Origin and Evolution of a Novel Chimeric Gene, PIPSL

新型嵌合基因 PIPSL 的起源和进化

• 批准号: 19570224
• 负责人: OHSHIMA Kazuhiko
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Nagahama Institute of Bio-Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19570224/
• 关键词: PIPSL; 逆転写; 加速進化; LINE1; 霊長類; 人類集団; 多型; 分子進化

エキソンシャッフリングと遺伝子重複の連動から生じた興味深い遺伝子PIPSLを見出した。PIPSL配列の保存性には種特異性が見られ、特徴的な進化様式を経て現在に至ることが判明した。ヒトPIPSLの分子進化様式を探るために、世界11地域の人類集団(125人)のゲノムDNAを用いて多型解析を行った結果、人類の出アフリカ後に広まったと推測されるハプロタイプが明らかになった。これらは、キナーゼドメインの基質結合部位付近の非常に近接した2つの座位に非同義置換SNPを有する。派生型PIPSLの基質との結合能に影響を与えている可能性が考えられる。

The first step is to make sure that all the information in the file is correct. The preservation of PIPSL alignment, species-specificity, and evolution of characteristics have been identified. The molecular evolution of PIPSL was explored in 11 regions of the world (125 individuals). The nonsynonymous substitution SNP is present at the locus of the substrate binding site, which is very close to it. The binding energy of the matrix of the derivative PIPSL is influenced by the possibility of the formation of the matrix.

项目成果

A novel testis ubiquitin-binding protein gene arose by exon shuffling in hominoids

• DOI: 10.1101/gr.6252107
• 发表时间: 2007-08-01
• 期刊: GENOME RESEARCH
• 影响因子: 7
• 作者: Babushok, Daria V.;Ohshima, Kazuhiko;Kazazian, Haig H., Jr.
• 通讯作者: Kazazian, Haig H., Jr.

Origin and Evolution of a Novel Chimeric Gene, PIPSL

新型嵌合基因 PIPSL 的起源和进化

• 发表时间: 2008
• 作者: 五十嵐久美子;大島一彦(口頭);Kazuhiko Ohshima & Kumiko Igarashi
• 通讯作者: Kazuhiko Ohshima & Kumiko Igarashi

エキソン混成遺伝子PIPSLのヒト集団多型の特徴

外显子杂合基因PIPSL的人群多态性特征

• 发表时间: 2008
• 作者: 五十嵐久美子;大島一彦(口頭)
• 通讯作者: 大島一彦(口頭)

新規エキソン混成遺伝子の人類集団多型

新型外显子杂交基因的人群多态性

• 发表时间: 2007
• 作者: 大島一彦;五十嵐久美子;バブショクダリア;カザジアンヘイグ(口頭)
• 通讯作者: カザジアンヘイグ(口頭)

エキソン混成遺伝子PIPSLの発現解析

外显子杂合基因PIPSL的表达分析

• 发表时间: 2008
• 作者: 五十嵐久美子;橋本真美;大島一彦(ボスター)
• 通讯作者: 大島一彦(ボスター)