignment and gene function of thousands of genes by using non-metric multi-dimensional method. The results of this research are very important to us.

项目成果

Application of amino acid occurrence for discriminating different folding types of globular protein

氨基酸出现率在区分球状蛋白不同折叠类型中的应用

• 发表时间: 2007
• 期刊: BMC Bioinformatics 8
• 作者: Y-h. Taguchi;MM Gromiha
• 通讯作者: MM Gromiha

Nonmetric distances for Barcode of Life

生命条形码的非度量距离

• 发表时间: 2007
• 期刊: IPSJ SIG Technical Report 2007[60]
• 作者: Hisamitsu Akiba;Y-h.Taguchi
• 通讯作者: Y-h.Taguchi

Estimation of cell cycle regulated genes using anchor genes and non-metric multidimensional scaling

使用锚基因和非度量多维尺度估计细胞周期调节基因

• 发表时间: 2008
• 作者: Hisamitsu Akiba;Y-h.Taguchi;Y-h. Taguchi;Y-h. Taguchi
• 通讯作者: Y-h. Taguchi

非計量多次元尺度構成法を用いた生体生命情報解析

使用非度量多维标度方法进行生物信息分析

• 发表时间: 2007
• 作者: Fumiaki Kataoka;Y-h. Taguchi;田口善弘
• 通讯作者: 田口善弘

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科学平装本阅读

• 发表时间: 2007
• 作者: Kotani;Motoko;M.Kotani;M.Kotani;小谷元子
• 通讯作者: 小谷元子